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Protein–RNA interactions for Protein: Q12455
SPE4, Spermine synthase, yeast
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300 aa
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
SPE4
Q12455
MAK32
YCR019W
1092 nt
6.92
□□□□□ -1.3
SPE4
Q12455
URH1
YDR400W
1023 nt
6.92
□□□□□ -1.3
SPE4
Q12455
YEL009C-A
YEL009C-A
408 nt
6.92
□□□□□ -1.3
SPE4
Q12455
GET4
YOR164C
939 nt
6.92
□□□□□ -1.3
SPE4
Q12455
MSB3
YNL293W
1902 nt
6.91
□□□□□ -1.3
SPE4
Q12455
KAE1
YKR038C
1161 nt
6.91
□□□□□ -1.3
SPE4
Q12455
SLA2
YNL243W
2907 nt
6.9
□□□□□ -1.3
SPE4
Q12455
TRS31
YDR472W
852 nt
6.9
□□□□□ -1.3
SPE4
Q12455
PIH1
YHR034C
1035 nt
6.9
□□□□□ -1.3
SPE4
Q12455
PPH22
YDL188C
1134 nt
6.89
□□□□□ -1.31
SPE4
Q12455
YOR300W
YOR300W
309 nt
6.89
□□□□□ -1.31
SPE4
Q12455
YPL067C
YPL067C
597 nt
6.89
□□□□□ -1.31
SPE4
Q12455
HOG1
YLR113W
1308 nt
6.89
□□□□□ -1.31
SPE4
Q12455
MAM3
YOL060C
2121 nt
6.89
□□□□□ -1.31
SPE4
Q12455
UME1
YPL139C
1383 nt
6.88
□□□□□ -1.31
SPE4
Q12455
YFL013W-A
YFL013W-A
804 nt
6.88
□□□□□ -1.31
SPE4
Q12455
TRR2
YHR106W
1029 nt
6.88
□□□□□ -1.31
SPE4
Q12455
REC107
YJR021C
945 nt
6.88
□□□□□ -1.31
SPE4
Q12455
SPG5
YMR191W
1122 nt
6.88
□□□□□ -1.31
SPE4
Q12455
NTG2
YOL043C
1143 nt
6.88
□□□□□ -1.31
SPE4
Q12455
RPL5
YPL131W
894 nt
6.88
□□□□□ -1.31
SPE4
Q12455
HAL5
YJL165C
2568 nt
6.88
□□□□□ -1.31
SPE4
Q12455
CIA1
YDR267C
993 nt
6.87
□□□□□ -1.31
SPE4
Q12455
CBR1
YIL043C
855 nt
6.87
□□□□□ -1.31
SPE4
Q12455
OPI8
YKR035C
642 nt
6.87
□□□□□ -1.31
SPE4
Q12455
BUD20
YLR074C
501 nt
6.87
□□□□□ -1.31
SPE4
Q12455
SNU71
YGR013W
1863 nt
6.87
□□□□□ -1.31
SPE4
Q12455
ICL2
YPR006C
1728 nt
6.87
□□□□□ -1.31
SPE4
Q12455
PEX31
YGR004W
1389 nt
6.86
□□□□□ -1.31
SPE4
Q12455
PDA1
YER178W
1263 nt
6.86
□□□□□ -1.31
SPE4
Q12455
PTC7
YHR076W
1032 nt
6.86
□□□□□ -1.31
SPE4
Q12455
RPL31B
YLR406C
342 nt
6.86
□□□□□ -1.31
SPE4
Q12455
YNR005C
YNR005C
405 nt
6.86
□□□□□ -1.31
SPE4
Q12455
VBA5
YKR105C
1749 nt
6.86
□□□□□ -1.31
SPE4
Q12455
DYS1
YHR068W
1164 nt
6.85
□□□□□ -1.31
SPE4
Q12455
PTH2
YBL057C
627 nt
6.85
□□□□□ -1.31
SPE4
Q12455
HTZ1
YOL012C
405 nt
6.85
□□□□□ -1.31
SPE4
Q12455
NAF1
YNL124W
1479 nt
6.85
□□□□□ -1.31
SPE4
Q12455
EDC3
YEL015W
1656 nt
6.84
□□□□□ -1.31
SPE4
Q12455
ECM38
YLR299W
1983 nt
6.84
□□□□□ -1.31
SPE4
Q12455
STF1
YDL130W-A
261 nt
6.84
□□□□□ -1.31
SPE4
Q12455
YDL177C
YDL177C
513 nt
6.84
□□□□□ -1.31
SPE4
Q12455
YIP4
YGL198W
708 nt
6.84
□□□□□ -1.31
SPE4
Q12455
PRS4
YBL068W
981 nt
6.84
□□□□□ -1.31
SPE4
Q12455
YNL165W
YNL165W
1221 nt
6.84
□□□□□ -1.31
SPE4
Q12455
YPQ1
YOL092W
927 nt
6.84
□□□□□ -1.31
SPE4
Q12455
snR30
snR30
606 nt
6.84
□□□□□ -1.31
SPE4
Q12455
FCY22
YER060W-A
1593 nt
6.83
□□□□□ -1.32
SPE4
Q12455
YMR034C
YMR034C
1305 nt
6.83
□□□□□ -1.32
SPE4
Q12455
HSP12
YFL014W
330 nt
6.83
□□□□□ -1.32
SPE4
Q12455
GCN3
YKR026C
918 nt
6.83
□□□□□ -1.32
SPE4
Q12455
REC114
YMR133W
1287 nt
6.83
□□□□□ -1.32
SPE4
Q12455
MBF1
YOR298C-A
456 nt
6.83
□□□□□ -1.32
SPE4
Q12455
CIT3
YPR001W
1461 nt
6.83
□□□□□ -1.32
SPE4
Q12455
BDF2
YDL070W
1917 nt
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□□□□□ -1.32
SPE4
Q12455
LCP5
YER127W
1074 nt
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□□□□□ -1.32
SPE4
Q12455
YSC83
YHR017W
1158 nt
6.82
□□□□□ -1.32
SPE4
Q12455
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YCL049C
939 nt
6.82
□□□□□ -1.32
SPE4
Q12455
ARP3
YJR065C
1350 nt
6.82
□□□□□ -1.32
SPE4
Q12455
GUT1
YHL032C
2130 nt
6.81
□□□□□ -1.32
SPE4
Q12455
CTF8
YHR191C
402 nt
6.81
□□□□□ -1.32
SPE4
Q12455
CYS3
YAL012W
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SPE4
Q12455
SUR7
YML052W
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6.81
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SPE4
Q12455
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YOR013W
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SPE4
Q12455
APE4
YHR113W
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□□□□□ -1.32
SPE4
Q12455
YHC3
YJL059W
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□□□□□ -1.32
SPE4
Q12455
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YJR107W
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6.8
□□□□□ -1.32
SPE4
Q12455
CUE4
YML101C
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6.8
□□□□□ -1.32
SPE4
Q12455
CST26
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□□□□□ -1.32
SPE4
Q12455
ADH5
YBR145W
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□□□□□ -1.32
SPE4
Q12455
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YLL058W
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□□□□□ -1.32
SPE4
Q12455
MRPS28
YDR337W
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6.79
□□□□□ -1.32
SPE4
Q12455
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YER055C
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6.79
□□□□□ -1.32
SPE4
Q12455
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YJL144W
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6.79
□□□□□ -1.32
SPE4
Q12455
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SPE4
Q12455
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Q0075
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SPE4
Q12455
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YGL102C
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SPE4
Q12455
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YML079W
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Q12455
SMX3
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SPE4
Q12455
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YOR330C
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□□□□□ -1.33
SPE4
Q12455
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tG(GCC)B
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SPE4
Q12455
SUF16
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□□□□□ -1.33
SPE4
Q12455
tG(GCC)D1
tG(GCC)D1
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□□□□□ -1.33
SPE4
Q12455
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tG(GCC)D2
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□□□□□ -1.33
SPE4
Q12455
tG(GCC)E
tG(GCC)E
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□□□□□ -1.33
SPE4
Q12455
SUF20
tG(GCC)F1
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SPE4
Q12455
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tG(GCC)F2
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□□□□□ -1.33
SPE4
Q12455
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tG(GCC)G1
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□□□□□ -1.33
SPE4
Q12455
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□□□□□ -1.33
SPE4
Q12455
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tG(GCC)J1
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□□□□□ -1.33
SPE4
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SUF23
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SPE4
Q12455
tG(GCC)M
tG(GCC)M
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□□□□□ -1.33
SPE4
Q12455
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tG(GCC)O1
71 nt
6.77
□□□□□ -1.33
SPE4
Q12455
SUF17
tG(GCC)O2
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6.77
□□□□□ -1.33
SPE4
Q12455
tG(GCC)P1
tG(GCC)P1
71 nt
6.77
□□□□□ -1.33
SPE4
Q12455
tG(GCC)P2
tG(GCC)P2
71 nt
6.77
□□□□□ -1.33
SPE4
Q12455
EDC2
YER035W
438 nt
6.77
□□□□□ -1.33
SPE4
Q12455
TOS6
YNL300W
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6.77
□□□□□ -1.33
SPE4
Q12455
YDR415C
YDR415C
1125 nt
6.76
□□□□□ -1.33
SPE4
Q12455
SHO1
YER118C
1104 nt
6.76
□□□□□ -1.33
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