Protein–RNA interactions for Protein: Q12346

YPR071W, Uncharacterized membrane protein YPR071W, yeastyeast

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPR071WQ12346 YRF1-7YPL283C 5580 nt6.67□□□□□ -1.34
YPR071WQ12346 VRP1YLR337C 2454 nt6.67□□□□□ -1.34
YPR071WQ12346 YGR210CYGR210C 1236 nt6.67□□□□□ -1.34
YPR071WQ12346 YIR020W-AYIR020W-A 243 nt6.67□□□□□ -1.34
YPR071WQ12346 NCE103YNL036W 666 nt6.67□□□□□ -1.34
YPR071WQ12346 HIS3YOR202W 663 nt6.67□□□□□ -1.34
YPR071WQ12346 MIF2YKL089W 1650 nt6.67□□□□□ -1.34
YPR071WQ12346 ALR1YOL130W 2580 nt6.66□□□□□ -1.34
YPR071WQ12346 CRN1YLR429W 1956 nt6.66□□□□□ -1.34
YPR071WQ12346 CHA1YCL064C 1083 nt6.66□□□□□ -1.34
YPR071WQ12346 SWM1YDR260C 513 nt6.66□□□□□ -1.34
YPR071WQ12346 YDR509WYDR509W 348 nt6.66□□□□□ -1.34
YPR071WQ12346 CDC11YJR076C 1248 nt6.66□□□□□ -1.34
YPR071WQ12346 YLL017WYLL017W 312 nt6.66□□□□□ -1.34
YPR071WQ12346 YPL014WYPL014W 1146 nt6.66□□□□□ -1.34
YPR071WQ12346 OAZ1YPL052W 879 nt6.66□□□□□ -1.34
YPR071WQ12346 ITR1YDR497C 1755 nt6.66□□□□□ -1.34
YPR071WQ12346 RSC2YLR357W 2670 nt6.66□□□□□ -1.34
YPR071WQ12346 ATP12YJL180C 978 nt6.65□□□□□ -1.34
YPR071WQ12346 MHO1YJR008W 1017 nt6.65□□□□□ -1.34
YPR071WQ12346 OAC1YKL120W 975 nt6.65□□□□□ -1.34
YPR071WQ12346 SNN1YNL086W 309 nt6.65□□□□□ -1.34
YPR071WQ12346 YPL264CYPL264C 1062 nt6.65□□□□□ -1.34
YPR071WQ12346 PRC1YMR297W 1599 nt6.65□□□□□ -1.35
YPR071WQ12346 YDL023CYDL023C 321 nt6.64□□□□□ -1.35
YPR071WQ12346 HRA1HRA1 564 nt6.64□□□□□ -1.35
YPR071WQ12346 PML1YLR016C 615 nt6.64□□□□□ -1.35
YPR071WQ12346 YOL035CYOL035C 303 nt6.64□□□□□ -1.35
YPR071WQ12346 YOL050CYOL050C 321 nt6.64□□□□□ -1.35
YPR071WQ12346 ISA2YPR067W 558 nt6.64□□□□□ -1.35
YPR071WQ12346 MFG1YDL233W 1377 nt6.64□□□□□ -1.35
YPR071WQ12346 NDE2YDL085W 1638 nt6.63□□□□□ -1.35
YPR071WQ12346 TMS1YDR105C 1422 nt6.63□□□□□ -1.35
YPR071WQ12346 NOP7YGR103W 1818 nt6.63□□□□□ -1.35
YPR071WQ12346 HGH1YGR187C 1185 nt6.63□□□□□ -1.35
YPR071WQ12346 YIL086CYIL086C 309 nt6.63□□□□□ -1.35
YPR071WQ12346 YIR035CYIR035C 765 nt6.63□□□□□ -1.35
YPR071WQ12346 XPT1YJR133W 630 nt6.63□□□□□ -1.35
YPR071WQ12346 HOG1YLR113W 1308 nt6.63□□□□□ -1.35
YPR071WQ12346 ATP10YLR393W 840 nt6.63□□□□□ -1.35
YPR071WQ12346 CTR3YLR411W 726 nt6.63□□□□□ -1.35
YPR071WQ12346 PRP46YPL151C 1356 nt6.63□□□□□ -1.35
YPR071WQ12346 GPA1YHR005C 1419 nt6.62□□□□□ -1.35
YPR071WQ12346 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt6.62□□□□□ -1.35
YPR071WQ12346 YKL018C-AYKL018C-A 300 nt6.62□□□□□ -1.35
YPR071WQ12346 SPE4YLR146C 903 nt6.62□□□□□ -1.35
YPR071WQ12346 YMR075C-AYMR075C-A 366 nt6.62□□□□□ -1.35
YPR071WQ12346 YOR041CYOR041C 432 nt6.62□□□□□ -1.35
YPR071WQ12346 VAM3YOR106W 852 nt6.62□□□□□ -1.35
YPR071WQ12346 GUF1YLR289W 1938 nt6.62□□□□□ -1.35
YPR071WQ12346 TGA1tA(UGC)A 73 nt6.61□□□□□ -1.35
YPR071WQ12346 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt6.61□□□□□ -1.35
YPR071WQ12346 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt6.61□□□□□ -1.35
YPR071WQ12346 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt6.61□□□□□ -1.35
YPR071WQ12346 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt6.61□□□□□ -1.35
YPR071WQ12346 CHS7YHR142W 951 nt6.61□□□□□ -1.35
YPR071WQ12346 YLR402WYLR402W 192 nt6.61□□□□□ -1.35
YPR071WQ12346 DSC2YOL073C 969 nt6.61□□□□□ -1.35
YPR071WQ12346 YPL108WYPL108W 507 nt6.61□□□□□ -1.35
YPR071WQ12346 BEM1YBR200W 1656 nt6.61□□□□□ -1.35
YPR071WQ12346 HMLALPHA1YCL066W 528 nt6.6□□□□□ -1.35
YPR071WQ12346 MATALPHA1YCR040W 528 nt6.6□□□□□ -1.35
YPR071WQ12346 YJL009WYJL009W 327 nt6.6□□□□□ -1.35
YPR071WQ12346 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt6.6□□□□□ -1.35
YPR071WQ12346 TOP3YLR234W 1971 nt6.59□□□□□ -1.35
YPR071WQ12346 ARO3YDR035W 1113 nt6.59□□□□□ -1.35
YPR071WQ12346 YGL101WYGL101W 648 nt6.59□□□□□ -1.35
YPR071WQ12346 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt6.59□□□□□ -1.35
YPR071WQ12346 YMR166CYMR166C 1107 nt6.59□□□□□ -1.35
YPR071WQ12346 OLA1YBR025C 1185 nt6.59□□□□□ -1.35
YPR071WQ12346 FCY1YPR062W 477 nt6.59□□□□□ -1.35
YPR071WQ12346 PEX34YCL056C 435 nt6.59□□□□□ -1.35
YPR071WQ12346 YFR006WYFR006W 1608 nt6.58□□□□□ -1.36
YPR071WQ12346 DIN7YDR263C 1293 nt6.58□□□□□ -1.36
YPR071WQ12346 ERV14YGL054C 417 nt6.58□□□□□ -1.36
YPR071WQ12346 SKI8YGL213C 1194 nt6.58□□□□□ -1.36
YPR071WQ12346 COX3Q0275 810 nt6.58□□□□□ -1.36
YPR071WQ12346 YUR1YJL139C 1287 nt6.58□□□□□ -1.36
YPR071WQ12346 MET22YOL064C 1074 nt6.58□□□□□ -1.36
YPR071WQ12346 SSP2YOR242C 1116 nt6.58□□□□□ -1.36
YPR071WQ12346 UBA3YPR066W 900 nt6.58□□□□□ -1.36
YPR071WQ12346 SMC5YOL034W 3282 nt6.58□□□□□ -1.36
YPR071WQ12346 CRF1YDR223W 1404 nt6.58□□□□□ -1.36
YPR071WQ12346 ATG7YHR171W 1893 nt6.58□□□□□ -1.36
YPR071WQ12346 NMT1YLR195C 1368 nt6.57□□□□□ -1.36
YPR071WQ12346 CLB5YPR120C 1308 nt6.57□□□□□ -1.36
YPR071WQ12346 TIF3YPR163C 1311 nt6.57□□□□□ -1.36
YPR071WQ12346 GGC1YDL198C 903 nt6.57□□□□□ -1.36
YPR071WQ12346 YDR541CYDR541C 1035 nt6.57□□□□□ -1.36
YPR071WQ12346 EDC2YER035W 438 nt6.57□□□□□ -1.36
YPR071WQ12346 YHR022CYHR022C 771 nt6.57□□□□□ -1.36
YPR071WQ12346 YJR149WYJR149W 1215 nt6.57□□□□□ -1.36
YPR071WQ12346 UBC12YLR306W 567 nt6.57□□□□□ -1.36
YPR071WQ12346 BUB2YMR055C 921 nt6.57□□□□□ -1.36
YPR071WQ12346 YNL140CYNL140C 570 nt6.57□□□□□ -1.36
YPR071WQ12346 LSP1YPL004C 1026 nt6.57□□□□□ -1.36
YPR071WQ12346 WSC4YHL028W 1818 nt6.57□□□□□ -1.36
YPR071WQ12346 VHS1YDR247W 1386 nt6.57□□□□□ -1.36
YPR071WQ12346 HXT9YJL219W 1704 nt6.56□□□□□ -1.36
YPR071WQ12346 YDL157CYDL157C 357 nt6.56□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 74.1 ms