Protein–RNA interactions for Protein: Q12129

NMD4, Nonsense-mediated decay protein 4, yeastyeast

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NMD4Q12129 PHO85YPL031C 918 nt6.71□□□□□ -1.34
NMD4Q12129 snR30snR30 606 nt6.71□□□□□ -1.34
NMD4Q12129 YCR041WYCR041W 333 nt6.7□□□□□ -1.34
NMD4Q12129 OST3YOR085W 1053 nt6.7□□□□□ -1.34
NMD4Q12129 YPR127WYPR127W 1038 nt6.7□□□□□ -1.34
NMD4Q12129 CMK2YOL016C 1344 nt6.7□□□□□ -1.34
NMD4Q12129 EEB1YPL095C 1371 nt6.69□□□□□ -1.34
NMD4Q12129 NAF1YNL124W 1479 nt6.69□□□□□ -1.34
NMD4Q12129 CIA1YDR267C 993 nt6.69□□□□□ -1.34
NMD4Q12129 PDA1YER178W 1263 nt6.69□□□□□ -1.34
NMD4Q12129 SNF4YGL115W 969 nt6.69□□□□□ -1.34
NMD4Q12129 SMC5YOL034W 3282 nt6.68□□□□□ -1.34
NMD4Q12129 YCR049CYCR049C 447 nt6.68□□□□□ -1.34
NMD4Q12129 YLR162WYLR162W 357 nt6.68□□□□□ -1.34
NMD4Q12129 SWP1YMR149W 861 nt6.68□□□□□ -1.34
NMD4Q12129 BRN1YBL097W 2265 nt6.67□□□□□ -1.34
NMD4Q12129 YOR389WYOR389W 1875 nt6.67□□□□□ -1.34
NMD4Q12129 ATP4YPL078C 735 nt6.67□□□□□ -1.34
NMD4Q12129 SSC1YJR045C 1965 nt6.67□□□□□ -1.34
NMD4Q12129 YPL247CYPL247C 1572 nt6.66□□□□□ -1.34
NMD4Q12129 ORM1YGR038W 669 nt6.66□□□□□ -1.34
NMD4Q12129 AIM2YAL049C 741 nt6.66□□□□□ -1.34
NMD4Q12129 HTZ1YOL012C 405 nt6.66□□□□□ -1.34
NMD4Q12129 ICL2YPR006C 1728 nt6.66□□□□□ -1.34
NMD4Q12129 HOG1YLR113W 1308 nt6.66□□□□□ -1.34
NMD4Q12129 DLD1YDL174C 1764 nt6.65□□□□□ -1.34
NMD4Q12129 TRR1YDR353W 960 nt6.65□□□□□ -1.34
NMD4Q12129 HPT1YDR399W 666 nt6.65□□□□□ -1.34
NMD4Q12129 YNR005CYNR005C 405 nt6.65□□□□□ -1.34
NMD4Q12129 YCL049CYCL049C 939 nt6.65□□□□□ -1.34
NMD4Q12129 CTA1YDR256C 1548 nt6.65□□□□□ -1.35
NMD4Q12129 CHS5YLR330W 2016 nt6.64□□□□□ -1.35
NMD4Q12129 YAL045CYAL045C 309 nt6.64□□□□□ -1.35
NMD4Q12129 YLR112WYLR112W 420 nt6.64□□□□□ -1.35
NMD4Q12129 MIX17YMR002W 471 nt6.64□□□□□ -1.35
NMD4Q12129 COS10YNR075W 1125 nt6.64□□□□□ -1.35
NMD4Q12129 IRC5YFR038W 2562 nt6.64□□□□□ -1.35
NMD4Q12129 SRF1YDL133W 1314 nt6.64□□□□□ -1.35
NMD4Q12129 NPL6YMR091C 1308 nt6.64□□□□□ -1.35
NMD4Q12129 TDP1YBR223C 1635 nt6.64□□□□□ -1.35
NMD4Q12129 YOL099CYOL099C 492 nt6.63□□□□□ -1.35
NMD4Q12129 EDC3YEL015W 1656 nt6.62□□□□□ -1.35
NMD4Q12129 SPS22YCL048W 1392 nt6.62□□□□□ -1.35
NMD4Q12129 NTG2YOL043C 1143 nt6.62□□□□□ -1.35
NMD4Q12129 HST2YPL015C 1074 nt6.62□□□□□ -1.35
NMD4Q12129 HGH1YGR187C 1185 nt6.61□□□□□ -1.35
NMD4Q12129 URA1YKL216W 945 nt6.61□□□□□ -1.35
NMD4Q12129 SML1YML058W 315 nt6.61□□□□□ -1.35
NMD4Q12129 ZIM17YNL310C 525 nt6.61□□□□□ -1.35
NMD4Q12129 HEL1YKR017C 1656 nt6.61□□□□□ -1.35
NMD4Q12129 APE4YHR113W 1473 nt6.6□□□□□ -1.35
NMD4Q12129 TIF2YJL138C 1188 nt6.6□□□□□ -1.35
NMD4Q12129 TIF1YKR059W 1188 nt6.6□□□□□ -1.35
NMD4Q12129 MCP1YOR228C 909 nt6.6□□□□□ -1.35
NMD4Q12129 LGE1YPL055C 999 nt6.6□□□□□ -1.35
NMD4Q12129 SNT309YPR101W 528 nt6.6□□□□□ -1.35
NMD4Q12129 RGT2YDL138W 2292 nt6.6□□□□□ -1.35
NMD4Q12129 MSG5YNL053W 1470 nt6.6□□□□□ -1.35
NMD4Q12129 SEC23YPR181C 2307 nt6.59□□□□□ -1.35
NMD4Q12129 YOR012WYOR012W 414 nt6.59□□□□□ -1.35
NMD4Q12129 TFC6YDR362C 2019 nt6.59□□□□□ -1.36
NMD4Q12129 NSE5YML023C 1671 nt6.58□□□□□ -1.36
NMD4Q12129 OPT1YJL212C 2400 nt6.58□□□□□ -1.36
NMD4Q12129 CMR1YDL156W 1569 nt6.58□□□□□ -1.36
NMD4Q12129 YDR401WYDR401W 564 nt6.58□□□□□ -1.36
NMD4Q12129 MTR3YGR158C 753 nt6.58□□□□□ -1.36
NMD4Q12129 MEU1YLR017W 1014 nt6.58□□□□□ -1.36
NMD4Q12129 PZF1YPR186C 1290 nt6.58□□□□□ -1.36
NMD4Q12129 ENP1YBR247C 1452 nt6.58□□□□□ -1.36
NMD4Q12129 AMN1YBR158W 1650 nt6.58□□□□□ -1.36
NMD4Q12129 SPE3YPR069C 882 nt6.57□□□□□ -1.36
NMD4Q12129 YPR076WYPR076W 375 nt6.57□□□□□ -1.36
NMD4Q12129 YJL163CYJL163C 1668 nt6.57□□□□□ -1.36
NMD4Q12129 GPA1YHR005C 1419 nt6.57□□□□□ -1.36
NMD4Q12129 YOS9YDR057W 1629 nt6.57□□□□□ -1.36
NMD4Q12129 EFM1YHL039W 1758 nt6.57□□□□□ -1.36
NMD4Q12129 YFL052WYFL052W 1398 nt6.57□□□□□ -1.36
NMD4Q12129 HHY1YEL059W 309 nt6.56□□□□□ -1.36
NMD4Q12129 PAC10YGR078C 600 nt6.56□□□□□ -1.36
NMD4Q12129 PTC7YHR076W 1032 nt6.56□□□□□ -1.36
NMD4Q12129 AAD14YNL331C 1131 nt6.56□□□□□ -1.36
NMD4Q12129 CEM1YER061C 1329 nt6.55□□□□□ -1.36
NMD4Q12129 YGL102CYGL102C 429 nt6.55□□□□□ -1.36
NMD4Q12129 REC107YJR021C 945 nt6.55□□□□□ -1.36
NMD4Q12129 YOL046CYOL046C 675 nt6.55□□□□□ -1.36
NMD4Q12129 FIT2YOR382W 462 nt6.55□□□□□ -1.36
NMD4Q12129 NUP84YDL116W 2181 nt6.55□□□□□ -1.36
NMD4Q12129 KIN1YDR122W 3195 nt6.55□□□□□ -1.36
NMD4Q12129 AGP2YBR132C 1791 nt6.54□□□□□ -1.36
NMD4Q12129 TUF1YOR187W 1314 nt6.54□□□□□ -1.36
NMD4Q12129 JIP4YDR475C 2631 nt6.54□□□□□ -1.36
NMD4Q12129 VBA5YKR105C 1749 nt6.54□□□□□ -1.36
NMD4Q12129 MRPL28YDR462W 444 nt6.54□□□□□ -1.36
NMD4Q12129 YIP4YGL198W 708 nt6.54□□□□□ -1.36
NMD4Q12129 MRPL19YNL185C 477 nt6.54□□□□□ -1.36
NMD4Q12129 ERG10YPL028W 1197 nt6.54□□□□□ -1.36
NMD4Q12129 RQC1YDR333C 2172 nt6.54□□□□□ -1.36
NMD4Q12129 MCH2YKL221W 1422 nt6.53□□□□□ -1.36
NMD4Q12129 YLL056CYLL056C 897 nt6.53□□□□□ -1.36
NMD4Q12129 ARC35YNR035C 1029 nt6.53□□□□□ -1.36
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