Protein–RNA interactions for Protein: Q12098

SLX4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, yeastyeast

Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SLX4Q12098 PET117YER058W 324 nt7.61□□□□□ -1.19
SLX4Q12098 YLR122CYLR122C 378 nt7.61□□□□□ -1.19
SLX4Q12098 HST2YPL015C 1074 nt7.61□□□□□ -1.19
SLX4Q12098 CDC7YDL017W 1524 nt7.61□□□□□ -1.19
SLX4Q12098 DML1YMR211W 1428 nt7.61□□□□□ -1.19
SLX4Q12098 ERG27YLR100W 1044 nt7.6□□□□□ -1.19
SLX4Q12098 FLC2YAL053W 2352 nt7.6□□□□□ -1.19
SLX4Q12098 DPM1YPR183W 804 nt7.59□□□□□ -1.19
SLX4Q12098 OPT1YJL212C 2400 nt7.59□□□□□ -1.19
SLX4Q12098 SPS22YCL048W 1392 nt7.59□□□□□ -1.2
SLX4Q12098 GTS1YGL181W 1191 nt7.58□□□□□ -1.2
SLX4Q12098 YCL049CYCL049C 939 nt7.58□□□□□ -1.2
SLX4Q12098 PPS1YBR276C 2424 nt7.58□□□□□ -1.2
SLX4Q12098 BNA3YJL060W 1335 nt7.57□□□□□ -1.2
SLX4Q12098 PRP2YNR011C 2631 nt7.57□□□□□ -1.2
SLX4Q12098 YHR145CYHR145C 357 nt7.57□□□□□ -1.2
SLX4Q12098 GPA1YHR005C 1419 nt7.57□□□□□ -1.2
SLX4Q12098 RGT2YDL138W 2292 nt7.57□□□□□ -1.2
SLX4Q12098 YKR018CYKR018C 2178 nt7.56□□□□□ -1.2
SLX4Q12098 YER137CYER137C 447 nt7.56□□□□□ -1.2
SLX4Q12098 AIM46YHR199C 933 nt7.56□□□□□ -1.2
SLX4Q12098 MCP1YOR228C 909 nt7.56□□□□□ -1.2
SLX4Q12098 ENP1YBR247C 1452 nt7.55□□□□□ -1.2
SLX4Q12098 PLB2YMR006C 2121 nt7.55□□□□□ -1.2
SLX4Q12098 URA1YKL216W 945 nt7.55□□□□□ -1.2
SLX4Q12098 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt7.55□□□□□ -1.2
SLX4Q12098 YOR389WYOR389W 1875 nt7.55□□□□□ -1.2
SLX4Q12098 EXG2YDR261C 1689 nt7.54□□□□□ -1.2
SLX4Q12098 ADE17YMR120C 1779 nt7.54□□□□□ -1.2
SLX4Q12098 HGH1YGR187C 1185 nt7.54□□□□□ -1.2
SLX4Q12098 YLR162WYLR162W 357 nt7.54□□□□□ -1.2
SLX4Q12098 ARA2YMR041C 1008 nt7.54□□□□□ -1.2
SLX4Q12098 GET4YOR164C 939 nt7.54□□□□□ -1.2
SLX4Q12098 MPE1YKL059C 1326 nt7.53□□□□□ -1.2
SLX4Q12098 TUB1YML085C 1344 nt7.53□□□□□ -1.2
SLX4Q12098 RMD8YFR048W 1989 nt7.53□□□□□ -1.2
SLX4Q12098 YCR049CYCR049C 447 nt7.53□□□□□ -1.2
SLX4Q12098 SML1YML058W 315 nt7.53□□□□□ -1.2
SLX4Q12098 CMR1YDL156W 1569 nt7.53□□□□□ -1.2
SLX4Q12098 NSE5YML023C 1671 nt7.53□□□□□ -1.2
SLX4Q12098 SSC1YJR045C 1965 nt7.53□□□□□ -1.2
SLX4Q12098 SEC24YIL109C 2781 nt7.52□□□□□ -1.21
SLX4Q12098 CIA1YDR267C 993 nt7.52□□□□□ -1.21
SLX4Q12098 YFL052WYFL052W 1398 nt7.51□□□□□ -1.21
SLX4Q12098 YGR068W-AYGR068W-A 96 nt7.51□□□□□ -1.21
SLX4Q12098 YJL144WYJL144W 315 nt7.51□□□□□ -1.21
SLX4Q12098 YNR001W-AYNR001W-A 219 nt7.51□□□□□ -1.21
SLX4Q12098 FCY2YER056C 1602 nt7.51□□□□□ -1.21
SLX4Q12098 NUP57YGR119C 1626 nt7.51□□□□□ -1.21
SLX4Q12098 ENB1YOL158C 1821 nt7.5□□□□□ -1.21
SLX4Q12098 NMD5YJR132W 3147 nt7.5□□□□□ -1.21
SLX4Q12098 PHO85YPL031C 918 nt7.5□□□□□ -1.21
SLX4Q12098 RPL43AYPR043W 279 nt7.5□□□□□ -1.21
SLX4Q12098 BRN1YBL097W 2265 nt7.5□□□□□ -1.21
SLX4Q12098 ERG12YMR208W 1332 nt7.5□□□□□ -1.21
SLX4Q12098 SGE1YPR198W 1632 nt7.49□□□□□ -1.21
SLX4Q12098 PUS4YNL292W 1212 nt7.49□□□□□ -1.21
SLX4Q12098 SLD7YOR060C 774 nt7.49□□□□□ -1.21
SLX4Q12098 LGE1YPL055C 999 nt7.49□□□□□ -1.21
SLX4Q12098 ATG23YLR431C 1362 nt7.48□□□□□ -1.21
SLX4Q12098 FZF1YGL254W 900 nt7.48□□□□□ -1.21
SLX4Q12098 CAN1YEL063C 1773 nt7.48□□□□□ -1.21
SLX4Q12098 CTA1YDR256C 1548 nt7.47□□□□□ -1.21
SLX4Q12098 ASN2YGR124W 1719 nt7.47□□□□□ -1.21
SLX4Q12098 SUN4YNL066W 1263 nt7.47□□□□□ -1.21
SLX4Q12098 HTZ1YOL012C 405 nt7.47□□□□□ -1.21
SLX4Q12098 MPH3YJR160C 1809 nt7.47□□□□□ -1.21
SLX4Q12098 GAA1YLR088W 1845 nt7.47□□□□□ -1.21
SLX4Q12098 PRB1YEL060C 1908 nt7.46□□□□□ -1.21
SLX4Q12098 ATF1YOR377W 1578 nt7.46□□□□□ -1.21
SLX4Q12098 YOS9YDR057W 1629 nt7.46□□□□□ -1.21
SLX4Q12098 SPE3YPR069C 882 nt7.46□□□□□ -1.22
SLX4Q12098 APE4YHR113W 1473 nt7.46□□□□□ -1.22
SLX4Q12098 NUP84YDL116W 2181 nt7.45□□□□□ -1.22
SLX4Q12098 ERG10YPL028W 1197 nt7.45□□□□□ -1.22
SLX4Q12098 BIO3YNR058W 1443 nt7.44□□□□□ -1.22
SLX4Q12098 DRS1YLL008W 2259 nt7.44□□□□□ -1.22
SLX4Q12098 HPT1YDR399W 666 nt7.44□□□□□ -1.22
SLX4Q12098 YIR017W-AYIR017W-A 600 nt7.44□□□□□ -1.22
SLX4Q12098 YAL045CYAL045C 309 nt7.44□□□□□ -1.22
SLX4Q12098 LOT6YLR011W 576 nt7.44□□□□□ -1.22
SLX4Q12098 YNR005CYNR005C 405 nt7.44□□□□□ -1.22
SLX4Q12098 NTG2YOL043C 1143 nt7.44□□□□□ -1.22
SLX4Q12098 YOL046CYOL046C 675 nt7.44□□□□□ -1.22
SLX4Q12098 ECM30YLR436C 3825 nt7.44□□□□□ -1.22
SLX4Q12098 MHP1YJL042W 4197 nt7.43□□□□□ -1.22
SLX4Q12098 THR1YHR025W 1074 nt7.43□□□□□ -1.22
SLX4Q12098 AVO2YMR068W 1281 nt7.43□□□□□ -1.22
SLX4Q12098 AAD14YNL331C 1131 nt7.43□□□□□ -1.22
SLX4Q12098 YJL163CYJL163C 1668 nt7.43□□□□□ -1.22
SLX4Q12098 TOD6YBL054W 1578 nt7.42□□□□□ -1.22
SLX4Q12098 YLL058WYLL058W 1728 nt7.42□□□□□ -1.22
SLX4Q12098 JIP4YDR475C 2631 nt7.41□□□□□ -1.22
SLX4Q12098 YIP4YGL198W 708 nt7.41□□□□□ -1.22
SLX4Q12098 LDB7YBL006C 543 nt7.41□□□□□ -1.22
SLX4Q12098 YHM2YMR241W 945 nt7.41□□□□□ -1.22
SLX4Q12098 PAP2YOL115W 1755 nt7.41□□□□□ -1.22
SLX4Q12098 REV7YIL139C 738 nt7.4□□□□□ -1.22
SLX4Q12098 FIT2YOR382W 462 nt7.4□□□□□ -1.22
SLX4Q12098 YPR127WYPR127W 1038 nt7.4□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 20 ms