Protein–RNA interactions for Protein: Q08723

RPN8, 26S proteasome regulatory subunit RPN8, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPN8Q08723 GET4YOR164C 939 nt6.92□□□□□ -1.3
RPN8Q08723 YPR076WYPR076W 375 nt6.92□□□□□ -1.3
RPN8Q08723 YPC1YBR183W 951 nt6.92□□□□□ -1.3
RPN8Q08723 YJL163CYJL163C 1668 nt6.91□□□□□ -1.3
RPN8Q08723 OPI7YDR360W 435 nt6.91□□□□□ -1.3
RPN8Q08723 MCH2YKL221W 1422 nt6.91□□□□□ -1.3
RPN8Q08723 ECM38YLR299W 1983 nt6.9□□□□□ -1.3
RPN8Q08723 AGX1YFL030W 1158 nt6.9□□□□□ -1.3
RPN8Q08723 YOL046CYOL046C 675 nt6.9□□□□□ -1.3
RPN8Q08723 GLN3YER040W 2193 nt6.9□□□□□ -1.3
RPN8Q08723 ADE17YMR120C 1779 nt6.9□□□□□ -1.31
RPN8Q08723 RTC4YNL254C 1206 nt6.89□□□□□ -1.31
RPN8Q08723 ARC35YNR035C 1029 nt6.89□□□□□ -1.31
RPN8Q08723 CCT3YJL014W 1605 nt6.88□□□□□ -1.31
RPN8Q08723 FIT2YOR382W 462 nt6.88□□□□□ -1.31
RPN8Q08723 NMD5YJR132W 3147 nt6.87□□□□□ -1.31
RPN8Q08723 YCL049CYCL049C 939 nt6.87□□□□□ -1.31
RPN8Q08723 BDF2YDL070W 1917 nt6.87□□□□□ -1.31
RPN8Q08723 PPH21YDL134C 1110 nt6.86□□□□□ -1.31
RPN8Q08723 PDA1YER178W 1263 nt6.86□□□□□ -1.31
RPN8Q08723 RPL2BYIL018W 765 nt6.86□□□□□ -1.31
RPN8Q08723 HTZ1YOL012C 405 nt6.86□□□□□ -1.31
RPN8Q08723 ASN2YGR124W 1719 nt6.86□□□□□ -1.31
RPN8Q08723 CIA1YDR267C 993 nt6.85□□□□□ -1.31
RPN8Q08723 FPR2YDR519W 408 nt6.85□□□□□ -1.31
RPN8Q08723 DPM1YPR183W 804 nt6.85□□□□□ -1.31
RPN8Q08723 TAH11YJR046W 1815 nt6.85□□□□□ -1.31
RPN8Q08723 ERG24YNL280C 1317 nt6.84□□□□□ -1.31
RPN8Q08723 VMA2YBR127C 1554 nt6.84□□□□□ -1.31
RPN8Q08723 PET117YER058W 324 nt6.84□□□□□ -1.31
RPN8Q08723 MTR3YGR158C 753 nt6.84□□□□□ -1.31
RPN8Q08723 SNT309YPR101W 528 nt6.84□□□□□ -1.31
RPN8Q08723 YPR130CYPR130C 408 nt6.84□□□□□ -1.31
RPN8Q08723 DAL7YIR031C 1665 nt6.84□□□□□ -1.32
RPN8Q08723 YOS9YDR057W 1629 nt6.83□□□□□ -1.32
RPN8Q08723 ERS1YCR075C 783 nt6.83□□□□□ -1.32
RPN8Q08723 CTF8YHR191C 402 nt6.83□□□□□ -1.32
RPN8Q08723 YIL029W-AYIL029W-A 372 nt6.83□□□□□ -1.32
RPN8Q08723 SCS22YBL091C-A 528 nt6.83□□□□□ -1.32
RPN8Q08723 APE4YHR113W 1473 nt6.83□□□□□ -1.32
RPN8Q08723 HSP12YFL014W 330 nt6.82□□□□□ -1.32
RPN8Q08723 YIP4YGL198W 708 nt6.82□□□□□ -1.32
RPN8Q08723 YAL045CYAL045C 309 nt6.82□□□□□ -1.32
RPN8Q08723 OPI11YPR044C 354 nt6.82□□□□□ -1.32
RPN8Q08723 ASR1YPR093C 867 nt6.82□□□□□ -1.32
RPN8Q08723 ARP3YJR065C 1350 nt6.82□□□□□ -1.32
RPN8Q08723 MRPL35YDR322W 1104 nt6.81□□□□□ -1.32
RPN8Q08723 ECM27YJR106W 2178 nt6.81□□□□□ -1.32
RPN8Q08723 PLB2YMR006C 2121 nt6.8□□□□□ -1.32
RPN8Q08723 YBR241CYBR241C 1467 nt6.8□□□□□ -1.32
RPN8Q08723 RDR1YOR380W 1641 nt6.8□□□□□ -1.32
RPN8Q08723 IMG1YCR046C 510 nt6.8□□□□□ -1.32
RPN8Q08723 AMN1YBR158W 1650 nt6.8□□□□□ -1.32
RPN8Q08723 SGE1YPR198W 1632 nt6.79□□□□□ -1.32
RPN8Q08723 AVT4YNL101W 2142 nt6.79□□□□□ -1.32
RPN8Q08723 YKL153WYKL153W 510 nt6.79□□□□□ -1.32
RPN8Q08723 SLA2YNL243W 2907 nt6.79□□□□□ -1.32
RPN8Q08723 CIR2YOR356W 1896 nt6.79□□□□□ -1.32
RPN8Q08723 FYV1YDR024W 486 nt6.78□□□□□ -1.32
RPN8Q08723 PHO85YPL031C 918 nt6.78□□□□□ -1.32
RPN8Q08723 NTE1YML059C 5040 nt6.78□□□□□ -1.32
RPN8Q08723 PAB1YER165W 1734 nt6.78□□□□□ -1.32
RPN8Q08723 SUF3tG(CCC)D 72 nt6.77□□□□□ -1.33
RPN8Q08723 SUR7YML052W 909 nt6.77□□□□□ -1.33
RPN8Q08723 HBN1YCL026C-B 582 nt6.77□□□□□ -1.33
RPN8Q08723 CEM1YER061C 1329 nt6.76□□□□□ -1.33
RPN8Q08723 ASF1YJL115W 840 nt6.76□□□□□ -1.33
RPN8Q08723 MRPS18YNL306W 654 nt6.76□□□□□ -1.33
RPN8Q08723 FMP40YPL222W 2067 nt6.75□□□□□ -1.33
RPN8Q08723 GTT3YEL017W 1014 nt6.75□□□□□ -1.33
RPN8Q08723 QRI5YLR204W 336 nt6.75□□□□□ -1.33
RPN8Q08723 YNR005CYNR005C 405 nt6.75□□□□□ -1.33
RPN8Q08723 YNR014WYNR014W 639 nt6.75□□□□□ -1.33
RPN8Q08723 Q0010Q0010 387 nt6.75□□□□□ -1.33
RPN8Q08723 TDP1YBR223C 1635 nt6.75□□□□□ -1.33
RPN8Q08723 HMS2YJR147W 1077 nt6.74□□□□□ -1.33
RPN8Q08723 YJR154WYJR154W 1041 nt6.74□□□□□ -1.33
RPN8Q08723 OPI8YKR035C 642 nt6.74□□□□□ -1.33
RPN8Q08723 CDC7YDL017W 1524 nt6.74□□□□□ -1.33
RPN8Q08723 YEN1YER041W 2280 nt6.74□□□□□ -1.33
RPN8Q08723 TAF9YMR236W 474 nt6.73□□□□□ -1.33
RPN8Q08723 RPL43AYPR043W 279 nt6.73□□□□□ -1.33
RPN8Q08723 PHO3YBR092C 1404 nt6.73□□□□□ -1.33
RPN8Q08723 LCL3YGL085W 825 nt6.72□□□□□ -1.33
RPN8Q08723 FMO1YHR176W 1299 nt6.72□□□□□ -1.33
RPN8Q08723 MDH1YKL085W 1005 nt6.72□□□□□ -1.33
RPN8Q08723 MHP1YJL042W 4197 nt6.72□□□□□ -1.33
RPN8Q08723 BRN1YBL097W 2265 nt6.71□□□□□ -1.33
RPN8Q08723 PGI1YBR196C 1665 nt6.71□□□□□ -1.33
RPN8Q08723 TFG2YGR005C 1203 nt6.71□□□□□ -1.34
RPN8Q08723 DRE2YKR071C 1047 nt6.71□□□□□ -1.34
RPN8Q08723 IMD1YAR073W 1212 nt6.71□□□□□ -1.34
RPN8Q08723 MRPL28YDR462W 444 nt6.7□□□□□ -1.34
RPN8Q08723 COX16YJL003W 357 nt6.7□□□□□ -1.34
RPN8Q08723 YNL200CYNL200C 741 nt6.7□□□□□ -1.34
RPN8Q08723 GCG1YER163C 699 nt6.69□□□□□ -1.34
RPN8Q08723 MRPL19YNL185C 477 nt6.69□□□□□ -1.34
RPN8Q08723 IRC5YFR038W 2562 nt6.69□□□□□ -1.34
RPN8Q08723 RBS1YDL189W 1374 nt6.69□□□□□ -1.34
RPN8Q08723 SAL1YNL083W 1485 nt6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 35.7 ms