Protein–RNA interactions for Protein: P40080

VFA1, VPS4-associated protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VFA1P40080 RMA1YKL132C 1293 nt7.41□□□□□ -1.22
VFA1P40080 YLR162WYLR162W 357 nt7.41□□□□□ -1.22
VFA1P40080 PRE5YMR314W 705 nt7.41□□□□□ -1.22
VFA1P40080 RQC1YDR333C 2172 nt7.4□□□□□ -1.22
VFA1P40080 TRS31YDR472W 852 nt7.4□□□□□ -1.22
VFA1P40080 YOR268CYOR268C 399 nt7.4□□□□□ -1.22
VFA1P40080 APE4YHR113W 1473 nt7.4□□□□□ -1.22
VFA1P40080 YLL058WYLL058W 1728 nt7.4□□□□□ -1.23
VFA1P40080 RFC1YOR217W 2586 nt7.39□□□□□ -1.23
VFA1P40080 SLA2YNL243W 2907 nt7.38□□□□□ -1.23
VFA1P40080 YPL247CYPL247C 1572 nt7.38□□□□□ -1.23
VFA1P40080 RPR1RPR1 369 nt7.38□□□□□ -1.23
VFA1P40080 YNR014WYNR014W 639 nt7.38□□□□□ -1.23
VFA1P40080 YLL066CYLL066C 3618 nt7.38□□□□□ -1.23
VFA1P40080 VBA5YKR105C 1749 nt7.38□□□□□ -1.23
VFA1P40080 PTC7YHR076W 1032 nt7.37□□□□□ -1.23
VFA1P40080 REC114YMR133W 1287 nt7.37□□□□□ -1.23
VFA1P40080 YOR389WYOR389W 1875 nt7.36□□□□□ -1.23
VFA1P40080 AIM46YHR199C 933 nt7.36□□□□□ -1.23
VFA1P40080 COX16YJL003W 357 nt7.36□□□□□ -1.23
VFA1P40080 YLR122CYLR122C 378 nt7.36□□□□□ -1.23
VFA1P40080 ATG17YLR423C 1254 nt7.36□□□□□ -1.23
VFA1P40080 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt7.35□□□□□ -1.23
VFA1P40080 BNS1YGR230W 414 nt7.35□□□□□ -1.23
VFA1P40080 YOX1YML027W 1158 nt7.35□□□□□ -1.23
VFA1P40080 MRPS28YDR337W 861 nt7.34□□□□□ -1.23
VFA1P40080 YGL102CYGL102C 429 nt7.34□□□□□ -1.23
VFA1P40080 SMX3YPR182W 261 nt7.34□□□□□ -1.23
VFA1P40080 NDE1YMR145C 1683 nt7.34□□□□□ -1.23
VFA1P40080 YDL177CYDL177C 513 nt7.33□□□□□ -1.24
VFA1P40080 YNL165WYNL165W 1221 nt7.33□□□□□ -1.24
VFA1P40080 LAT1YNL071W 1449 nt7.33□□□□□ -1.24
VFA1P40080 PEX31YGR004W 1389 nt7.33□□□□□ -1.24
VFA1P40080 YSC83YHR017W 1158 nt7.32□□□□□ -1.24
VFA1P40080 ICP55YER078C 1536 nt7.32□□□□□ -1.24
VFA1P40080 YMR034CYMR034C 1305 nt7.31□□□□□ -1.24
VFA1P40080 PPH22YDL188C 1134 nt7.31□□□□□ -1.24
VFA1P40080 TOM20YGR082W 552 nt7.31□□□□□ -1.24
VFA1P40080 DYS1YHR068W 1164 nt7.31□□□□□ -1.24
VFA1P40080 PRI1YIR008C 1230 nt7.31□□□□□ -1.24
VFA1P40080 ZIM17YNL310C 525 nt7.31□□□□□ -1.24
VFA1P40080 RPL5YPL131W 894 nt7.31□□□□□ -1.24
VFA1P40080 OPI11YPR044C 354 nt7.31□□□□□ -1.24
VFA1P40080 MSC3YLR219W 2187 nt7.3□□□□□ -1.24
VFA1P40080 IRC11YOR013W 471 nt7.3□□□□□ -1.24
VFA1P40080 SEC62YPL094C 825 nt7.3□□□□□ -1.24
VFA1P40080 HXT13YEL069C 1695 nt7.3□□□□□ -1.24
VFA1P40080 YJL163CYJL163C 1668 nt7.29□□□□□ -1.24
VFA1P40080 SML1YML058W 315 nt7.29□□□□□ -1.24
VFA1P40080 RRN10YBL025W 438 nt7.29□□□□□ -1.24
VFA1P40080 HDA1YNL021W 2121 nt7.29□□□□□ -1.24
VFA1P40080 ERG10YPL028W 1197 nt7.29□□□□□ -1.24
VFA1P40080 SMK1YPR054W 1167 nt7.29□□□□□ -1.24
VFA1P40080 YHR131CYHR131C 2553 nt7.29□□□□□ -1.24
VFA1P40080 MIP1YOR330C 3765 nt7.28□□□□□ -1.24
VFA1P40080 HED1YDR014W-A 489 nt7.28□□□□□ -1.24
VFA1P40080 YLL056CYLL056C 897 nt7.28□□□□□ -1.24
VFA1P40080 MFG1YDL233W 1377 nt7.28□□□□□ -1.24
VFA1P40080 FCY22YER060W-A 1593 nt7.28□□□□□ -1.24
VFA1P40080 SSC1YJR045C 1965 nt7.28□□□□□ -1.24
VFA1P40080 ARA2YMR041C 1008 nt7.27□□□□□ -1.25
VFA1P40080 FIT2YOR382W 462 nt7.27□□□□□ -1.25
VFA1P40080 NUP49YGL172W 1419 nt7.27□□□□□ -1.25
VFA1P40080 YHR020WYHR020W 2067 nt7.26□□□□□ -1.25
VFA1P40080 YKR023WYKR023W 1593 nt7.26□□□□□ -1.25
VFA1P40080 TRR1YDR353W 960 nt7.26□□□□□ -1.25
VFA1P40080 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt7.26□□□□□ -1.25
VFA1P40080 SUF16tG(GCC)C 71 nt7.26□□□□□ -1.25
VFA1P40080 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt7.26□□□□□ -1.25
VFA1P40080 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt7.26□□□□□ -1.25
VFA1P40080 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt7.26□□□□□ -1.25
VFA1P40080 SUF20tG(GCC)F1 71 nt7.26□□□□□ -1.25
VFA1P40080 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt7.26□□□□□ -1.25
VFA1P40080 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt7.26□□□□□ -1.25
VFA1P40080 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt7.26□□□□□ -1.25
VFA1P40080 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt7.26□□□□□ -1.25
VFA1P40080 SUF23tG(GCC)J2 71 nt7.26□□□□□ -1.25
VFA1P40080 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt7.26□□□□□ -1.25
VFA1P40080 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt7.26□□□□□ -1.25
VFA1P40080 SUF17tG(GCC)O2 71 nt7.26□□□□□ -1.25
VFA1P40080 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt7.26□□□□□ -1.25
VFA1P40080 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt7.26□□□□□ -1.25
VFA1P40080 OPI8YKR035C 642 nt7.26□□□□□ -1.25
VFA1P40080 YOL046CYOL046C 675 nt7.26□□□□□ -1.25
VFA1P40080 AGX1YFL030W 1158 nt7.25□□□□□ -1.25
VFA1P40080 YJR107WYJR107W 987 nt7.25□□□□□ -1.25
VFA1P40080 GCN3YKR026C 918 nt7.25□□□□□ -1.25
VFA1P40080 MRPL19YNL185C 477 nt7.25□□□□□ -1.25
VFA1P40080 DOT1YDR440W 1749 nt7.24□□□□□ -1.25
VFA1P40080 MEU1YLR017W 1014 nt7.24□□□□□ -1.25
VFA1P40080 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt7.24□□□□□ -1.25
VFA1P40080 TOS6YNL300W 309 nt7.24□□□□□ -1.25
VFA1P40080 YPR076WYPR076W 375 nt7.24□□□□□ -1.25
VFA1P40080 ADH5YBR145W 1056 nt7.24□□□□□ -1.25
VFA1P40080 STT3YGL022W 2157 nt7.24□□□□□ -1.25
VFA1P40080 PPM2YOL141W 2088 nt7.24□□□□□ -1.25
VFA1P40080 ECM38YLR299W 1983 nt7.24□□□□□ -1.25
VFA1P40080 HOG1YLR113W 1308 nt7.24□□□□□ -1.25
VFA1P40080 YPL277CYPL277C 1464 nt7.24□□□□□ -1.25
VFA1P40080 ECM27YJR106W 2178 nt7.23□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.1 ms