Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEC24CP53992 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms