Protein–RNA interactions for Protein: P04183

TK1, Thymidine kinase, cytosolic, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TK1P04183 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TK1P04183 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TK1P04183 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TK1P04183 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TK1P04183 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TK1P04183 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TK1P04183 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TK1P04183 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TK1P04183 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TK1P04183 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TK1P04183 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TK1P04183 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TK1P04183 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TK1P04183 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TK1P04183 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TK1P04183 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TK1P04183 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TK1P04183 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TK1P04183 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TK1P04183 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TK1P04183 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TK1P04183 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TK1P04183 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TK1P04183 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TK1P04183 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TK1P04183 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TK1P04183 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TK1P04183 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TK1P04183 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TK1P04183 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TK1P04183 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TK1P04183 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TK1P04183 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TK1P04183 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TK1P04183 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TK1P04183 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TK1P04183 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TK1P04183 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TK1P04183 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TK1P04183 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TK1P04183 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TK1P04183 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TK1P04183 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TK1P04183 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TK1P04183 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TK1P04183 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TK1P04183 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TK1P04183 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TK1P04183 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TK1P04183 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TK1P04183 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TK1P04183 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TK1P04183 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TK1P04183 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TK1P04183 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TK1P04183 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TK1P04183 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TK1P04183 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TK1P04183 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TK1P04183 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TK1P04183 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TK1P04183 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TK1P04183 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TK1P04183 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TK1P04183 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TK1P04183 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TK1P04183 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TK1P04183 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TK1P04183 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TK1P04183 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TK1P04183 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
TK1P04183 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TK1P04183 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TK1P04183 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TK1P04183 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TK1P04183 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TK1P04183 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TK1P04183 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TK1P04183 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TK1P04183 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TK1P04183 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TK1P04183 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TK1P04183 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TK1P04183 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TK1P04183 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TK1P04183 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TK1P04183 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TK1P04183 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TK1P04183 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TK1P04183 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TK1P04183 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TK1P04183 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TK1P04183 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TK1P04183 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TK1P04183 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TK1P04183 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TK1P04183 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TK1P04183 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TK1P04183 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TK1P04183 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 196 ms