Protein–RNA interactions for Protein: O14618

CCS, Copper chaperone for superoxide dismutase, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSO14618 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCSO14618 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCSO14618 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCSO14618 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCSO14618 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCSO14618 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCSO14618 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCSO14618 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCSO14618 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCSO14618 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCSO14618 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCSO14618 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCSO14618 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCSO14618 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCSO14618 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCSO14618 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCSO14618 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCSO14618 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCSO14618 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCSO14618 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCSO14618 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCSO14618 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCSO14618 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCSO14618 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCSO14618 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCSO14618 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCSO14618 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCSO14618 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCSO14618 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCSO14618 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCSO14618 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCSO14618 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCSO14618 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCSO14618 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCSO14618 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCSO14618 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCSO14618 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCSO14618 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCSO14618 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCSO14618 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCSO14618 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCSO14618 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCSO14618 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCSO14618 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCSO14618 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCSO14618 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCSO14618 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCSO14618 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCSO14618 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCSO14618 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCSO14618 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCSO14618 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCSO14618 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCSO14618 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCSO14618 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCSO14618 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCSO14618 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCSO14618 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCSO14618 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCSO14618 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCSO14618 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCSO14618 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCSO14618 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCSO14618 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCSO14618 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCSO14618 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCSO14618 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCSO14618 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCSO14618 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCSO14618 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCSO14618 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCSO14618 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCSO14618 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCSO14618 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCSO14618 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCSO14618 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCSO14618 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCSO14618 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCSO14618 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCSO14618 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCSO14618 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCSO14618 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCSO14618 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCSO14618 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCSO14618 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCSO14618 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCSO14618 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCSO14618 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCSO14618 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCSO14618 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCSO14618 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCSO14618 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCSO14618 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCSO14618 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCSO14618 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCSO14618 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCSO14618 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCSO14618 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCSO14618 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCSO14618 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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