Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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