Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms