Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMIM7Q9BQ49 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMIM7Q9BQ49 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMIM7Q9BQ49 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMIM7Q9BQ49 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMIM7Q9BQ49 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMIM7Q9BQ49 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMIM7Q9BQ49 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMIM7Q9BQ49 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMIM7Q9BQ49 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMIM7Q9BQ49 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMIM7Q9BQ49 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMIM7Q9BQ49 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMIM7Q9BQ49 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SMIM7Q9BQ49 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMIM7Q9BQ49 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMIM7Q9BQ49 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMIM7Q9BQ49 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMIM7Q9BQ49 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SMIM7Q9BQ49 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMIM7Q9BQ49 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMIM7Q9BQ49 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMIM7Q9BQ49 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMIM7Q9BQ49 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMIM7Q9BQ49 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMIM7Q9BQ49 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMIM7Q9BQ49 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMIM7Q9BQ49 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMIM7Q9BQ49 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMIM7Q9BQ49 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMIM7Q9BQ49 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMIM7Q9BQ49 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMIM7Q9BQ49 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMIM7Q9BQ49 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SMIM7Q9BQ49 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMIM7Q9BQ49 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMIM7Q9BQ49 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMIM7Q9BQ49 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMIM7Q9BQ49 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMIM7Q9BQ49 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMIM7Q9BQ49 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SMIM7Q9BQ49 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMIM7Q9BQ49 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMIM7Q9BQ49 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMIM7Q9BQ49 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SMIM7Q9BQ49 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMIM7Q9BQ49 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMIM7Q9BQ49 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMIM7Q9BQ49 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMIM7Q9BQ49 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMIM7Q9BQ49 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMIM7Q9BQ49 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMIM7Q9BQ49 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMIM7Q9BQ49 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMIM7Q9BQ49 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMIM7Q9BQ49 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMIM7Q9BQ49 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMIM7Q9BQ49 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMIM7Q9BQ49 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMIM7Q9BQ49 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMIM7Q9BQ49 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMIM7Q9BQ49 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMIM7Q9BQ49 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMIM7Q9BQ49 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMIM7Q9BQ49 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SMIM7Q9BQ49 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SMIM7Q9BQ49 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SMIM7Q9BQ49 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMIM7Q9BQ49 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMIM7Q9BQ49 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMIM7Q9BQ49 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMIM7Q9BQ49 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMIM7Q9BQ49 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMIM7Q9BQ49 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMIM7Q9BQ49 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMIM7Q9BQ49 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMIM7Q9BQ49 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMIM7Q9BQ49 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMIM7Q9BQ49 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMIM7Q9BQ49 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMIM7Q9BQ49 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMIM7Q9BQ49 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMIM7Q9BQ49 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMIM7Q9BQ49 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMIM7Q9BQ49 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMIM7Q9BQ49 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMIM7Q9BQ49 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SMIM7Q9BQ49 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMIM7Q9BQ49 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMIM7Q9BQ49 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMIM7Q9BQ49 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMIM7Q9BQ49 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMIM7Q9BQ49 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMIM7Q9BQ49 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMIM7Q9BQ49 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMIM7Q9BQ49 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMIM7Q9BQ49 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMIM7Q9BQ49 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMIM7Q9BQ49 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMIM7Q9BQ49 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms