Protein–RNA interactions for Protein: Q5U5Q3

MEX3C, RNA-binding E3 ubiquitin-protein ligase MEX3C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEX3CQ5U5Q3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
MEX3CQ5U5Q3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
MEX3CQ5U5Q3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
MEX3CQ5U5Q3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC34.4■■■■□ 3.1
MEX3CQ5U5Q3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
MEX3CQ5U5Q3 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
MEX3CQ5U5Q3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
MEX3CQ5U5Q3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
MEX3CQ5U5Q3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
MEX3CQ5U5Q3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
MEX3CQ5U5Q3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
MEX3CQ5U5Q3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
MEX3CQ5U5Q3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
MEX3CQ5U5Q3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
MEX3CQ5U5Q3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
MEX3CQ5U5Q3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
MEX3CQ5U5Q3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC34.36■■■■□ 3.09
MEX3CQ5U5Q3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
MEX3CQ5U5Q3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
MEX3CQ5U5Q3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
MEX3CQ5U5Q3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
MEX3CQ5U5Q3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
MEX3CQ5U5Q3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
MEX3CQ5U5Q3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
MEX3CQ5U5Q3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
MEX3CQ5U5Q3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
MEX3CQ5U5Q3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
MEX3CQ5U5Q3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
MEX3CQ5U5Q3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
MEX3CQ5U5Q3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
MEX3CQ5U5Q3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
MEX3CQ5U5Q3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
MEX3CQ5U5Q3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
MEX3CQ5U5Q3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
MEX3CQ5U5Q3 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
MEX3CQ5U5Q3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
MEX3CQ5U5Q3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
MEX3CQ5U5Q3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
MEX3CQ5U5Q3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
MEX3CQ5U5Q3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
MEX3CQ5U5Q3 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.26■■■■□ 3.08
MEX3CQ5U5Q3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
MEX3CQ5U5Q3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
MEX3CQ5U5Q3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
MEX3CQ5U5Q3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
MEX3CQ5U5Q3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
MEX3CQ5U5Q3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
MEX3CQ5U5Q3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
MEX3CQ5U5Q3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
MEX3CQ5U5Q3 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
MEX3CQ5U5Q3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
MEX3CQ5U5Q3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
MEX3CQ5U5Q3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
MEX3CQ5U5Q3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC34.23■■■■□ 3.07
MEX3CQ5U5Q3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
MEX3CQ5U5Q3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
MEX3CQ5U5Q3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
MEX3CQ5U5Q3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
MEX3CQ5U5Q3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
MEX3CQ5U5Q3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
MEX3CQ5U5Q3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
MEX3CQ5U5Q3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
MEX3CQ5U5Q3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
MEX3CQ5U5Q3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
MEX3CQ5U5Q3 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
MEX3CQ5U5Q3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
MEX3CQ5U5Q3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
MEX3CQ5U5Q3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
MEX3CQ5U5Q3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
MEX3CQ5U5Q3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
MEX3CQ5U5Q3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
MEX3CQ5U5Q3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
MEX3CQ5U5Q3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
MEX3CQ5U5Q3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
MEX3CQ5U5Q3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
MEX3CQ5U5Q3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
MEX3CQ5U5Q3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
MEX3CQ5U5Q3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
MEX3CQ5U5Q3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
MEX3CQ5U5Q3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
MEX3CQ5U5Q3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
MEX3CQ5U5Q3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
MEX3CQ5U5Q3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
MEX3CQ5U5Q3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
MEX3CQ5U5Q3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
MEX3CQ5U5Q3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
MEX3CQ5U5Q3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
MEX3CQ5U5Q3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
MEX3CQ5U5Q3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
MEX3CQ5U5Q3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
MEX3CQ5U5Q3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC34.1■■■■□ 3.05
MEX3CQ5U5Q3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
MEX3CQ5U5Q3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
MEX3CQ5U5Q3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
MEX3CQ5U5Q3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
MEX3CQ5U5Q3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC34.09■■■■□ 3.05
MEX3CQ5U5Q3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
MEX3CQ5U5Q3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
MEX3CQ5U5Q3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
MEX3CQ5U5Q3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms