Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NUP188Q5SRE5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC32.94■■■□□ 2.86
NUP188Q5SRE5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
NUP188Q5SRE5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
NUP188Q5SRE5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
NUP188Q5SRE5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
NUP188Q5SRE5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
NUP188Q5SRE5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
NUP188Q5SRE5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
NUP188Q5SRE5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
NUP188Q5SRE5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
NUP188Q5SRE5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
NUP188Q5SRE5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
NUP188Q5SRE5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
NUP188Q5SRE5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
NUP188Q5SRE5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC32.91■■■□□ 2.86
NUP188Q5SRE5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
NUP188Q5SRE5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
NUP188Q5SRE5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
NUP188Q5SRE5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
NUP188Q5SRE5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
NUP188Q5SRE5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
NUP188Q5SRE5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
NUP188Q5SRE5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
NUP188Q5SRE5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
NUP188Q5SRE5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
NUP188Q5SRE5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
NUP188Q5SRE5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
NUP188Q5SRE5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
NUP188Q5SRE5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
NUP188Q5SRE5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
NUP188Q5SRE5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
NUP188Q5SRE5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
NUP188Q5SRE5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
NUP188Q5SRE5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
NUP188Q5SRE5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
NUP188Q5SRE5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
NUP188Q5SRE5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
NUP188Q5SRE5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
NUP188Q5SRE5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
NUP188Q5SRE5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
NUP188Q5SRE5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
NUP188Q5SRE5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
NUP188Q5SRE5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
NUP188Q5SRE5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
NUP188Q5SRE5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
NUP188Q5SRE5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
NUP188Q5SRE5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
NUP188Q5SRE5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
NUP188Q5SRE5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
NUP188Q5SRE5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
NUP188Q5SRE5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
NUP188Q5SRE5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
NUP188Q5SRE5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
NUP188Q5SRE5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
NUP188Q5SRE5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
NUP188Q5SRE5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
NUP188Q5SRE5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
NUP188Q5SRE5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
NUP188Q5SRE5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
NUP188Q5SRE5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
NUP188Q5SRE5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
NUP188Q5SRE5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
NUP188Q5SRE5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
NUP188Q5SRE5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
NUP188Q5SRE5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
NUP188Q5SRE5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
NUP188Q5SRE5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
NUP188Q5SRE5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
NUP188Q5SRE5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
NUP188Q5SRE5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
NUP188Q5SRE5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
NUP188Q5SRE5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
NUP188Q5SRE5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
NUP188Q5SRE5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
NUP188Q5SRE5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC32.75■■■□□ 2.83
NUP188Q5SRE5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
NUP188Q5SRE5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
NUP188Q5SRE5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
NUP188Q5SRE5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
NUP188Q5SRE5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
NUP188Q5SRE5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
NUP188Q5SRE5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
NUP188Q5SRE5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
NUP188Q5SRE5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
NUP188Q5SRE5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
NUP188Q5SRE5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
NUP188Q5SRE5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
NUP188Q5SRE5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
NUP188Q5SRE5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
NUP188Q5SRE5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
NUP188Q5SRE5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
NUP188Q5SRE5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
NUP188Q5SRE5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
NUP188Q5SRE5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
NUP188Q5SRE5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
NUP188Q5SRE5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
NUP188Q5SRE5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
NUP188Q5SRE5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
NUP188Q5SRE5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 184 ms