Protein–RNA interactions for Protein: Q15465

SHH, Sonic hedgehog protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHHQ15465 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SHHQ15465 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SHHQ15465 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SHHQ15465 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SHHQ15465 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SHHQ15465 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SHHQ15465 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SHHQ15465 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SHHQ15465 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SHHQ15465 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SHHQ15465 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SHHQ15465 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SHHQ15465 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SHHQ15465 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SHHQ15465 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SHHQ15465 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SHHQ15465 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SHHQ15465 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SHHQ15465 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SHHQ15465 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SHHQ15465 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SHHQ15465 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SHHQ15465 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SHHQ15465 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SHHQ15465 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SHHQ15465 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SHHQ15465 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SHHQ15465 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SHHQ15465 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SHHQ15465 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SHHQ15465 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SHHQ15465 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SHHQ15465 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SHHQ15465 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SHHQ15465 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SHHQ15465 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SHHQ15465 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SHHQ15465 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SHHQ15465 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SHHQ15465 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SHHQ15465 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SHHQ15465 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SHHQ15465 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SHHQ15465 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SHHQ15465 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SHHQ15465 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SHHQ15465 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SHHQ15465 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SHHQ15465 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SHHQ15465 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SHHQ15465 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SHHQ15465 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SHHQ15465 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SHHQ15465 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SHHQ15465 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SHHQ15465 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SHHQ15465 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SHHQ15465 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SHHQ15465 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SHHQ15465 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SHHQ15465 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SHHQ15465 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SHHQ15465 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SHHQ15465 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SHHQ15465 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SHHQ15465 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SHHQ15465 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SHHQ15465 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SHHQ15465 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SHHQ15465 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SHHQ15465 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SHHQ15465 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SHHQ15465 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SHHQ15465 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SHHQ15465 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SHHQ15465 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SHHQ15465 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SHHQ15465 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SHHQ15465 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SHHQ15465 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SHHQ15465 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SHHQ15465 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SHHQ15465 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SHHQ15465 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SHHQ15465 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SHHQ15465 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SHHQ15465 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SHHQ15465 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SHHQ15465 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SHHQ15465 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SHHQ15465 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SHHQ15465 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SHHQ15465 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SHHQ15465 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SHHQ15465 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SHHQ15465 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SHHQ15465 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SHHQ15465 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SHHQ15465 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SHHQ15465 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
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