Protein–RNA interactions for Protein: Q12277

RRP42, Exosome complex component RRP42, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRP42Q12277 RPL43AYPR043W 279 nt6.89□□□□□ -1.31
RRP42Q12277 DPM1YPR183W 804 nt6.89□□□□□ -1.31
RRP42Q12277 MPE1YKL059C 1326 nt6.89□□□□□ -1.31
RRP42Q12277 CDC7YDL017W 1524 nt6.89□□□□□ -1.31
RRP42Q12277 YOX1YML027W 1158 nt6.88□□□□□ -1.31
RRP42Q12277 MBF1YOR298C-A 456 nt6.88□□□□□ -1.31
RRP42Q12277 CAN1YEL063C 1773 nt6.87□□□□□ -1.31
RRP42Q12277 HOG1YLR113W 1308 nt6.87□□□□□ -1.31
RRP42Q12277 RTC4YNL254C 1206 nt6.87□□□□□ -1.31
RRP42Q12277 AIM46YHR199C 933 nt6.85□□□□□ -1.31
RRP42Q12277 YPL247CYPL247C 1572 nt6.85□□□□□ -1.31
RRP42Q12277 PGI1YBR196C 1665 nt6.84□□□□□ -1.31
RRP42Q12277 ERR3YMR323W 1314 nt6.84□□□□□ -1.31
RRP42Q12277 ERR1YOR393W 1314 nt6.84□□□□□ -1.31
RRP42Q12277 ERR2YPL281C 1314 nt6.84□□□□□ -1.31
RRP42Q12277 GET4YOR164C 939 nt6.84□□□□□ -1.31
RRP42Q12277 YPR130CYPR130C 408 nt6.83□□□□□ -1.32
RRP42Q12277 snR30snR30 606 nt6.83□□□□□ -1.32
RRP42Q12277 FLC2YAL053W 2352 nt6.83□□□□□ -1.32
RRP42Q12277 NUP57YGR119C 1626 nt6.83□□□□□ -1.32
RRP42Q12277 NAF1YNL124W 1479 nt6.82□□□□□ -1.32
RRP42Q12277 PDA1YER178W 1263 nt6.82□□□□□ -1.32
RRP42Q12277 DMC1YER179W 1005 nt6.82□□□□□ -1.32
RRP42Q12277 ERG27YLR100W 1044 nt6.82□□□□□ -1.32
RRP42Q12277 YMR253CYMR253C 1245 nt6.82□□□□□ -1.32
RRP42Q12277 FCP1YMR277W 2199 nt6.82□□□□□ -1.32
RRP42Q12277 RMD8YFR048W 1989 nt6.81□□□□□ -1.32
RRP42Q12277 COS10YNR075W 1125 nt6.81□□□□□ -1.32
RRP42Q12277 PLB2YMR006C 2121 nt6.8□□□□□ -1.32
RRP42Q12277 FCY2YER056C 1602 nt6.8□□□□□ -1.32
RRP42Q12277 AQR1YNL065W 1761 nt6.8□□□□□ -1.32
RRP42Q12277 CIA1YDR267C 993 nt6.8□□□□□ -1.32
RRP42Q12277 CMK2YOL016C 1344 nt6.79□□□□□ -1.32
RRP42Q12277 MHP1YJL042W 4197 nt6.79□□□□□ -1.32
RRP42Q12277 YLR162WYLR162W 357 nt6.79□□□□□ -1.32
RRP42Q12277 SUN4YNL066W 1263 nt6.79□□□□□ -1.32
RRP42Q12277 YKR018CYKR018C 2178 nt6.79□□□□□ -1.32
RRP42Q12277 THR1YHR025W 1074 nt6.78□□□□□ -1.32
RRP42Q12277 PRB1YEL060C 1908 nt6.78□□□□□ -1.32
RRP42Q12277 EXG2YDR261C 1689 nt6.77□□□□□ -1.32
RRP42Q12277 URA1YKL216W 945 nt6.77□□□□□ -1.33
RRP42Q12277 HTZ1YOL012C 405 nt6.77□□□□□ -1.33
RRP42Q12277 PHO85YPL031C 918 nt6.76□□□□□ -1.33
RRP42Q12277 YPR127WYPR127W 1038 nt6.76□□□□□ -1.33
RRP42Q12277 YCL049CYCL049C 939 nt6.76□□□□□ -1.33
RRP42Q12277 YCR061WYCR061W 1896 nt6.76□□□□□ -1.33
RRP42Q12277 BRN1YBL097W 2265 nt6.76□□□□□ -1.33
RRP42Q12277 TOD6YBL054W 1578 nt6.75□□□□□ -1.33
RRP42Q12277 YCR049CYCR049C 447 nt6.75□□□□□ -1.33
RRP42Q12277 YER137CYER137C 447 nt6.75□□□□□ -1.33
RRP42Q12277 LOT6YLR011W 576 nt6.75□□□□□ -1.33
RRP42Q12277 HEL1YKR017C 1656 nt6.74□□□□□ -1.33
RRP42Q12277 ENB1YOL158C 1821 nt6.74□□□□□ -1.33
RRP42Q12277 SEC24YIL109C 2781 nt6.74□□□□□ -1.33
RRP42Q12277 YNR005CYNR005C 405 nt6.74□□□□□ -1.33
RRP42Q12277 YCR041WYCR041W 333 nt6.73□□□□□ -1.33
RRP42Q12277 ZIM17YNL310C 525 nt6.73□□□□□ -1.33
RRP42Q12277 MCP1YOR228C 909 nt6.73□□□□□ -1.33
RRP42Q12277 LGE1YPL055C 999 nt6.73□□□□□ -1.33
RRP42Q12277 HPT1YDR399W 666 nt6.72□□□□□ -1.33
RRP42Q12277 SML1YML058W 315 nt6.72□□□□□ -1.33
RRP42Q12277 YOL099CYOL099C 492 nt6.72□□□□□ -1.33
RRP42Q12277 APE4YHR113W 1473 nt6.72□□□□□ -1.33
RRP42Q12277 SNF4YGL115W 969 nt6.71□□□□□ -1.34
RRP42Q12277 YAL045CYAL045C 309 nt6.71□□□□□ -1.34
RRP42Q12277 AAD14YNL331C 1131 nt6.71□□□□□ -1.34
RRP42Q12277 NTG2YOL043C 1143 nt6.71□□□□□ -1.34
RRP42Q12277 SPE3YPR069C 882 nt6.71□□□□□ -1.34
RRP42Q12277 POB3YML069W 1659 nt6.71□□□□□ -1.34
RRP42Q12277 CTA1YDR256C 1548 nt6.71□□□□□ -1.34
RRP42Q12277 DLD1YDL174C 1764 nt6.7□□□□□ -1.34
RRP42Q12277 YJL163CYJL163C 1668 nt6.69□□□□□ -1.34
RRP42Q12277 AIM2YAL049C 741 nt6.69□□□□□ -1.34
RRP42Q12277 MIX17YMR002W 471 nt6.69□□□□□ -1.34
RRP42Q12277 IRC5YFR038W 2562 nt6.69□□□□□ -1.34
RRP42Q12277 SMC5YOL034W 3282 nt6.69□□□□□ -1.34
RRP42Q12277 YLR112WYLR112W 420 nt6.68□□□□□ -1.34
RRP42Q12277 YNR001W-AYNR001W-A 219 nt6.68□□□□□ -1.34
RRP42Q12277 TDP1YBR223C 1635 nt6.68□□□□□ -1.34
RRP42Q12277 ERG10YPL028W 1197 nt6.67□□□□□ -1.34
RRP42Q12277 YPR076WYPR076W 375 nt6.67□□□□□ -1.34
RRP42Q12277 MSG5YNL053W 1470 nt6.66□□□□□ -1.34
RRP42Q12277 EDC3YEL015W 1656 nt6.66□□□□□ -1.34
RRP42Q12277 FIT2YOR382W 462 nt6.66□□□□□ -1.34
RRP42Q12277 PTC7YHR076W 1032 nt6.65□□□□□ -1.34
RRP42Q12277 YJL144WYJL144W 315 nt6.65□□□□□ -1.34
RRP42Q12277 YOL046CYOL046C 675 nt6.65□□□□□ -1.34
RRP42Q12277 SNT309YPR101W 528 nt6.65□□□□□ -1.34
RRP42Q12277 BNA3YJL060W 1335 nt6.65□□□□□ -1.35
RRP42Q12277 ECM27YJR106W 2178 nt6.65□□□□□ -1.35
RRP42Q12277 ACO1YLR304C 2337 nt6.65□□□□□ -1.35
RRP42Q12277 ICL2YPR006C 1728 nt6.64□□□□□ -1.35
RRP42Q12277 PLB3YOL011W 2061 nt6.64□□□□□ -1.35
RRP42Q12277 LDB7YBL006C 543 nt6.63□□□□□ -1.35
RRP42Q12277 MRPL19YNL185C 477 nt6.63□□□□□ -1.35
RRP42Q12277 VBA5YKR105C 1749 nt6.62□□□□□ -1.35
RRP42Q12277 BIO3YNR058W 1443 nt6.62□□□□□ -1.35
RRP42Q12277 AGX1YFL030W 1158 nt6.62□□□□□ -1.35
RRP42Q12277 YGL102CYGL102C 429 nt6.62□□□□□ -1.35
RRP42Q12277 YIP4YGL198W 708 nt6.62□□□□□ -1.35
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