Protein–RNA interactions for Protein: Q12221

PUF2, mRNA-binding protein PUF2, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 1,075 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF2Q12221 CDC7YDL017W 1524 nt7.22□□□□□ -1.25
PUF2Q12221 GNA1YFL017C 480 nt7.21□□□□□ -1.26
PUF2Q12221 ERG27YLR100W 1044 nt7.2□□□□□ -1.26
PUF2Q12221 LDB7YBL006C 543 nt7.2□□□□□ -1.26
PUF2Q12221 AAD14YNL331C 1131 nt7.2□□□□□ -1.26
PUF2Q12221 YOR041CYOR041C 432 nt7.2□□□□□ -1.26
PUF2Q12221 YPL264CYPL264C 1062 nt7.2□□□□□ -1.26
PUF2Q12221 HXT9YJL219W 1704 nt7.2□□□□□ -1.26
PUF2Q12221 YNR001W-AYNR001W-A 219 nt7.19□□□□□ -1.26
PUF2Q12221 ERG10YPL028W 1197 nt7.19□□□□□ -1.26
PUF2Q12221 PLB3YOL011W 2061 nt7.19□□□□□ -1.26 RIP-Chip
PUF2Q12221 MET30YIL046W 1923 nt7.19□□□□□ -1.26
PUF2Q12221 MSS51YLR203C 1311 nt7.18□□□□□ -1.26
PUF2Q12221 ERR3YMR323W 1314 nt7.17□□□□□ -1.26
PUF2Q12221 BRN1YBL097W 2265 nt7.16□□□□□ -1.26
PUF2Q12221 MAL31YBR298C 1845 nt7.16□□□□□ -1.26
PUF2Q12221 YNL190WYNL190W 615 nt7.16□□□□□ -1.26 RIP-Chip
PUF2Q12221 YOL046CYOL046C 675 nt7.16□□□□□ -1.26
PUF2Q12221 YOR111WYOR111W 699 nt7.16□□□□□ -1.26
PUF2Q12221 NAS6YGR232W 687 nt7.15□□□□□ -1.26
PUF2Q12221 HTZ1YOL012C 405 nt7.15□□□□□ -1.26
PUF2Q12221 CDC23YHR166C 1881 nt7.15□□□□□ -1.27
PUF2Q12221 YCR049CYCR049C 447 nt7.14□□□□□ -1.27
PUF2Q12221 YJL163CYJL163C 1668 nt7.14□□□□□ -1.27
PUF2Q12221 GTS1YGL181W 1191 nt7.13□□□□□ -1.27
PUF2Q12221 YNR005CYNR005C 405 nt7.13□□□□□ -1.27
PUF2Q12221 RPL43AYPR043W 279 nt7.13□□□□□ -1.27 RIP-Chip
PUF2Q12221 NDE1YMR145C 1683 nt7.12□□□□□ -1.27
PUF2Q12221 APE4YHR113W 1473 nt7.12□□□□□ -1.27
PUF2Q12221 CBK1YNL161W 2271 nt7.12□□□□□ -1.27
PUF2Q12221 EXG2YDR261C 1689 nt7.12□□□□□ -1.27
PUF2Q12221 FLC2YAL053W 2352 nt7.11□□□□□ -1.27
PUF2Q12221 CYS4YGR155W 1524 nt7.11□□□□□ -1.27
PUF2Q12221 YHR131CYHR131C 2553 nt7.11□□□□□ -1.27
PUF2Q12221 LAS17YOR181W 1902 nt7.1□□□□□ -1.27
PUF2Q12221 AGX1YFL030W 1158 nt7.09□□□□□ -1.27
PUF2Q12221 NTG2YOL043C 1143 nt7.09□□□□□ -1.27
PUF2Q12221 FIT2YOR382W 462 nt7.09□□□□□ -1.27
PUF2Q12221 CTA1YDR256C 1548 nt7.09□□□□□ -1.27
PUF2Q12221 YEL023CYEL023C 2049 nt7.09□□□□□ -1.27
PUF2Q12221 PMA2YPL036W 2844 nt7.09□□□□□ -1.28 RIP-Chip
PUF2Q12221 FRT1YOR324C 1809 nt7.08□□□□□ -1.28
PUF2Q12221 YOL099CYOL099C 492 nt7.08□□□□□ -1.28
PUF2Q12221 YPR076WYPR076W 375 nt7.08□□□□□ -1.28
PUF2Q12221 FCY2YER056C 1602 nt7.08□□□□□ -1.28
PUF2Q12221 NUP57YGR119C 1626 nt7.08□□□□□ -1.28
PUF2Q12221 YLL058WYLL058W 1728 nt7.07□□□□□ -1.28
PUF2Q12221 HPT1YDR399W 666 nt7.07□□□□□ -1.28
PUF2Q12221 YAL045CYAL045C 309 nt7.07□□□□□ -1.28
PUF2Q12221 PHO85YPL031C 918 nt7.07□□□□□ -1.28
PUF2Q12221 CCR4YAL021C 2514 nt7.07□□□□□ -1.28
PUF2Q12221 RMD8YFR048W 1989 nt7.07□□□□□ -1.28
PUF2Q12221 PRC1YMR297W 1599 nt7.07□□□□□ -1.28
PUF2Q12221 YIP4YGL198W 708 nt7.06□□□□□ -1.28
PUF2Q12221 THR1YHR025W 1074 nt7.06□□□□□ -1.28
PUF2Q12221 YKR018CYKR018C 2178 nt7.06□□□□□ -1.28
PUF2Q12221 SSC1YJR045C 1965 nt7.06□□□□□ -1.28
PUF2Q12221 MGM101YJR144W 810 nt7.05□□□□□ -1.28 RIP-Chip
PUF2Q12221 MLS1YNL117W 1665 nt7.05□□□□□ -1.28
PUF2Q12221 COX15YER141W 1461 nt7.04□□□□□ -1.28
PUF2Q12221 FCY22YER060W-A 1593 nt7.04□□□□□ -1.28 RIP-Chip
PUF2Q12221 PPH21YDL134C 1110 nt7.04□□□□□ -1.28
PUF2Q12221 HOC1YJR075W 1191 nt7.04□□□□□ -1.28
PUF2Q12221 ECM27YJR106W 2178 nt7.03□□□□□ -1.28
PUF2Q12221 BEM1YBR200W 1656 nt7.03□□□□□ -1.28
PUF2Q12221 LIA1YJR070C 978 nt7.03□□□□□ -1.28
PUF2Q12221 AIM34YMR003W 597 nt7.03□□□□□ -1.28 RIP-Chip
PUF2Q12221 SUN4YNL066W 1263 nt7.03□□□□□ -1.28
PUF2Q12221 YJL045WYJL045W 1905 nt7.03□□□□□ -1.28
PUF2Q12221 CAN1YEL063C 1773 nt7.03□□□□□ -1.28
PUF2Q12221 SRY1YKL218C 981 nt7.02□□□□□ -1.29
PUF2Q12221 SPE4YLR146C 903 nt7.02□□□□□ -1.29
PUF2Q12221 GUT1YHL032C 2130 nt7.01□□□□□ -1.29
PUF2Q12221 FMP40YPL222W 2067 nt7.01□□□□□ -1.29
PUF2Q12221 STF1YDL130W-A 261 nt7.01□□□□□ -1.29
PUF2Q12221 ENB1YOL158C 1821 nt7.01□□□□□ -1.29 RIP-Chip
PUF2Q12221 NUP49YGL172W 1419 nt7.01□□□□□ -1.29 RIP-Chip
PUF2Q12221 SEC24YIL109C 2781 nt7□□□□□ -1.29
PUF2Q12221 MRPL35YDR322W 1104 nt7□□□□□ -1.29
PUF2Q12221 RPL2BYIL018W 765 nt7□□□□□ -1.29
PUF2Q12221 REC107YJR021C 945 nt7□□□□□ -1.29
PUF2Q12221 YPL041CYPL041C 624 nt7□□□□□ -1.29
PUF2Q12221 ASR1YPR093C 867 nt7□□□□□ -1.29
PUF2Q12221 CRH1YGR189C 1524 nt7□□□□□ -1.29 RIP-Chip
PUF2Q12221 MSC3YLR219W 2187 nt6.99□□□□□ -1.29 RIP-Chip
PUF2Q12221 IRC5YFR038W 2562 nt6.99□□□□□ -1.29
PUF2Q12221 GPD1YDL022W 1176 nt6.99□□□□□ -1.29
PUF2Q12221 GGC1YDL198C 903 nt6.99□□□□□ -1.29
PUF2Q12221 PMP3YDR276C 168 nt6.99□□□□□ -1.29 RIP-Chip
PUF2Q12221 YPR127WYPR127W 1038 nt6.99□□□□□ -1.29
PUF2Q12221 ICP55YER078C 1536 nt6.99□□□□□ -1.29
PUF2Q12221 ITR1YDR497C 1755 nt6.99□□□□□ -1.29
PUF2Q12221 YGL102CYGL102C 429 nt6.98□□□□□ -1.29
PUF2Q12221 ARO7YPR060C 771 nt6.98□□□□□ -1.29
PUF2Q12221 MSG5YNL053W 1470 nt6.98□□□□□ -1.29
PUF2Q12221 SPG5YMR191W 1122 nt6.97□□□□□ -1.29
PUF2Q12221 LSC1YOR142W 990 nt6.97□□□□□ -1.29
PUF2Q12221 PRB1YEL060C 1908 nt6.97□□□□□ -1.29
PUF2Q12221 MHP1YJL042W 4197 nt6.96□□□□□ -1.29
PUF2Q12221 DLD1YDL174C 1764 nt6.96□□□□□ -1.3
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