Protein–RNA interactions for Protein: Q08923

CTI6, Histone deacetylase complex subunit CTI6, yeastyeast

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CTI6Q08923 PRC1YMR297W 1599 nt8.58□□□□□ -1.04
CTI6Q08923 SAL1YNL083W 1485 nt8.57□□□□□ -1.04
CTI6Q08923 LAS17YOR181W 1902 nt8.57□□□□□ -1.04
CTI6Q08923 ITR1YDR497C 1755 nt8.56□□□□□ -1.04
CTI6Q08923 YEL075W-AYEL075W-A 612 nt8.56□□□□□ -1.04
CTI6Q08923 PET10YKR046C 852 nt8.56□□□□□ -1.04
CTI6Q08923 YLR463CYLR463C 552 nt8.56□□□□□ -1.04
CTI6Q08923 HXT9YJL219W 1704 nt8.55□□□□□ -1.04
CTI6Q08923 VPS65YLR322W 315 nt8.55□□□□□ -1.04
CTI6Q08923 AVL9YLR114C 2295 nt8.54□□□□□ -1.04
CTI6Q08923 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt8.53□□□□□ -1.04
CTI6Q08923 YRF1-1YDR545W 5391 nt8.52□□□□□ -1.05
CTI6Q08923 YRF1-5YLR467W 5391 nt8.52□□□□□ -1.05
CTI6Q08923 YRF1-8YOR396W 5391 nt8.52□□□□□ -1.05
CTI6Q08923 MED6YHR058C 888 nt8.52□□□□□ -1.05
CTI6Q08923 YNL190WYNL190W 615 nt8.52□□□□□ -1.05
CTI6Q08923 YNR005CYNR005C 405 nt8.52□□□□□ -1.05
CTI6Q08923 LSC1YOR142W 990 nt8.52□□□□□ -1.05
CTI6Q08923 BRN1YBL097W 2265 nt8.51□□□□□ -1.05
CTI6Q08923 RUP1YOR138C 2016 nt8.51□□□□□ -1.05
CTI6Q08923 CAR2YLR438W 1275 nt8.51□□□□□ -1.05
CTI6Q08923 YDR306CYDR306C 1437 nt8.51□□□□□ -1.05
CTI6Q08923 MRPS18YNL306W 654 nt8.5□□□□□ -1.05
CTI6Q08923 YBL113CYBL113C 2379 nt8.5□□□□□ -1.05
CTI6Q08923 ADE5,7YGL234W 2409 nt8.5□□□□□ -1.05
CTI6Q08923 PET117YER058W 324 nt8.49□□□□□ -1.05
CTI6Q08923 ASF1YJL115W 840 nt8.49□□□□□ -1.05
CTI6Q08923 YPL264CYPL264C 1062 nt8.49□□□□□ -1.05
CTI6Q08923 RSC4YKR008W 1878 nt8.49□□□□□ -1.05
CTI6Q08923 DMC1YER179W 1005 nt8.48□□□□□ -1.05
CTI6Q08923 YLR361C-AYLR361C-A 297 nt8.48□□□□□ -1.05
CTI6Q08923 YML018CYML018C 1182 nt8.48□□□□□ -1.05
CTI6Q08923 BEM1YBR200W 1656 nt8.47□□□□□ -1.05
CTI6Q08923 MET30YIL046W 1923 nt8.47□□□□□ -1.05
CTI6Q08923 FMO1YHR176W 1299 nt8.47□□□□□ -1.05
CTI6Q08923 GPD2YOL059W 1323 nt8.47□□□□□ -1.05
CTI6Q08923 HEM14YER014W 1620 nt8.47□□□□□ -1.05
CTI6Q08923 GCG1YER163C 699 nt8.46□□□□□ -1.06
CTI6Q08923 CKB1YGL019W 837 nt8.46□□□□□ -1.06
CTI6Q08923 TAF9YMR236W 474 nt8.46□□□□□ -1.06
CTI6Q08923 YBR113WYBR113W 483 nt8.46□□□□□ -1.06
CTI6Q08923 RSC9YML127W 1746 nt8.46□□□□□ -1.06
CTI6Q08923 CDC1YDR182W 1476 nt8.45□□□□□ -1.06
CTI6Q08923 TOP3YLR234W 1971 nt8.45□□□□□ -1.06
CTI6Q08923 CHA1YCL064C 1083 nt8.45□□□□□ -1.06
CTI6Q08923 RRP9YPR137W 1722 nt8.45□□□□□ -1.06
CTI6Q08923 OSW2YLR054C 2175 nt8.45□□□□□ -1.06
CTI6Q08923 NUP49YGL172W 1419 nt8.45□□□□□ -1.06
CTI6Q08923 YKL147CYKL147C 618 nt8.44□□□□□ -1.06
CTI6Q08923 YKR018CYKR018C 2178 nt8.43□□□□□ -1.06
CTI6Q08923 PMA2YPL036W 2844 nt8.42□□□□□ -1.06
CTI6Q08923 SNF7YLR025W 723 nt8.42□□□□□ -1.06
CTI6Q08923 YLL058WYLL058W 1728 nt8.42□□□□□ -1.06
CTI6Q08923 NTG2YOL043C 1143 nt8.41□□□□□ -1.06
CTI6Q08923 PUS7YOR243C 2031 nt8.41□□□□□ -1.06
CTI6Q08923 AFG3YER017C 2286 nt8.4□□□□□ -1.06
CTI6Q08923 YNL092WYNL092W 1203 nt8.4□□□□□ -1.06
CTI6Q08923 RCF2YNR018W 675 nt8.4□□□□□ -1.06
CTI6Q08923 YIP4YGL198W 708 nt8.39□□□□□ -1.07
CTI6Q08923 SPE4YLR146C 903 nt8.39□□□□□ -1.07
CTI6Q08923 YOR200WYOR200W 399 nt8.39□□□□□ -1.07
CTI6Q08923 ERG8YMR220W 1356 nt8.38□□□□□ -1.07
CTI6Q08923 YOL099CYOL099C 492 nt8.38□□□□□ -1.07
CTI6Q08923 RDR1YOR380W 1641 nt8.37□□□□□ -1.07
CTI6Q08923 SUF3tG(CCC)D 72 nt8.37□□□□□ -1.07
CTI6Q08923 TFG2YGR005C 1203 nt8.37□□□□□ -1.07
CTI6Q08923 HNM1YGL077C 1692 nt8.37□□□□□ -1.07
CTI6Q08923 SEC24YIL109C 2781 nt8.36□□□□□ -1.07
CTI6Q08923 ERR1YOR393W 1314 nt8.36□□□□□ -1.07
CTI6Q08923 ERR2YPL281C 1314 nt8.36□□□□□ -1.07
CTI6Q08923 TSR2YLR435W 618 nt8.36□□□□□ -1.07
CTI6Q08923 YMR122CYMR122C 375 nt8.36□□□□□ -1.07
CTI6Q08923 YAH1YPL252C 519 nt8.36□□□□□ -1.07
CTI6Q08923 ADE2YOR128C 1716 nt8.36□□□□□ -1.07
CTI6Q08923 YDR187CYDR187C 519 nt8.35□□□□□ -1.07
CTI6Q08923 HIS1YER055C 894 nt8.35□□□□□ -1.07
CTI6Q08923 IRC7YFR055W 1023 nt8.35□□□□□ -1.07
CTI6Q08923 FSF1YOR271C 984 nt8.35□□□□□ -1.07
CTI6Q08923 MAM3YOL060C 2121 nt8.35□□□□□ -1.07
CTI6Q08923 TCB1YOR086C 3561 nt8.35□□□□□ -1.07
CTI6Q08923 ERG24YNL280C 1317 nt8.34□□□□□ -1.07
CTI6Q08923 AFG2YLR397C 2343 nt8.34□□□□□ -1.07
CTI6Q08923 ERG27YLR100W 1044 nt8.34□□□□□ -1.07
CTI6Q08923 LEO1YOR123C 1395 nt8.34□□□□□ -1.07
CTI6Q08923 OM45YIL136W 1182 nt8.33□□□□□ -1.08
CTI6Q08923 TDH2YJR009C 999 nt8.33□□□□□ -1.08
CTI6Q08923 MSC3YLR219W 2187 nt8.33□□□□□ -1.08
CTI6Q08923 COQ3YOL096C 939 nt8.33□□□□□ -1.08
CTI6Q08923 MET8YBR213W 825 nt8.33□□□□□ -1.08
CTI6Q08923 ICP55YER078C 1536 nt8.33□□□□□ -1.08
CTI6Q08923 RFC1YOR217W 2586 nt8.32□□□□□ -1.08
CTI6Q08923 DTR1YBR180W 1719 nt8.31□□□□□ -1.08
CTI6Q08923 TOK1YJL093C 2076 nt8.31□□□□□ -1.08
CTI6Q08923 MSP1YGR028W 1089 nt8.3□□□□□ -1.08
CTI6Q08923 RNH201YNL072W 924 nt8.3□□□□□ -1.08
CTI6Q08923 RMD8YFR048W 1989 nt8.3□□□□□ -1.08
CTI6Q08923 YLL056CYLL056C 897 nt8.29□□□□□ -1.08
CTI6Q08923 YOR041CYOR041C 432 nt8.29□□□□□ -1.08
CTI6Q08923 TAE1YBR261C 699 nt8.29□□□□□ -1.08
CTI6Q08923 PGI1YBR196C 1665 nt8.29□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 18.1 ms