Protein–RNA interactions for Protein: Q06702

CDA1, Chitin deacetylase 1, yeastyeast

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CDA1Q06702 MGM101YJR144W 810 nt7.35□□□□□ -1.23
CDA1Q06702 FUS3YBL016W 1062 nt7.35□□□□□ -1.23
CDA1Q06702 YNL234WYNL234W 1281 nt7.35□□□□□ -1.23
CDA1Q06702 ELP4YPL101W 1371 nt7.34□□□□□ -1.23
CDA1Q06702 YPL247CYPL247C 1572 nt7.34□□□□□ -1.23
CDA1Q06702 MAK32YCR019W 1092 nt7.34□□□□□ -1.23
CDA1Q06702 TPI1YDR050C 747 nt7.34□□□□□ -1.23
CDA1Q06702 MMS21YEL019C 804 nt7.34□□□□□ -1.23
CDA1Q06702 APT1YML022W 564 nt7.34□□□□□ -1.23
CDA1Q06702 CDC23YHR166C 1881 nt7.34□□□□□ -1.23
CDA1Q06702 PET494YNR045W 1470 nt7.33□□□□□ -1.24
CDA1Q06702 YHR145CYHR145C 357 nt7.33□□□□□ -1.24
CDA1Q06702 YJL043WYJL043W 774 nt7.33□□□□□ -1.24
CDA1Q06702 YML034C-AYML034C-A 399 nt7.33□□□□□ -1.24
CDA1Q06702 TAF4YMR005W 1167 nt7.33□□□□□ -1.24
CDA1Q06702 YMR306C-AYMR306C-A 390 nt7.33□□□□□ -1.24
CDA1Q06702 PRE2YPR103W 864 nt7.33□□□□□ -1.24
CDA1Q06702 YNL040WYNL040W 1371 nt7.33□□□□□ -1.24
CDA1Q06702 ADE5,7YGL234W 2409 nt7.32□□□□□ -1.24
CDA1Q06702 YDR215CYDR215C 414 nt7.32□□□□□ -1.24
CDA1Q06702 CAR2YLR438W 1275 nt7.32□□□□□ -1.24
CDA1Q06702 DAL80YKR034W 810 nt7.31□□□□□ -1.24
CDA1Q06702 TCB1YOR086C 3561 nt7.3□□□□□ -1.24
CDA1Q06702 STE3YKL178C 1413 nt7.3□□□□□ -1.24
CDA1Q06702 ADE1YAR015W 921 nt7.3□□□□□ -1.24
CDA1Q06702 YBL111CYBL111C 2004 nt7.29□□□□□ -1.24
CDA1Q06702 MPC1YGL080W 393 nt7.29□□□□□ -1.24
CDA1Q06702 GTS1YGL181W 1191 nt7.29□□□□□ -1.24
CDA1Q06702 SNF7YLR025W 723 nt7.29□□□□□ -1.24
CDA1Q06702 CKI1YLR133W 1749 nt7.29□□□□□ -1.24
CDA1Q06702 YNL295WYNL295W 1575 nt7.29□□□□□ -1.24
CDA1Q06702 FLC2YAL053W 2352 nt7.28□□□□□ -1.24
CDA1Q06702 YDR476CYDR476C 675 nt7.28□□□□□ -1.24
CDA1Q06702 TDH1YJL052W 999 nt7.28□□□□□ -1.24
CDA1Q06702 YER147C-AYER147C-A 411 nt7.27□□□□□ -1.25
CDA1Q06702 COS6YGR295C 1146 nt7.27□□□□□ -1.25
CDA1Q06702 CTR1YPR124W 1221 nt7.27□□□□□ -1.25
CDA1Q06702 MRPL36YBR122C 534 nt7.27□□□□□ -1.25
CDA1Q06702 RTC2YBR147W 891 nt7.27□□□□□ -1.25
CDA1Q06702 LYS12YIL094C 1116 nt7.26□□□□□ -1.25
CDA1Q06702 YNR001W-AYNR001W-A 219 nt7.26□□□□□ -1.25
CDA1Q06702 YEL023CYEL023C 2049 nt7.26□□□□□ -1.25
CDA1Q06702 NUP57YGR119C 1626 nt7.26□□□□□ -1.25
CDA1Q06702 NUP53YMR153W 1428 nt7.26□□□□□ -1.25
CDA1Q06702 ECM10YEL030W 1935 nt7.25□□□□□ -1.25
CDA1Q06702 PRY2YKR013W 990 nt7.25□□□□□ -1.25
CDA1Q06702 INP54YOL065C 1155 nt7.25□□□□□ -1.25
CDA1Q06702 RFS1YBR052C 633 nt7.25□□□□□ -1.25
CDA1Q06702 YAH1YPL252C 519 nt7.25□□□□□ -1.25
CDA1Q06702 HXT13YEL069C 1695 nt7.25□□□□□ -1.25
CDA1Q06702 MSS51YLR203C 1311 nt7.25□□□□□ -1.25
CDA1Q06702 FCP1YMR277W 2199 nt7.25□□□□□ -1.25
CDA1Q06702 RRP43YCR035C 1185 nt7.24□□□□□ -1.25
CDA1Q06702 ENB1YOL158C 1821 nt7.24□□□□□ -1.25
CDA1Q06702 CAN1YEL063C 1773 nt7.23□□□□□ -1.25
CDA1Q06702 PPS1YBR276C 2424 nt7.23□□□□□ -1.25
CDA1Q06702 COS10YNR075W 1125 nt7.22□□□□□ -1.25
CDA1Q06702 NDJ1YOL104C 1059 nt7.22□□□□□ -1.25
CDA1Q06702 DSE3YOR264W 1293 nt7.22□□□□□ -1.25
CDA1Q06702 PPZ2YDR436W 2133 nt7.22□□□□□ -1.25
CDA1Q06702 STF1YDL130W-A 261 nt7.21□□□□□ -1.26
CDA1Q06702 YDR327WYDR327W 327 nt7.21□□□□□ -1.26
CDA1Q06702 YGR068W-AYGR068W-A 96 nt7.21□□□□□ -1.26
CDA1Q06702 OPI1YHL020C 1215 nt7.21□□□□□ -1.26
CDA1Q06702 MIX17YMR002W 471 nt7.21□□□□□ -1.26
CDA1Q06702 CDC13YDL220C 2775 nt7.2□□□□□ -1.26
CDA1Q06702 SPS1YDR523C 1473 nt7.2□□□□□ -1.26
CDA1Q06702 YGL260WYGL260W 231 nt7.2□□□□□ -1.26
CDA1Q06702 YHR131CYHR131C 2553 nt7.2□□□□□ -1.26
CDA1Q06702 SPR1YOR190W 1338 nt7.2□□□□□ -1.26
CDA1Q06702 RPR1RPR1 369 nt7.19□□□□□ -1.26
CDA1Q06702 PSA1YDL055C 1086 nt7.18□□□□□ -1.26
CDA1Q06702 SUA5YGL169W 1281 nt7.18□□□□□ -1.26
CDA1Q06702 YKL147CYKL147C 618 nt7.18□□□□□ -1.26
CDA1Q06702 LIP5YOR196C 1245 nt7.18□□□□□ -1.26
CDA1Q06702 YJL045WYJL045W 1905 nt7.18□□□□□ -1.26
CDA1Q06702 BDS1YOL164W 1941 nt7.18□□□□□ -1.26
CDA1Q06702 AFG3YER017C 2286 nt7.18□□□□□ -1.26
CDA1Q06702 PNS1YOR161C 1620 nt7.18□□□□□ -1.26
CDA1Q06702 YKR023WYKR023W 1593 nt7.17□□□□□ -1.26
CDA1Q06702 SLD7YOR060C 774 nt7.17□□□□□ -1.26
CDA1Q06702 PSP2YML017W 1782 nt7.17□□□□□ -1.26
CDA1Q06702 HAC1YFL031W 717 nt7.16□□□□□ -1.26
CDA1Q06702 RAI1YGL246C 1164 nt7.16□□□□□ -1.26
CDA1Q06702 YIL092WYIL092W 1902 nt7.16□□□□□ -1.26
CDA1Q06702 ERG24YNL280C 1317 nt7.16□□□□□ -1.26
CDA1Q06702 FCY2YER056C 1602 nt7.16□□□□□ -1.26
CDA1Q06702 MSB3YNL293W 1902 nt7.15□□□□□ -1.26
CDA1Q06702 LOT6YLR011W 576 nt7.15□□□□□ -1.26
CDA1Q06702 MRI1YPR118W 1236 nt7.15□□□□□ -1.26
CDA1Q06702 YPT10YBR264C 600 nt7.15□□□□□ -1.26
CDA1Q06702 SVF1YDR346C 1446 nt7.15□□□□□ -1.27
CDA1Q06702 EXG2YDR261C 1689 nt7.15□□□□□ -1.27
CDA1Q06702 SRF1YDL133W 1314 nt7.14□□□□□ -1.27
CDA1Q06702 TAF11YML015C 1041 nt7.14□□□□□ -1.27
CDA1Q06702 PEX12YMR026C 1200 nt7.14□□□□□ -1.27
CDA1Q06702 CPT1YNL130C 1182 nt7.14□□□□□ -1.27
CDA1Q06702 CCR4YAL021C 2514 nt7.13□□□□□ -1.27
CDA1Q06702 ATG23YLR431C 1362 nt7.13□□□□□ -1.27
CDA1Q06702 YML079WYML079W 606 nt7.13□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.2 ms