Protein–RNA interactions for Protein: P34228

SEF1, Putative transcription factor SEF1, yeastyeast

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Length 1,148 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEF1P34228 CIR2YOR356W 1896 nt6.73□□□□□ -1.33
SEF1P34228 YGL081WYGL081W 963 nt6.72□□□□□ -1.33
SEF1P34228 YHR033WYHR033W 1272 nt6.72□□□□□ -1.33
SEF1P34228 HAM1YJR069C 594 nt6.72□□□□□ -1.33
SEF1P34228 INP54YOL065C 1155 nt6.72□□□□□ -1.33
SEF1P34228 CDC3YLR314C 1563 nt6.71□□□□□ -1.34
SEF1P34228 PSA1YDL055C 1086 nt6.71□□□□□ -1.34
SEF1P34228 YBR226CYBR226C 411 nt6.71□□□□□ -1.34
SEF1P34228 MPH3YJR160C 1809 nt6.71□□□□□ -1.34
SEF1P34228 HRB1YNL004W 1365 nt6.7□□□□□ -1.34
SEF1P34228 TRR1YDR353W 960 nt6.7□□□□□ -1.34
SEF1P34228 LCP5YER127W 1074 nt6.7□□□□□ -1.34
SEF1P34228 TRR2YHR106W 1029 nt6.7□□□□□ -1.34
SEF1P34228 PRS4YBL068W 981 nt6.7□□□□□ -1.34
SEF1P34228 ICL2YPR006C 1728 nt6.7□□□□□ -1.34
SEF1P34228 TPO1YLL028W 1761 nt6.69□□□□□ -1.34
SEF1P34228 SNU71YGR013W 1863 nt6.69□□□□□ -1.34
SEF1P34228 SPS1YDR523C 1473 nt6.69□□□□□ -1.34
SEF1P34228 ATG17YLR423C 1254 nt6.69□□□□□ -1.34
SEF1P34228 YML034C-AYML034C-A 399 nt6.68□□□□□ -1.34
SEF1P34228 REC114YMR133W 1287 nt6.68□□□□□ -1.34
SEF1P34228 PMT1YDL095W 2454 nt6.68□□□□□ -1.34
SEF1P34228 CDC16YKL022C 2523 nt6.68□□□□□ -1.34
SEF1P34228 BIO3YNR058W 1443 nt6.67□□□□□ -1.34
SEF1P34228 VTS1YOR359W 1572 nt6.67□□□□□ -1.34
SEF1P34228 YMR074CYMR074C 438 nt6.67□□□□□ -1.34
SEF1P34228 HSM3YBR272C 1443 nt6.67□□□□□ -1.34
SEF1P34228 TOS2YGR221C 1869 nt6.66□□□□□ -1.34
SEF1P34228 ACO1YLR304C 2337 nt6.66□□□□□ -1.34
SEF1P34228 YDR215CYDR215C 414 nt6.66□□□□□ -1.34
SEF1P34228 CKB1YGL019W 837 nt6.66□□□□□ -1.34
SEF1P34228 PET10YKR046C 852 nt6.66□□□□□ -1.34
SEF1P34228 PEX28YHR150W 1740 nt6.66□□□□□ -1.34
SEF1P34228 MET13YGL125W 1803 nt6.66□□□□□ -1.34
SEF1P34228 OSM1YJR051W 1506 nt6.66□□□□□ -1.34
SEF1P34228 GET2YER083C 858 nt6.65□□□□□ -1.34
SEF1P34228 YER137CYER137C 447 nt6.65□□□□□ -1.34
SEF1P34228 AVL9YLR114C 2295 nt6.65□□□□□ -1.35
SEF1P34228 AGP2YBR132C 1791 nt6.64□□□□□ -1.35
SEF1P34228 YNL017CYNL017C 339 nt6.64□□□□□ -1.35
SEF1P34228 DSC3YOR223W 879 nt6.64□□□□□ -1.35
SEF1P34228 YPT10YBR264C 600 nt6.64□□□□□ -1.35
SEF1P34228 BNA3YJL060W 1335 nt6.64□□□□□ -1.35
SEF1P34228 PPS1YBR276C 2424 nt6.64□□□□□ -1.35
SEF1P34228 PPZ2YDR436W 2133 nt6.63□□□□□ -1.35
SEF1P34228 SGF73YGL066W 1974 nt6.63□□□□□ -1.35
SEF1P34228 PRY2YKR013W 990 nt6.63□□□□□ -1.35
SEF1P34228 DAL80YKR034W 810 nt6.63□□□□□ -1.35
SEF1P34228 YPC1YBR183W 951 nt6.63□□□□□ -1.35
SEF1P34228 BNS1YGR230W 414 nt6.62□□□□□ -1.35
SEF1P34228 YLR184WYLR184W 348 nt6.62□□□□□ -1.35
SEF1P34228 LDB7YBL006C 543 nt6.62□□□□□ -1.35
SEF1P34228 RCF2YNR018W 675 nt6.62□□□□□ -1.35
SEF1P34228 PIL1YGR086C 1020 nt6.61□□□□□ -1.35
SEF1P34228 OPI1YHL020C 1215 nt6.61□□□□□ -1.35
SEF1P34228 ERV25YML012W 636 nt6.61□□□□□ -1.35
SEF1P34228 SML1YML058W 315 nt6.61□□□□□ -1.35
SEF1P34228 YOR389WYOR389W 1875 nt6.61□□□□□ -1.35
SEF1P34228 PRP2YNR011C 2631 nt6.6□□□□□ -1.35
SEF1P34228 PDA1YER178W 1263 nt6.6□□□□□ -1.35
SEF1P34228 SNF7YLR025W 723 nt6.6□□□□□ -1.35
SEF1P34228 CAR2YLR438W 1275 nt6.6□□□□□ -1.35
SEF1P34228 AVO2YMR068W 1281 nt6.6□□□□□ -1.35
SEF1P34228 ERG10YPL028W 1197 nt6.6□□□□□ -1.35
SEF1P34228 PDC5YLR134W 1692 nt6.6□□□□□ -1.35
SEF1P34228 BDS1YOL164W 1941 nt6.6□□□□□ -1.35
SEF1P34228 SKP1YDR328C 585 nt6.59□□□□□ -1.35
SEF1P34228 RRP46YGR095C 672 nt6.59□□□□□ -1.35
SEF1P34228 VPS65YLR322W 315 nt6.59□□□□□ -1.35
SEF1P34228 SUN4YNL066W 1263 nt6.59□□□□□ -1.35
SEF1P34228 ATP4YPL078C 735 nt6.59□□□□□ -1.35
SEF1P34228 snR30snR30 606 nt6.59□□□□□ -1.35
SEF1P34228 GDA1YEL042W 1557 nt6.59□□□□□ -1.35
SEF1P34228 CYS4YGR155W 1524 nt6.59□□□□□ -1.35
SEF1P34228 SSC1YJR045C 1965 nt6.58□□□□□ -1.36
SEF1P34228 POX1YGL205W 2247 nt6.58□□□□□ -1.36
SEF1P34228 AI5_BETAQ0075 1065 nt6.58□□□□□ -1.36
SEF1P34228 YOR041CYOR041C 432 nt6.58□□□□□ -1.36
SEF1P34228 RSC9YML127W 1746 nt6.58□□□□□ -1.36
SEF1P34228 YKR018CYKR018C 2178 nt6.57□□□□□ -1.36
SEF1P34228 DCR2YLR361C 1737 nt6.57□□□□□ -1.36
SEF1P34228 YGR068W-AYGR068W-A 96 nt6.57□□□□□ -1.36
SEF1P34228 YML122CYML122C 381 nt6.57□□□□□ -1.36
SEF1P34228 NAF1YNL124W 1479 nt6.57□□□□□ -1.36
SEF1P34228 BUD9YGR041W 1644 nt6.57□□□□□ -1.36
SEF1P34228 RUP1YOR138C 2016 nt6.57□□□□□ -1.36
SEF1P34228 GPA1YHR005C 1419 nt6.56□□□□□ -1.36
SEF1P34228 ADE17YMR120C 1779 nt6.56□□□□□ -1.36
SEF1P34228 LEO1YOR123C 1395 nt6.56□□□□□ -1.36
SEF1P34228 OPI7YDR360W 435 nt6.55□□□□□ -1.36
SEF1P34228 HGH1YGR187C 1185 nt6.55□□□□□ -1.36
SEF1P34228 AIM20YIL158W 615 nt6.55□□□□□ -1.36
SEF1P34228 NMD5YJR132W 3147 nt6.55□□□□□ -1.36
SEF1P34228 YOS9YDR057W 1629 nt6.54□□□□□ -1.36
SEF1P34228 NFS1YCL017C 1494 nt6.54□□□□□ -1.36
SEF1P34228 ASN2YGR124W 1719 nt6.54□□□□□ -1.36
SEF1P34228 RGT2YDL138W 2292 nt6.54□□□□□ -1.36
SEF1P34228 YJL213WYJL213W 996 nt6.54□□□□□ -1.36
SEF1P34228 FCY22YER060W-A 1593 nt6.53□□□□□ -1.36
SEF1P34228 DML1YMR211W 1428 nt6.53□□□□□ -1.36
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