Protein–RNA interactions for Protein: P20849

COL9A1, Collagen alpha-1(IX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A1P20849 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL9A1P20849 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL9A1P20849 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL9A1P20849 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL9A1P20849 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL9A1P20849 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COL9A1P20849 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
COL9A1P20849 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
COL9A1P20849 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL9A1P20849 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL9A1P20849 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL9A1P20849 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
COL9A1P20849 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
COL9A1P20849 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL9A1P20849 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL9A1P20849 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL9A1P20849 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL9A1P20849 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL9A1P20849 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL9A1P20849 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
COL9A1P20849 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL9A1P20849 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
COL9A1P20849 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
COL9A1P20849 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL9A1P20849 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL9A1P20849 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL9A1P20849 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL9A1P20849 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL9A1P20849 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL9A1P20849 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL9A1P20849 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL9A1P20849 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
COL9A1P20849 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
COL9A1P20849 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
COL9A1P20849 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COL9A1P20849 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COL9A1P20849 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26■■□□□ 1.75
COL9A1P20849 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COL9A1P20849 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL9A1P20849 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL9A1P20849 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL9A1P20849 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL9A1P20849 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL9A1P20849 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
COL9A1P20849 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COL9A1P20849 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COL9A1P20849 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COL9A1P20849 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
COL9A1P20849 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
COL9A1P20849 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
COL9A1P20849 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COL9A1P20849 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
COL9A1P20849 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
COL9A1P20849 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
COL9A1P20849 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
COL9A1P20849 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
COL9A1P20849 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
COL9A1P20849 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
COL9A1P20849 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
COL9A1P20849 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
COL9A1P20849 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
COL9A1P20849 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
COL9A1P20849 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
COL9A1P20849 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
COL9A1P20849 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
COL9A1P20849 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
COL9A1P20849 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
COL9A1P20849 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
COL9A1P20849 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
COL9A1P20849 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
COL9A1P20849 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
COL9A1P20849 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
COL9A1P20849 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
COL9A1P20849 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
COL9A1P20849 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
COL9A1P20849 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
COL9A1P20849 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
COL9A1P20849 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
COL9A1P20849 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
COL9A1P20849 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
COL9A1P20849 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
COL9A1P20849 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
COL9A1P20849 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
COL9A1P20849 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
COL9A1P20849 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
COL9A1P20849 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
COL9A1P20849 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
COL9A1P20849 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
COL9A1P20849 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
COL9A1P20849 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
COL9A1P20849 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
COL9A1P20849 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
COL9A1P20849 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
COL9A1P20849 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
COL9A1P20849 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
COL9A1P20849 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
COL9A1P20849 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL9A1P20849 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL9A1P20849 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
COL9A1P20849 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms