Protein–RNA interactions for Protein: A6NKD9

CCDC85C, Coiled-coil domain-containing protein 85C, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85CA6NKD9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC85CA6NKD9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC85CA6NKD9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC85CA6NKD9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC85CA6NKD9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC85CA6NKD9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC85CA6NKD9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC85CA6NKD9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC85CA6NKD9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC85CA6NKD9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC85CA6NKD9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC85CA6NKD9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC85CA6NKD9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC85CA6NKD9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC85CA6NKD9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC85CA6NKD9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC85CA6NKD9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC85CA6NKD9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC85CA6NKD9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC85CA6NKD9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC85CA6NKD9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC85CA6NKD9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC85CA6NKD9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC85CA6NKD9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC85CA6NKD9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC85CA6NKD9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC85CA6NKD9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC85CA6NKD9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC85CA6NKD9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC85CA6NKD9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC85CA6NKD9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC85CA6NKD9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC85CA6NKD9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC85CA6NKD9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC85CA6NKD9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC85CA6NKD9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC85CA6NKD9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC85CA6NKD9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC85CA6NKD9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC85CA6NKD9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC85CA6NKD9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC85CA6NKD9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC85CA6NKD9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC85CA6NKD9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC85CA6NKD9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC85CA6NKD9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC85CA6NKD9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC85CA6NKD9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC85CA6NKD9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC85CA6NKD9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC85CA6NKD9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC85CA6NKD9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC85CA6NKD9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC85CA6NKD9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC85CA6NKD9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC85CA6NKD9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC85CA6NKD9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC85CA6NKD9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC85CA6NKD9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC85CA6NKD9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC85CA6NKD9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC85CA6NKD9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC85CA6NKD9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC85CA6NKD9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC85CA6NKD9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC85CA6NKD9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC85CA6NKD9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC85CA6NKD9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC85CA6NKD9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC85CA6NKD9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC85CA6NKD9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC85CA6NKD9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC85CA6NKD9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC85CA6NKD9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC85CA6NKD9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC85CA6NKD9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC85CA6NKD9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC85CA6NKD9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC85CA6NKD9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC85CA6NKD9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC85CA6NKD9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC85CA6NKD9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC85CA6NKD9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC85CA6NKD9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC85CA6NKD9 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC85CA6NKD9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC85CA6NKD9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC85CA6NKD9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC85CA6NKD9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC85CA6NKD9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC85CA6NKD9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC85CA6NKD9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC85CA6NKD9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC85CA6NKD9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC85CA6NKD9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC85CA6NKD9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC85CA6NKD9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC85CA6NKD9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC85CA6NKD9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC85CA6NKD9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139 ms