Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

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Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VPREB3Q9UKI3 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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