Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R5

CRIP3, Cysteine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP3Q6Q6R5 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRIP3Q6Q6R5 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms