Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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HIF1AQ16665 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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HIF1AQ16665 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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HIF1AQ16665 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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HIF1AQ16665 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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HIF1AQ16665 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
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