Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HIF1AQ16665 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
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