Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R5

CRIP3, Cysteine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP3Q6Q6R5 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CRIP3Q6Q6R5 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms