Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HIF1AQ16665 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
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