Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS62

THSD1, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THSD1Q9NS62 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
THSD1Q9NS62 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
THSD1Q9NS62 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
THSD1Q9NS62 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
THSD1Q9NS62 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
THSD1Q9NS62 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
THSD1Q9NS62 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
THSD1Q9NS62 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
THSD1Q9NS62 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
THSD1Q9NS62 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
THSD1Q9NS62 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
THSD1Q9NS62 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
THSD1Q9NS62 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
THSD1Q9NS62 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
THSD1Q9NS62 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
THSD1Q9NS62 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
THSD1Q9NS62 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
THSD1Q9NS62 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
THSD1Q9NS62 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
THSD1Q9NS62 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
THSD1Q9NS62 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
THSD1Q9NS62 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
THSD1Q9NS62 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
THSD1Q9NS62 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
THSD1Q9NS62 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
THSD1Q9NS62 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
THSD1Q9NS62 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
THSD1Q9NS62 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
THSD1Q9NS62 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
THSD1Q9NS62 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
THSD1Q9NS62 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
THSD1Q9NS62 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
THSD1Q9NS62 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
THSD1Q9NS62 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
THSD1Q9NS62 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
THSD1Q9NS62 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
THSD1Q9NS62 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
THSD1Q9NS62 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
THSD1Q9NS62 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
THSD1Q9NS62 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
THSD1Q9NS62 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
THSD1Q9NS62 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
THSD1Q9NS62 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
THSD1Q9NS62 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
THSD1Q9NS62 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
THSD1Q9NS62 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
THSD1Q9NS62 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
THSD1Q9NS62 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
THSD1Q9NS62 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
THSD1Q9NS62 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
THSD1Q9NS62 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
THSD1Q9NS62 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
THSD1Q9NS62 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
THSD1Q9NS62 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
THSD1Q9NS62 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
THSD1Q9NS62 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
THSD1Q9NS62 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
THSD1Q9NS62 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
THSD1Q9NS62 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
THSD1Q9NS62 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
THSD1Q9NS62 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
THSD1Q9NS62 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
THSD1Q9NS62 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
THSD1Q9NS62 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
THSD1Q9NS62 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
THSD1Q9NS62 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
THSD1Q9NS62 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
THSD1Q9NS62 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
THSD1Q9NS62 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
THSD1Q9NS62 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
THSD1Q9NS62 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
THSD1Q9NS62 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
THSD1Q9NS62 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
THSD1Q9NS62 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
THSD1Q9NS62 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
THSD1Q9NS62 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
THSD1Q9NS62 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
THSD1Q9NS62 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
THSD1Q9NS62 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
THSD1Q9NS62 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
THSD1Q9NS62 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
THSD1Q9NS62 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
THSD1Q9NS62 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
THSD1Q9NS62 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
THSD1Q9NS62 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
THSD1Q9NS62 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
THSD1Q9NS62 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
THSD1Q9NS62 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
THSD1Q9NS62 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
THSD1Q9NS62 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
THSD1Q9NS62 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
THSD1Q9NS62 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
THSD1Q9NS62 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
THSD1Q9NS62 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
THSD1Q9NS62 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
THSD1Q9NS62 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
THSD1Q9NS62 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
THSD1Q9NS62 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
THSD1Q9NS62 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
THSD1Q9NS62 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.1 ms