Protein–RNA interactions for Protein: Q3C1V9

Putative uncharacterized protein ENSP00000334305, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3C1V9 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q3C1V9 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q3C1V9 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q3C1V9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q3C1V9 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q3C1V9 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q3C1V9 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q3C1V9 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q3C1V9 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q3C1V9 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q3C1V9 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q3C1V9 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q3C1V9 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q3C1V9 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q3C1V9 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q3C1V9 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q3C1V9 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q3C1V9 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q3C1V9 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q3C1V9 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q3C1V9 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q3C1V9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q3C1V9 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q3C1V9 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q3C1V9 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Q3C1V9 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Q3C1V9 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q3C1V9 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q3C1V9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q3C1V9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q3C1V9 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q3C1V9 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q3C1V9 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q3C1V9 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q3C1V9 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q3C1V9 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q3C1V9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q3C1V9 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q3C1V9 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q3C1V9 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q3C1V9 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q3C1V9 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q3C1V9 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Q3C1V9 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q3C1V9 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q3C1V9 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q3C1V9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q3C1V9 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q3C1V9 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q3C1V9 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q3C1V9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q3C1V9 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q3C1V9 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q3C1V9 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q3C1V9 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q3C1V9 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q3C1V9 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q3C1V9 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q3C1V9 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q3C1V9 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q3C1V9 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Q3C1V9 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q3C1V9 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Q3C1V9 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q3C1V9 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q3C1V9 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q3C1V9 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q3C1V9 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q3C1V9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q3C1V9 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q3C1V9 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Q3C1V9 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q3C1V9 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q3C1V9 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Q3C1V9 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q3C1V9 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q3C1V9 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Q3C1V9 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q3C1V9 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q3C1V9 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q3C1V9 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q3C1V9 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q3C1V9 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q3C1V9 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q3C1V9 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q3C1V9 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q3C1V9 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q3C1V9 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q3C1V9 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Q3C1V9 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q3C1V9 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q3C1V9 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q3C1V9 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q3C1V9 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q3C1V9 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q3C1V9 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q3C1V9 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q3C1V9 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q3C1V9 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Q3C1V9 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms