Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

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Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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EXT1Q16394 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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EXT1Q16394 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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EXT1Q16394 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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EXT1Q16394 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
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EXT1Q16394 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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EXT1Q16394 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
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EXT1Q16394 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
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EXT1Q16394 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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EXT1Q16394 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EXT1Q16394 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EXT1Q16394 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EXT1Q16394 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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EXT1Q16394 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EXT1Q16394 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EXT1Q16394 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EXT1Q16394 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EXT1Q16394 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EXT1Q16394 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EXT1Q16394 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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