Protein–RNA interactions for Protein: Q12491

TY2B-B, Transposon Ty2-B Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,770 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY2B-BQ12491 DAL80YKR034W 810 nt11.21□□□□□ -0.62
TY2B-BQ12491 YEL075W-AYEL075W-A 612 nt11.2□□□□□ -0.62
TY2B-BQ12491 YLR463CYLR463C 552 nt11.2□□□□□ -0.62
TY2B-BQ12491 YMR252CYMR252C 405 nt11.19□□□□□ -0.62
TY2B-BQ12491 HTZ1YOL012C 405 nt11.19□□□□□ -0.62
TY2B-BQ12491 LEA1YPL213W 717 nt11.19□□□□□ -0.62
TY2B-BQ12491 YOL046CYOL046C 675 nt11.18□□□□□ -0.62
TY2B-BQ12491 YHR033WYHR033W 1272 nt11.18□□□□□ -0.62
TY2B-BQ12491 GET4YOR164C 939 nt11.18□□□□□ -0.62
TY2B-BQ12491 DMC1YER179W 1005 nt11.17□□□□□ -0.62
TY2B-BQ12491 MPE1YKL059C 1326 nt11.16□□□□□ -0.62
TY2B-BQ12491 YJL213WYJL213W 996 nt11.16□□□□□ -0.62
TY2B-BQ12491 OSW2YLR054C 2175 nt11.16□□□□□ -0.62
TY2B-BQ12491 YDR215CYDR215C 414 nt11.15□□□□□ -0.62
TY2B-BQ12491 TUB1YML085C 1344 nt11.14□□□□□ -0.63
TY2B-BQ12491 FYV1YDR024W 486 nt11.13□□□□□ -0.63
TY2B-BQ12491 PAM17YKR065C 594 nt11.13□□□□□ -0.63
TY2B-BQ12491 FMP40YPL222W 2067 nt11.13□□□□□ -0.63
TY2B-BQ12491 IRC7YFR055W 1023 nt11.12□□□□□ -0.63
TY2B-BQ12491 YKL147CYKL147C 618 nt11.12□□□□□ -0.63
TY2B-BQ12491 CDA1YLR307W 906 nt11.12□□□□□ -0.63
TY2B-BQ12491 MED6YHR058C 888 nt11.11□□□□□ -0.63
TY2B-BQ12491 YPR076WYPR076W 375 nt11.11□□□□□ -0.63
TY2B-BQ12491 COX15YER141W 1461 nt11.11□□□□□ -0.63
TY2B-BQ12491 ADE5,7YGL234W 2409 nt11.1□□□□□ -0.63
TY2B-BQ12491 RTC4YNL254C 1206 nt11.08□□□□□ -0.64
TY2B-BQ12491 PSD1YNL169C 1503 nt11.08□□□□□ -0.64
TY2B-BQ12491 YDL144CYDL144C 1071 nt11.08□□□□□ -0.64
TY2B-BQ12491 FIT2YOR382W 462 nt11.08□□□□□ -0.64
TY2B-BQ12491 ASR1YPR093C 867 nt11.07□□□□□ -0.64
TY2B-BQ12491 ADH5YBR145W 1056 nt11.06□□□□□ -0.64
TY2B-BQ12491 CIT2YCR005C 1383 nt11.05□□□□□ -0.64
TY2B-BQ12491 ASF1YJL115W 840 nt11.05□□□□□ -0.64
TY2B-BQ12491 COQ3YOL096C 939 nt11.04□□□□□ -0.64
TY2B-BQ12491 PLB2YMR006C 2121 nt11.04□□□□□ -0.64
TY2B-BQ12491 KTR4YBR199W 1395 nt11.04□□□□□ -0.64
TY2B-BQ12491 APE4YHR113W 1473 nt11.03□□□□□ -0.64
TY2B-BQ12491 PPH21YDL134C 1110 nt11.03□□□□□ -0.64
TY2B-BQ12491 YNR001W-AYNR001W-A 219 nt11.03□□□□□ -0.64
TY2B-BQ12491 RBS1YDL189W 1374 nt11.02□□□□□ -0.64
TY2B-BQ12491 RIM8YGL045W 1629 nt11.02□□□□□ -0.65
TY2B-BQ12491 YKL102CYKL102C 306 nt11.01□□□□□ -0.65
TY2B-BQ12491 YNL140CYNL140C 570 nt11.01□□□□□ -0.65
TY2B-BQ12491 YPL102CYPL102C 303 nt11.01□□□□□ -0.65
TY2B-BQ12491 FTH1YBR207W 1398 nt11□□□□□ -0.65
TY2B-BQ12491 YML018CYML018C 1182 nt10.99□□□□□ -0.65
TY2B-BQ12491 MRPS18YNL306W 654 nt10.99□□□□□ -0.65
TY2B-BQ12491 YLR361C-AYLR361C-A 297 nt10.98□□□□□ -0.65
TY2B-BQ12491 RCF2YNR018W 675 nt10.98□□□□□ -0.65
TY2B-BQ12491 LEO1YOR123C 1395 nt10.98□□□□□ -0.65
TY2B-BQ12491 PRE3YJL001W 648 nt10.98□□□□□ -0.65
TY2B-BQ12491 CDC1YDR182W 1476 nt10.97□□□□□ -0.65
TY2B-BQ12491 YKR045CYKR045C 552 nt10.96□□□□□ -0.65
TY2B-BQ12491 NTG2YOL043C 1143 nt10.96□□□□□ -0.65
TY2B-BQ12491 PET10YKR046C 852 nt10.95□□□□□ -0.66
TY2B-BQ12491 TOP3YLR234W 1971 nt10.95□□□□□ -0.66
TY2B-BQ12491 HSL7YBR133C 2484 nt10.95□□□□□ -0.66
TY2B-BQ12491 YIP4YGL198W 708 nt10.95□□□□□ -0.66
TY2B-BQ12491 YCR049CYCR049C 447 nt10.93□□□□□ -0.66
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TY2B-BQ12491 GPD2YOL059W 1323 nt10.92□□□□□ -0.66
TY2B-BQ12491 CAR2YLR438W 1275 nt10.92□□□□□ -0.66
TY2B-BQ12491 FPR3YML074C 1236 nt10.92□□□□□ -0.66
TY2B-BQ12491 YDR187CYDR187C 519 nt10.91□□□□□ -0.66
TY2B-BQ12491 TFG2YGR005C 1203 nt10.91□□□□□ -0.66
TY2B-BQ12491 YNL092WYNL092W 1203 nt10.91□□□□□ -0.66
TY2B-BQ12491 YGL114WYGL114W 2178 nt10.91□□□□□ -0.66
TY2B-BQ12491 SUF3tG(CCC)D 72 nt10.9□□□□□ -0.66
TY2B-BQ12491 TAF9YMR236W 474 nt10.9□□□□□ -0.66
TY2B-BQ12491 URA8YJR103W 1737 nt10.9□□□□□ -0.66
TY2B-BQ12491 YPQ2YDR352W 954 nt10.89□□□□□ -0.67
TY2B-BQ12491 YMR295CYMR295C 594 nt10.89□□□□□ -0.67
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TY2B-BQ12491 RRP9YPR137W 1722 nt10.87□□□□□ -0.67
TY2B-BQ12491 BRN1YBL097W 2265 nt10.87□□□□□ -0.67
TY2B-BQ12491 PET117YER058W 324 nt10.87□□□□□ -0.67
TY2B-BQ12491 YLL058WYLL058W 1728 nt10.87□□□□□ -0.67
TY2B-BQ12491 YAH1YPL252C 519 nt10.87□□□□□ -0.67
TY2B-BQ12491 ADE16YLR028C 1776 nt10.87□□□□□ -0.67
TY2B-BQ12491 CYT1YOR065W 930 nt10.85□□□□□ -0.67
TY2B-BQ12491 TPO4YOR273C 1980 nt10.85□□□□□ -0.67
TY2B-BQ12491 PEX28YHR150W 1740 nt10.84□□□□□ -0.67
TY2B-BQ12491 AVL9YLR114C 2295 nt10.84□□□□□ -0.67
TY2B-BQ12491 CKB1YGL019W 837 nt10.83□□□□□ -0.68
TY2B-BQ12491 TSR2YLR435W 618 nt10.83□□□□□ -0.68
TY2B-BQ12491 GCG1YER163C 699 nt10.82□□□□□ -0.68
TY2B-BQ12491 NUP49YGL172W 1419 nt10.82□□□□□ -0.68
TY2B-BQ12491 RDR1YOR380W 1641 nt10.82□□□□□ -0.68
TY2B-BQ12491 MSC3YLR219W 2187 nt10.81□□□□□ -0.68
TY2B-BQ12491 YNR005CYNR005C 405 nt10.81□□□□□ -0.68
TY2B-BQ12491 YHL008CYHL008C 1884 nt10.8□□□□□ -0.68
TY2B-BQ12491 YMR122CYMR122C 375 nt10.79□□□□□ -0.68
TY2B-BQ12491 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt10.78□□□□□ -0.68
TY2B-BQ12491 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt10.78□□□□□ -0.68
TY2B-BQ12491 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt10.78□□□□□ -0.68
TY2B-BQ12491 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt10.78□□□□□ -0.68
TY2B-BQ12491 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt10.78□□□□□ -0.68
TY2B-BQ12491 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt10.78□□□□□ -0.68
TY2B-BQ12491 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt10.78□□□□□ -0.68
TY2B-BQ12491 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt10.78□□□□□ -0.68
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