Protein–RNA interactions for Protein: Q12483

SNF8, Vacuolar-sorting protein SNF8, yeastyeast

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNF8Q12483 YKR018CYKR018C 2178 nt7.07□□□□□ -1.28
SNF8Q12483 YGL260WYGL260W 231 nt7.06□□□□□ -1.28
SNF8Q12483 ERV2YPR037C 591 nt7.06□□□□□ -1.28
SNF8Q12483 CDC23YHR166C 1881 nt7.06□□□□□ -1.28
SNF8Q12483 PPZ2YDR436W 2133 nt7.06□□□□□ -1.28
SNF8Q12483 GUT1YHL032C 2130 nt7.06□□□□□ -1.28
SNF8Q12483 PSA1YDL055C 1086 nt7.05□□□□□ -1.28
SNF8Q12483 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt7.05□□□□□ -1.28
SNF8Q12483 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt7.05□□□□□ -1.28
SNF8Q12483 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt7.05□□□□□ -1.28
SNF8Q12483 SUP51tL(UAA)J 84 nt7.05□□□□□ -1.28
SNF8Q12483 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt7.05□□□□□ -1.28
SNF8Q12483 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt7.05□□□□□ -1.28
SNF8Q12483 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt7.05□□□□□ -1.28
SNF8Q12483 YAH1YPL252C 519 nt7.05□□□□□ -1.28
SNF8Q12483 TOP3YLR234W 1971 nt7.05□□□□□ -1.28
SNF8Q12483 BAP3YDR046C 1815 nt7.04□□□□□ -1.28
SNF8Q12483 CRN1YLR429W 1956 nt7.04□□□□□ -1.28
SNF8Q12483 AFG3YER017C 2286 nt7.03□□□□□ -1.28
SNF8Q12483 GTS1YGL181W 1191 nt7.03□□□□□ -1.28
SNF8Q12483 FLC2YAL053W 2352 nt7.03□□□□□ -1.28
SNF8Q12483 SEC24YIL109C 2781 nt7.03□□□□□ -1.28
SNF8Q12483 YPT10YBR264C 600 nt7.02□□□□□ -1.29
SNF8Q12483 MSS51YLR203C 1311 nt7.01□□□□□ -1.29
SNF8Q12483 ERR3YMR323W 1314 nt7.01□□□□□ -1.29
SNF8Q12483 ERR1YOR393W 1314 nt7.01□□□□□ -1.29
SNF8Q12483 ERR2YPL281C 1314 nt7.01□□□□□ -1.29
SNF8Q12483 HRA1HRA1 564 nt7.01□□□□□ -1.29
SNF8Q12483 YKL147CYKL147C 618 nt7.01□□□□□ -1.29
SNF8Q12483 ATP10YLR393W 840 nt7.01□□□□□ -1.29
SNF8Q12483 DSC3YOR223W 879 nt7.01□□□□□ -1.29
SNF8Q12483 TOS1YBR162C 1368 nt7□□□□□ -1.29
SNF8Q12483 STS1YIR011C 960 nt7□□□□□ -1.29
SNF8Q12483 PRB1YEL060C 1908 nt6.99□□□□□ -1.29
SNF8Q12483 RMD8YFR048W 1989 nt6.99□□□□□ -1.29
SNF8Q12483 NCA3YJL116C 1014 nt6.99□□□□□ -1.29
SNF8Q12483 YJR142WYJR142W 1029 nt6.99□□□□□ -1.29
SNF8Q12483 YMR253CYMR253C 1245 nt6.99□□□□□ -1.29
SNF8Q12483 YDR327WYDR327W 327 nt6.98□□□□□ -1.29
SNF8Q12483 RPL12BYDR418W 498 nt6.98□□□□□ -1.29
SNF8Q12483 YDR476CYDR476C 675 nt6.98□□□□□ -1.29
SNF8Q12483 FUS3YBL016W 1062 nt6.98□□□□□ -1.29
SNF8Q12483 ERG24YNL280C 1317 nt6.98□□□□□ -1.29
SNF8Q12483 CMK2YOL016C 1344 nt6.98□□□□□ -1.29
SNF8Q12483 HRB1YNL004W 1365 nt6.97□□□□□ -1.29
SNF8Q12483 FRT1YOR324C 1809 nt6.97□□□□□ -1.29
SNF8Q12483 LIP5YOR196C 1245 nt6.97□□□□□ -1.29
SNF8Q12483 YOR343CYOR343C 327 nt6.97□□□□□ -1.29
SNF8Q12483 SKP1YDR328C 585 nt6.96□□□□□ -1.3
SNF8Q12483 PRY2YKR013W 990 nt6.96□□□□□ -1.3
SNF8Q12483 ENB1YOL158C 1821 nt6.96□□□□□ -1.3
SNF8Q12483 TOD6YBL054W 1578 nt6.95□□□□□ -1.3
SNF8Q12483 CAN1YEL063C 1773 nt6.95□□□□□ -1.3
SNF8Q12483 NMA2YGR010W 1188 nt6.95□□□□□ -1.3
SNF8Q12483 OSM1YJR051W 1506 nt6.95□□□□□ -1.3
SNF8Q12483 CCR4YAL021C 2514 nt6.94□□□□□ -1.3
SNF8Q12483 YER137CYER137C 447 nt6.93□□□□□ -1.3
SNF8Q12483 MSI1YBR195C 1269 nt6.93□□□□□ -1.3
SNF8Q12483 RDR1YOR380W 1641 nt6.93□□□□□ -1.3
SNF8Q12483 POB3YML069W 1659 nt6.93□□□□□ -1.3
SNF8Q12483 FCY2YER056C 1602 nt6.92□□□□□ -1.3
SNF8Q12483 PIL1YGR086C 1020 nt6.92□□□□□ -1.3
SNF8Q12483 AQR1YNL065W 1761 nt6.92□□□□□ -1.3
SNF8Q12483 GGC1YDL198C 903 nt6.91□□□□□ -1.3
SNF8Q12483 CCW12YLR110C 402 nt6.91□□□□□ -1.3
SNF8Q12483 YJL213WYJL213W 996 nt6.9□□□□□ -1.3
SNF8Q12483 CTF3YLR381W 2202 nt6.9□□□□□ -1.3
SNF8Q12483 PET494YNR045W 1470 nt6.9□□□□□ -1.31
SNF8Q12483 NUP57YGR119C 1626 nt6.9□□□□□ -1.31
SNF8Q12483 YGL081WYGL081W 963 nt6.89□□□□□ -1.31
SNF8Q12483 LOT6YLR011W 576 nt6.89□□□□□ -1.31
SNF8Q12483 ADH6YMR318C 1083 nt6.89□□□□□ -1.31
SNF8Q12483 EXG2YDR261C 1689 nt6.89□□□□□ -1.31
SNF8Q12483 NUP84YDL116W 2181 nt6.88□□□□□ -1.31
SNF8Q12483 CDC3YLR314C 1563 nt6.88□□□□□ -1.31
SNF8Q12483 BUD20YLR074C 501 nt6.88□□□□□ -1.31
SNF8Q12483 YMR074CYMR074C 438 nt6.88□□□□□ -1.31
SNF8Q12483 CDC7YDL017W 1524 nt6.87□□□□□ -1.31
SNF8Q12483 BNA3YJL060W 1335 nt6.87□□□□□ -1.31
SNF8Q12483 DOC1YGL240W 753 nt6.87□□□□□ -1.31
SNF8Q12483 PGI1YBR196C 1665 nt6.87□□□□□ -1.31
SNF8Q12483 PMA2YPL036W 2844 nt6.86□□□□□ -1.31
SNF8Q12483 SUF3tG(CCC)D 72 nt6.86□□□□□ -1.31
SNF8Q12483 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt6.85□□□□□ -1.31
SNF8Q12483 YJR154WYJR154W 1041 nt6.85□□□□□ -1.31
SNF8Q12483 ECM27YJR106W 2178 nt6.84□□□□□ -1.31
SNF8Q12483 MHP1YJL042W 4197 nt6.84□□□□□ -1.31
SNF8Q12483 ERG27YLR100W 1044 nt6.83□□□□□ -1.32
SNF8Q12483 PHO85YPL031C 918 nt6.83□□□□□ -1.32
SNF8Q12483 CIT2YCR005C 1383 nt6.82□□□□□ -1.32
SNF8Q12483 DMC1YER179W 1005 nt6.82□□□□□ -1.32
SNF8Q12483 YLR358CYLR358C 564 nt6.82□□□□□ -1.32
SNF8Q12483 YNR001W-AYNR001W-A 219 nt6.82□□□□□ -1.32
SNF8Q12483 YHR131CYHR131C 2553 nt6.81□□□□□ -1.32
SNF8Q12483 EDC2YER035W 438 nt6.81□□□□□ -1.32
SNF8Q12483 PET117YER058W 324 nt6.81□□□□□ -1.32
SNF8Q12483 KAE1YKR038C 1161 nt6.81□□□□□ -1.32
SNF8Q12483 SUN4YNL066W 1263 nt6.81□□□□□ -1.32
SNF8Q12483 SMC5YOL034W 3282 nt6.81□□□□□ -1.32
SNF8Q12483 HEL1YKR017C 1656 nt6.81□□□□□ -1.32
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