RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FTH1P02794 183 aa25.38■■□□□ 1.65
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCDC38Q502W7 563 aa25.38■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa25.38■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DNAAF3Q8N9W5 541 aa25.38■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR52K1Q8NGK4 314 aa25.38■■□□□ 1.65
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRSS21Q9Y6M0 314 aa25.38■■□□□ 1.65
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR5AR1Q8NGP9 310 aa25.37■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ATG4AQ8WYN0 398 aa25.37■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa25.37■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PCMTD2Q9NV79 361 aa25.37■■□□□ 1.65
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 STIP1P31948 543 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FOXN2P32314 431 aa25.36■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ITGA1P56199 1179 aa25.36■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CHAF1BQ13112 559 aa25.36■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BRD3Q15059 726 aa25.36■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP25.36■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NLNQ9BYT8 704 aa25.36■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ACSS2Q9NR19 701 aa25.36■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PLAAQ9Y263 795 aa25.36■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ASF1AQ9Y294 204 aa25.36■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PDGFAP04085 211 aa25.35■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR56A5P0C7T3 313 aa25.35■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPTBP11277 2137 aa25.35■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SHMT2P34897 504 aa25.35■■□□□ 1.65
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa25.35■■□□□ 1.65
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TCFL5Q9UL49 500 aa25.35■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LRRK2Q5S007 2527 aa25.34■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HEATR9A2RTY3 570 aa25.34■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 E7EQ34 232 aa25.34■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LIASO43766 372 aa25.34■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ACADLP28330 430 aa25.34■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FDFT1P37268 417 aa25.34■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PTGIRP43119 386 aa25.34■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCL11P51671 97 aa25.34■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PGDP52209 483 aa25.34■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SEL1L2Q5TEA6 688 aa25.34■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa25.34■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UNC5AQ6ZN44 842 aa25.34■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TBC1D21Q8IYX1 336 aa25.34■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HDAC10Q969S8 669 aa25.34■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MIB2Q96AX9 1013 aa25.34■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TTC1Q99614 292 aa25.34■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC25A23Q9BV35 468 aa25.34■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ETNK1Q9HBU6 452 aa25.34■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IMPACTQ9P2X3 320 aa25.34■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC5A10A0PJK1 596 aa25.33■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 E7EVH7 732 aa25.33■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IFNB1P01574 187 aa25.33■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HBQ1P09105 142 aa25.33■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UGT2B7P16662 529 aa25.33■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MLLT10P55197 1068 aa25.33■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OASLQ15646 514 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PTCHD3Q3KNS1 767 aa25.33■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AFTPHQ6ULP2 937 aa25.33■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM198BQ6UWH4 519 aa25.33■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NAPRTQ6XQN6 538 aa25.33■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRIM73Q86UV7 250 aa25.33■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GAS2L3Q86XJ1 694 aa25.33■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GPR135Q8IZ08 494 aa25.33■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR13J1Q8NGT2 312 aa25.33■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa25.33■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 COL26A1Q96A83 441 aa25.33■■□□□ 1.65
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