RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HACD1B0YJ81 288 aa25.74■■□□□ 1.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPAM1P38567 509 aa25.74■■□□□ 1.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MARCKSL1P49006 195 aa25.74■■□□□ 1.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DRG2P55039 364 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C11orf96Q7Z7L8 435 aa25.74■■□□□ 1.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TC2NQ8N9U0 490 aa25.74■■□□□ 1.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IPMKQ8NFU5 416 aa25.74■■□□□ 1.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DTX3LQ8TDB6 740 aa25.74■■□□□ 1.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa25.74■■□□□ 1.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CXorf40BQ96DE9 158 aa25.74■■□□□ 1.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC45A3Q96JT2 553 aa25.74■■□□□ 1.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EFHD1Q9BUP0 239 aa25.74■■□□□ 1.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC40A1Q9NP59 571 aa25.74■■□□□ 1.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IL17CQ9P0M4 197 aa25.74■■□□□ 1.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRIM10Q9UDY6 481 aa25.74■■□□□ 1.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP25.74■■□□□ 1.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa25.73■■□□□ 1.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR52A4PA6NMU1 304 aa25.73■■□□□ 1.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PPFIA2O75334 1257 aa25.73■■□□□ 1.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LCA5LO95447 670 aa25.73■■□□□ 1.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HLA-DPA1P20036 260 aa25.73■■□□□ 1.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ABHD18Q0P651 414 aa25.73■■□□□ 1.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MPP3Q13368 585 aa25.73■■□□□ 1.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC1A5Q15758 541 aa25.73■■□□□ 1.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PPP2R5EQ16537 467 aa25.73■■□□□ 1.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM151BQ6UXP7 276 aa25.73■■□□□ 1.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa25.73■■□□□ 1.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRHDEQ9UKU6 1024 aa25.73■■□□□ 1.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa25.73■■□□□ 1.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MYO18BQ8IUG5 2567 aa25.72■■□□□ 1.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa25.72■■□□□ 1.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UGT1A9O60656 530 aa25.72■■□□□ 1.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KCNJ13O60928 360 aa25.72■■□□□ 1.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UGT1A6P19224 532 aa25.72■■□□□ 1.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UGT1A1P22309 533 aa25.72■■□□□ 1.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UGT1A4P22310 534 aa25.72■■□□□ 1.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HALP42357 657 aa25.72■■□□□ 1.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NFKB2Q00653 900 aa25.72■■□□□ 1.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FOXM1Q08050 763 aa25.72■■□□□ 1.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GPR18Q14330 331 aa25.72■■□□□ 1.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CHRNA6Q15825 494 aa25.72■■□□□ 1.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LDLRAP1Q5SW96 308 aa25.72■■□□□ 1.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C11orf63Q6NUN7 778 aa25.72■■□□□ 1.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UNC5BQ8IZJ1 945 aa25.72■■□□□ 1.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CATSPER2Q96P56 530 aa25.72■■□□□ 1.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRIM5Q9C035 493 aa25.72■■□□□ 1.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ADNPQ9H2P0 1102 aa25.72■■□□□ 1.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UGT1A7Q9HAW7 530 aa25.72■■□□□ 1.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UGT1A10Q9HAW8 530 aa25.72■■□□□ 1.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UGT1A8Q9HAW9 530 aa25.72■■□□□ 1.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RSPH14Q9UHP6 348 aa25.72■■□□□ 1.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TFR2Q9UP52 801 aa25.72■■□□□ 1.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PKP3Q9Y446 797 aa25.72■■□□□ 1.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BUD23O43709 281 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RASSF9O75901 435 aa25.71■■□□□ 1.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DLGAP3O95886 979 aa25.71■■□□□ 1.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SEPHS1P49903 392 aa25.71■■□□□ 1.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPA17Q15506 151 aa25.71■■□□□ 1.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SARM1Q6SZW1 724 aa25.71■■□□□ 1.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BBS12Q6ZW61 710 aa25.71■■□□□ 1.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AMZ2Q86W34 360 aa25.71■■□□□ 1.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCDC170Q8IYT3 715 aa25.71■■□□□ 1.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RSC1A1Q92681 617 aa25.71■■□□□ 1.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HEMGNQ9BXL5 484 aa25.71■■□□□ 1.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FSD1LQ9BXM9 530 aa25.71■■□□□ 1.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC25A18Q9H1K4 315 aa25.71■■□□□ 1.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NKX2-8O15522 239 aa25.7■■□□□ 1.7
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 WISP1O95388 367 aa25.7■■□□□ 1.7
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCR10P46092 362 aa25.7■■□□□ 1.7
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CAPZBP47756 277 aa25.7■■□□□ 1.7
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KCNC4Q03721 635 aa25.7■■□□□ 1.7
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 XRCC4Q13426 336 aa25.7■■□□□ 1.7
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ITGA9Q13797 1035 aa25.7■■□□□ 1.7
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DAAM2Q86T65 1068 aa25.7■■□□□ 1.7
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ESX1Q8N693 406 aa25.7■■□□□ 1.7
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa25.7■■□□□ 1.7
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DDHD1Q8NEL9 900 aa25.7■■□□□ 1.7
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KRT35Q92764 455 aa25.7■■□□□ 1.7
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZDHHC12Q96GR4 267 aa25.7■■□□□ 1.7
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CLMPQ9H6B4 373 aa25.7■■□□□ 1.7
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 WDR37Q9Y2I8 494 aa25.7■■□□□ 1.7
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 H7C0C1 242 aa25.69■■□□□ 1.7
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa25.69■■□□□ 1.7
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GPR39O43194 453 aa25.69■■□□□ 1.7
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 POP7O75817 140 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 APOC2P02655 101 aa25.69■■□□□ 1.7
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ATP5OP48047 213 aa25.69■■□□□ 1.7
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 POLE2P56282 527 aa25.69■■□□□ 1.7
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DMPKQ09013 629 aa25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70 ms