RNA–Protein interactions for RNA: YPL179W

PPQ1, Transcript of Protein phosphatase that regulates the mating response, yeast

Gene PPQ1, Length 1,650 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PPQ1	YPL179W	NSE3	Q05541	303 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PPQ1	YPL179W	KNS1	P32350	737 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PPQ1	YPL179W	YGR122W	P53272	402 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PPQ1	YPL179W	AI1	P03875	834 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PPQ1	YPL179W	FUR4	P05316	633 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PPQ1	YPL179W	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PPQ1	YPL179W	GIP1	P38229	639 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PPQ1	YPL179W	BOL3	P39724	118 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PPQ1	YPL179W	YIL092W	P40497	633 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PPQ1	YPL179W	BUD27	P43573	796 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.79	□□□□□ -1.64	not detected
PPQ1	YPL179W	NAB6	Q03735	1134 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.79	□□□□□ -1.64	not detected
PPQ1	YPL179W	YOL057W	Q08225	711 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PPQ1	YPL179W	DAL5	P15365	543 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PPQ1	YPL179W	PDC5	P16467	563 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
PPQ1	YPL179W	CDC3	P32457	520 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
PPQ1	YPL179W	BOI1	P38041	980 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
PPQ1	YPL179W	NYV1	Q12255	253 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PPQ1	YPL179W	SWI1	P09547	1314 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PPQ1	YPL179W	PMD1	P32634	1753 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PPQ1	YPL179W	RAD24	P32641	659 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PPQ1	YPL179W	ISW1	P38144	1129 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PPQ1	YPL179W	YER156C	P40093	338 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PPQ1	YPL179W	HXT8	P40886	569 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PPQ1	YPL179W	ITC1	P53125	1264 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PPQ1	YPL179W	YGL082W	P53155	381 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PPQ1	YPL179W	YNR040W	P53736	256 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PPQ1	YPL179W	VPS64	Q03944	604 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PPQ1	YPL179W	YDR306C	Q06640	478 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PPQ1	YPL179W	MSN1	P22148	382 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PPQ1	YPL179W	SWC3	P31376	625 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PPQ1	YPL179W	NAB2	P32505	525 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.77	□□□□□ -1.65	not detected
PPQ1	YPL179W	KTR2	P33550	425 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PPQ1	YPL179W	YFL066C	P43538	392 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PPQ1	YPL179W	RIX7	Q07844	837 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PPQ1	YPL179W	SSP2	Q08646	371 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PPQ1	YPL179W	BUG1	Q12191	341 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PPQ1	YPL179W	PHM7	Q12252	991 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PPQ1	YPL179W	MRP7	P12687	371 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PPQ1	YPL179W	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PPQ1	YPL179W	ICP55	P40051	511 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PPQ1	YPL179W	PRK1	P40494	810 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PPQ1	YPL179W	YRB30	P53107	440 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PPQ1	YPL179W	CSI1	Q04368	295 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PPQ1	YPL179W	NUP133	P36161	1157 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PPQ1	YPL179W	TOS1	P38288	455 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PPQ1	YPL179W	BSD2	P38356	321 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PPQ1	YPL179W	ATG1	P53104	897 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PPQ1	YPL179W	FCP1	Q03254	732 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PPQ1	YPL179W	KAR5	Q04746	504 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PPQ1	YPL179W	CTI6	Q08923	506 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PPQ1	YPL179W	IDI1	P15496	288 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PPQ1	YPL179W	SMC1	P32908	1225 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PPQ1	YPL179W	FIR1	P40020	876 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PPQ1	YPL179W	NTA1	P40354	457 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PPQ1	YPL179W	ACF4	P47129	309 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PPQ1	YPL179W	MET1	P36150	593 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PPQ1	YPL179W	UGA2	P38067	497 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PPQ1	YPL179W	YIL165C	P40446	119 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PPQ1	YPL179W	RGD2	P43556	714 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PPQ1	YPL179W	YFR016C	P43597	1233 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PPQ1	YPL179W	UTP22	P53254	1237 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PPQ1	YPL179W	MDG1	P53885	366 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PPQ1	YPL179W	DNM1	P54861	757 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PPQ1	YPL179W	RAD2	P07276	1031 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PPQ1	YPL179W	TRL1	P09880	827 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PPQ1	YPL179W	YJR008W	P47085	338 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PPQ1	YPL179W	POL32	P47110	350 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PPQ1	YPL179W	RSC2	Q06488	889 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PPQ1	YPL179W	THI72	Q08579	599 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PPQ1	YPL179W	RPS19A	P07280	144 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
PPQ1	YPL179W	RPS19B	P07281	144 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
PPQ1	YPL179W	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
PPQ1	YPL179W	RPB10	P22139	70 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PPQ1	YPL179W	BOI2	P39969	1040 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PPQ1	YPL179W	SUT1	P53032	299 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
PPQ1	YPL179W	NSG2	P53898	299 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PPQ1	YPL179W	ALD3	P54114	506 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PPQ1	YPL179W	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
PPQ1	YPL179W	MCX1	P38323	520 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
PPQ1	YPL179W	QDR1	P40475	563 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PPQ1	YPL179W	SPO1	P53541	631 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PPQ1	YPL179W	UFD2	P54860	961 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PPQ1	YPL179W	PKH1	Q03407	766 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PPQ1	YPL179W	EMG1	Q06287	252 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
PPQ1	YPL179W	DUR1,2	P32528	1835 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
PPQ1	YPL179W	MDJ1	P35191	511 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PPQ1	YPL179W	GLO3	P38682	493 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
PPQ1	YPL179W	AIM46	P38885	310 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PPQ1	YPL179W	RAD55	P38953	406 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PPQ1	YPL179W	EAF6	P47128	113 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PPQ1	YPL179W	IRS4	P36115	615 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
PPQ1	YPL179W	YNG2	P38806	282 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
PPQ1	YPL179W	UBP12	P39538	1254 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PPQ1	YPL179W	SBE2	P42223	864 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
PPQ1	YPL179W	GIS4	Q04233	774 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PPQ1	YPL179W	NOP8	Q08287	484 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
PPQ1	YPL179W	PUS1	Q12211	544 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
PPQ1	YPL179W	SLP1	Q12232	587 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PPQ1	YPL179W	NAR1	P23503	491 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
PPQ1	YPL179W	PSY2	P40164	858 aa		4.69	□□□□□ -1.66

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 18.8 ms