RNA–Protein interactions for RNA: YNL109W

YNL109W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YNL109W, Length 546 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL109W	YNL109W	XKS1	P42826	600 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YNL109W	YNL109W	VPS53	P47061	822 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YNL109W	YNL109W	CTH1	P47976	325 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YNL109W	YNL109W	YGL140C	P53120	1219 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YNL109W	YNL109W	HRK1	Q08732	759 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
YNL109W	YNL109W	ADP1	P25371	1049 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YNL109W	YNL109W	UGA4	P32837	571 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YNL109W	YNL109W	RDH54	P38086	958 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YNL109W	YNL109W	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
YNL109W	YNL109W	ENT3	P47160	408 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YNL109W	YNL109W	TRE1	Q08919	783 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YNL109W	YNL109W	YVC1	Q12324	675 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YNL109W	YNL109W	SEC23	P15303	768 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
YNL109W	YNL109W	FAA3	P39002	694 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YNL109W	YNL109W	YLR257W	Q06146	321 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
YNL109W	YNL109W	PUS7	Q08647	676 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
YNL109W	YNL109W	RAD2	P07276	1031 aa		5	□□□□□ -1.61
YNL109W	YNL109W	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
YNL109W	YNL109W	YJR107W	P47145	328 aa		5	□□□□□ -1.61
YNL109W	YNL109W	TPP1	Q03796	238 aa		5	□□□□□ -1.61
YNL109W	YNL109W	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
YNL109W	YNL109W	EST2	Q06163	884 aa		5	□□□□□ -1.61
YNL109W	YNL109W	CYC8	P14922	966 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YNL109W	YNL109W	QNS1	P38795	714 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
YNL109W	YNL109W	ECL1	P48235	211 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YNL109W	YNL109W	ORC3	P54790	616 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YNL109W	YNL109W	RMD1	Q03441	430 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YNL109W	YNL109W	TOS4	Q06266	489 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YNL109W	YNL109W	MDL2	P33311	773 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YNL109W	YNL109W	PEX7	P39108	375 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YNL109W	YNL109W	RPS26A	P39938	119 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YNL109W	YNL109W	RPS26B	P39939	119 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YNL109W	YNL109W	PIC2	P40035	300 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YNL109W	YNL109W	IRC24	P40580	263 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YNL109W	YNL109W	YNR063W	P53749	607 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YNL109W	YNL109W	SDH1	Q00711	640 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YNL109W	YNL109W	EAR1	Q03212	550 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YNL109W	YNL109W	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YNL109W	YNL109W	AVT1	P47082	602 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YNL109W	YNL109W	ESF1	Q06344	628 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YNL109W	YNL109W	ATE1	P16639	503 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YNL109W	YNL109W	PRO1	P32264	428 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YNL109W	YNL109W	YHL012W	P38709	493 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YNL109W	YNL109W	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YNL109W	YNL109W	SSY1	Q03770	852 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YNL109W	YNL109W	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YNL109W	YNL109W	AOS1	Q06624	347 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YNL109W	YNL109W	ELM1	P32801	640 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YNL109W	YNL109W	SEC8	P32855	1065 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YNL109W	YNL109W	HSP78	P33416	811 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YNL109W	YNL109W	ENV11	P53246	860 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YNL109W	YNL109W	SIW14	P53965	281 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YNL109W	YNL109W	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YNL109W	YNL109W	PTC5	Q12511	572 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YNL109W	YNL109W	DFG16	Q99234	619 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YNL109W	YNL109W	HEM13	P11353	328 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YNL109W	YNL109W	RAD27	P26793	382 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YNL109W	YNL109W	PEP7	P32609	515 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YNL109W	YNL109W	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YNL109W	YNL109W	PTC7	P38797	343 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YNL109W	YNL109W	YPL260W	Q08977	551 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YNL109W	YNL109W	COQ4	O13525	335 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YNL109W	YNL109W	SAM35	P14693	329 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YNL109W	YNL109W	NAP1	P25293	417 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YNL109W	YNL109W	MCM2	P29469	868 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YNL109W	YNL109W	YSC84	P32793	468 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YNL109W	YNL109W	NIT1	P40447	199 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YNL109W	YNL109W	GTS1	P40956	396 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YNL109W	YNL109W	HDA2	Q06629	674 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YNL109W	YNL109W	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YNL109W	YNL109W	ALG3	P38179	458 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNL109W	YNL109W	CCZ1	P38273	704 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNL109W	YNL109W	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YNL109W	YNL109W	YJL045W	P47052	634 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNL109W	YNL109W	TNA1	P53322	534 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNL109W	YNL109W	MRL1	Q06815	381 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNL109W	YNL109W	DED1	P06634	604 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YNL109W	YNL109W	KIP1	P28742	1111 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNL109W	YNL109W	AFG2	P32794	780 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNL109W	YNL109W	RGD1	P38339	666 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNL109W	YNL109W	PRP43	P53131	767 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YNL109W	YNL109W	UBP3	Q01477	912 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.91	□□□□□ -1.62	not detected
YNL109W	YNL109W	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YNL109W	YNL109W	SPR28	Q04921	423 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNL109W	YNL109W	RTT10	Q08924	1013 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNL109W	YNL109W	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YNL109W	YNL109W	PUF4	P25339	888 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.9	□□□□□ -1.63	not detected
YNL109W	YNL109W	MKK2	P32491	506 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNL109W	YNL109W	LRG1	P35688	1017 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNL109W	YNL109W	SEA4	P38164	1038 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNL109W	YNL109W	NMD3	P38861	518 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YNL109W	YNL109W	FYV10	P40492	516 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNL109W	YNL109W	ROD1	Q02805	837 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNL109W	YNL109W	OYE2	Q03558	400 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YNL109W	YNL109W	RSC58	Q07979	502 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNL109W	YNL109W	GCR1	P07261	785 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YNL109W	YNL109W	SYP1	P25623	870 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YNL109W	YNL109W	SEG2	P34250	1132 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YNL109W	YNL109W	MNR2	P35724	969 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YNL109W	YNL109W	CNN1	P43618	361 aa		4.89	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 17.7 ms