RNA–Protein interactions for RNA: YJL063C

MRPL8, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the large subunit, yeast

Gene MRPL8, Length 717 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRPL8	YJL063C	UFD2	P54860	961 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MRPL8	YJL063C	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	13.44	□□□□□ -0.26	not detected
MRPL8	YJL063C	PUF6	Q04373	656 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
MRPL8	YJL063C	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
MRPL8	YJL063C	FLR1	P38124	548 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MRPL8	YJL063C	SPT2	P06843	333 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
MRPL8	YJL063C	SWI6	P09959	803 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MRPL8	YJL063C	RIT1	P23796	513 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MRPL8	YJL063C	RDH54	P38086	958 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MRPL8	YJL063C	BBC1	P47068	1157 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MRPL8	YJL063C	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
MRPL8	YJL063C	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	13.41	□□□□□ -0.26	not detected
MRPL8	YJL063C	ALD5	P40047	520 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
MRPL8	YJL063C	VID30	P53076	958 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MRPL8	YJL063C	MSC2	Q03455	724 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MRPL8	YJL063C	INP51	P40559	946 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
MRPL8	YJL063C	LSB1	P53281	241 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MRPL8	YJL063C	PKH3	Q03306	898 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
MRPL8	YJL063C	SUE1	Q06524	206 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MRPL8	YJL063C	GUD1	Q07729	489 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MRPL8	YJL063C	YLL058W	Q12198	575 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MRPL8	YJL063C	MYO1	P08964	1928 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MRPL8	YJL063C	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
MRPL8	YJL063C	ATG11	Q12527	1178 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MRPL8	YJL063C	TOR2	P32600	2474 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
MRPL8	YJL063C	NUC1	P08466	329 aa		13.38	□□□□□ -0.27
MRPL8	YJL063C	IDI1	P15496	288 aa		13.38	□□□□□ -0.27
MRPL8	YJL063C	MET1	P36150	593 aa		13.38	□□□□□ -0.27
MRPL8	YJL063C	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
MRPL8	YJL063C	BRE1	Q07457	700 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
MRPL8	YJL063C	TY1B-A	O13527	1196 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
MRPL8	YJL063C	DSF2	P38213	736 aa		13.37	□□□□□ -0.27
MRPL8	YJL063C	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
MRPL8	YJL063C	POA1	P38218	177 aa		13.36	□□□□□ -0.27
MRPL8	YJL063C	SPO74	P45819	413 aa		13.36	□□□□□ -0.27
MRPL8	YJL063C	FMP10	P40098	244 aa		13.35	□□□□□ -0.27
MRPL8	YJL063C	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
MRPL8	YJL063C	LIF1	P53150	421 aa		13.35	□□□□□ -0.27
MRPL8	YJL063C	MOT1	P32333	1867 aa		13.35	□□□□□ -0.27
MRPL8	YJL063C	OPI1	P21957	404 aa		13.34	□□□□□ -0.27
MRPL8	YJL063C	AFT1	P22149	690 aa		13.34	□□□□□ -0.27
MRPL8	YJL063C	KTR1	P27810	393 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
MRPL8	YJL063C	ANP1	P32629	500 aa		13.34	□□□□□ -0.27
MRPL8	YJL063C	TVP23	P38962	199 aa		13.34	□□□□□ -0.27
MRPL8	YJL063C	FMS1	P50264	508 aa		13.34	□□□□□ -0.27
MRPL8	YJL063C	MRPS35	P53292	345 aa		13.34	□□□□□ -0.27
MRPL8	YJL063C	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
MRPL8	YJL063C	NDT80	P38830	627 aa		13.33	□□□□□ -0.28
MRPL8	YJL063C	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
MRPL8	YJL063C	HEH2	Q03281	663 aa		13.33	□□□□□ -0.28
MRPL8	YJL063C	SMY2	P32909	740 aa	Known RBP	13.32	□□□□□ -0.28
MRPL8	YJL063C	MYO3	P36006	1272 aa		13.32	□□□□□ -0.28
MRPL8	YJL063C	UBP15	P50101	1230 aa		13.32	□□□□□ -0.28
MRPL8	YJL063C	FUB1	P25659	250 aa		13.31	□□□□□ -0.28
MRPL8	YJL063C	SEC20	P28791	383 aa		13.31	□□□□□ -0.28
MRPL8	YJL063C	SKY1	Q03656	742 aa		13.31	□□□□□ -0.28
MRPL8	YJL063C	YML020W	Q03722	664 aa		13.31	□□□□□ -0.28
MRPL8	YJL063C	URK1	P27515	501 aa		13.3	□□□□□ -0.28
MRPL8	YJL063C	HUL5	P53119	910 aa		13.3	□□□□□ -0.28
MRPL8	YJL063C	MET13	P53128	600 aa		13.3	□□□□□ -0.28
MRPL8	YJL063C	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
MRPL8	YJL063C	CTR1	P49573	406 aa		13.29	□□□□□ -0.28
MRPL8	YJL063C	TOR1	P35169	2470 aa		13.29	□□□□□ -0.28
MRPL8	YJL063C	INP52	P50942	1183 aa		13.28	□□□□□ -0.28
MRPL8	YJL063C	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
MRPL8	YJL063C	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
MRPL8	YJL063C	YGR035C	P53222	116 aa		13.27	□□□□□ -0.29
MRPL8	YJL063C	SYN8	P31377	255 aa		13.26	□□□□□ -0.29
MRPL8	YJL063C	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
MRPL8	YJL063C	TPM2	P40414	161 aa		13.26	□□□□□ -0.29
MRPL8	YJL063C	SVF1	Q05515	481 aa		13.26	□□□□□ -0.29
MRPL8	YJL063C	SPO71	Q03868	1245 aa		13.25	□□□□□ -0.29
MRPL8	YJL063C	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
MRPL8	YJL063C	RPL8A	P17076	256 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
MRPL8	YJL063C	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
MRPL8	YJL063C	YNL034W	P53963	612 aa		13.24	□□□□□ -0.29
MRPL8	YJL063C	YNL018C	P53976	612 aa		13.24	□□□□□ -0.29
MRPL8	YJL063C	LCD1	Q04377	747 aa		13.24	□□□□□ -0.29
MRPL8	YJL063C	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
MRPL8	YJL063C	POL3	P15436	1097 aa		13.23	□□□□□ -0.29
MRPL8	YJL063C	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
MRPL8	YJL063C	VIP1	Q06685	1146 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
MRPL8	YJL063C	RAD59	Q12223	238 aa		13.23	□□□□□ -0.29
MRPL8	YJL063C	MAK31	P23059	88 aa		13.22	□□□□□ -0.29
MRPL8	YJL063C	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	13.22	□□□□□ -0.29	not detected
MRPL8	YJL063C	HDA1	P53973	706 aa		13.22	□□□□□ -0.29
MRPL8	YJL063C	MDM1	Q01846	1127 aa		13.22	□□□□□ -0.29
MRPL8	YJL063C	ECM16	Q04217	1267 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
MRPL8	YJL063C	GPI13	Q07830	1017 aa		13.22	□□□□□ -0.29
MRPL8	YJL063C	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
MRPL8	YJL063C	HMF1	P40037	129 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
MRPL8	YJL063C	CSM2	P40465	213 aa		13.21	□□□□□ -0.29
MRPL8	YJL063C	YLR326W	Q06170	240 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
MRPL8	YJL063C	MAG2	Q06436	670 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
MRPL8	YJL063C	UGA4	P32837	571 aa		13.2	□□□□□ -0.3
MRPL8	YJL063C	DID4	P36108	232 aa		13.2	□□□□□ -0.3
MRPL8	YJL063C	ALG2	P43636	503 aa		13.2	□□□□□ -0.3
MRPL8	YJL063C	MYO5	Q04439	1219 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
MRPL8	YJL063C	MMR1	Q06324	491 aa		13.2	□□□□□ -0.3
MRPL8	YJL063C	FAB1	P34756	2278 aa		13.2	□□□□□ -0.3

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