RNA–Protein interactions for RNA: YCL036W

GFD2, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene GFD2, Length 1,701 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GFD2	YCL036W	PMA1	P05030	918 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
GFD2	YCL036W	THR4	P16120	514 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
GFD2	YCL036W	CDC15	P27636	974 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GFD2	YCL036W	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
GFD2	YCL036W	PES4	P39684	611 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GFD2	YCL036W	ASE1	P50275	885 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GFD2	YCL036W	RTC4	P53850	401 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GFD2	YCL036W	AAD16	Q02895	342 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GFD2	YCL036W	RET3	P53600	189 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GFD2	YCL036W	PSR2	Q07949	397 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GFD2	YCL036W	AFT2	Q08957	416 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GFD2	YCL036W	EBP2	P36049	427 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
GFD2	YCL036W	VPS45	P38932	577 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GFD2	YCL036W	YGR153W	P48238	217 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GFD2	YCL036W	SUE1	Q06524	206 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GFD2	YCL036W	TMA16	Q08687	178 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GFD2	YCL036W	TUB2	P02557	457 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
GFD2	YCL036W	KEL1	P38853	1164 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
GFD2	YCL036W	UBP9	P39967	754 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GFD2	YCL036W	DAK2	P43550	591 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GFD2	YCL036W	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
GFD2	YCL036W	RAD53	P22216	821 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GFD2	YCL036W	SAS3	P34218	831 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GFD2	YCL036W	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
GFD2	YCL036W	CIT3	P43635	486 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GFD2	YCL036W	SNU71	P53207	620 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
GFD2	YCL036W	LAP2	Q10740	671 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GFD2	YCL036W	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
GFD2	YCL036W	HPR1	P17629	752 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
GFD2	YCL036W	HIR1	P32479	840 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GFD2	YCL036W	DSE4	P53753	1117 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GFD2	YCL036W	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
GFD2	YCL036W	FET4	P40988	552 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GFD2	YCL036W	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
GFD2	YCL036W	VIP1	Q06685	1146 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
GFD2	YCL036W	GLC3	P32775	704 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GFD2	YCL036W	MNR2	P35724	969 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GFD2	YCL036W	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
GFD2	YCL036W	FPK1	P53739	893 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GFD2	YCL036W	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
GFD2	YCL036W	MFT1	P33441	392 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
GFD2	YCL036W	UBA2	P52488	636 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GFD2	YCL036W	YGR117C	P53270	476 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GFD2	YCL036W	SDA1	P53313	767 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
GFD2	YCL036W	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
GFD2	YCL036W	CBP1	P07252	654 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GFD2	YCL036W	MNN4	P36044	1178 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GFD2	YCL036W	ATG32	P40458	529 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GFD2	YCL036W	FKS1	P38631	1876 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
GFD2	YCL036W	SPT21	P35209	758 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GFD2	YCL036W	SLI15	P38283	698 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GFD2	YCL036W	TPM2	P40414	161 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GFD2	YCL036W	LSC2	P53312	427 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GFD2	YCL036W	ESC2	Q06340	456 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GFD2	YCL036W	RPL8A	P17076	256 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
GFD2	YCL036W	ERG7	P38604	731 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GFD2	YCL036W	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
GFD2	YCL036W	SEC20	P28791	383 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GFD2	YCL036W	THI6	P41835	540 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GFD2	YCL036W	YGR237C	P50089	785 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GFD2	YCL036W	CSM3	Q04659	317 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GFD2	YCL036W	UTP4	Q06679	776 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
GFD2	YCL036W	NDT80	P38830	627 aa		13.51	□□□□□ -0.25
GFD2	YCL036W	NIT1	P40447	199 aa		13.51	□□□□□ -0.25
GFD2	YCL036W	STU2	P46675	888 aa		13.51	□□□□□ -0.25
GFD2	YCL036W	LSB1	P53281	241 aa		13.51	□□□□□ -0.25
GFD2	YCL036W	VPS75	P53853	264 aa		13.51	□□□□□ -0.25
GFD2	YCL036W	AIM33	Q04516	312 aa		13.51	□□□□□ -0.25
GFD2	YCL036W	ADY4	Q05955	493 aa		13.51	□□□□□ -0.25
GFD2	YCL036W	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
GFD2	YCL036W	PET10	P36139	283 aa		13.5	□□□□□ -0.25
GFD2	YCL036W	BCD1	P38772	366 aa		13.5	□□□□□ -0.25
GFD2	YCL036W	STR2	P47164	639 aa		13.5	□□□□□ -0.25
GFD2	YCL036W	YGR273C	P53329	174 aa		13.5	□□□□□ -0.25
GFD2	YCL036W	AIM7	Q12156	149 aa		13.5	□□□□□ -0.25
GFD2	YCL036W	YET1	P35723	206 aa		13.49	□□□□□ -0.25
GFD2	YCL036W	GAA1	P39012	614 aa		13.49	□□□□□ -0.25
GFD2	YCL036W	MGA2	P40578	1113 aa		13.49	□□□□□ -0.25
GFD2	YCL036W	VTC2	P43585	828 aa		13.49	□□□□□ -0.25
GFD2	YCL036W	YLR278C	Q05854	1341 aa		13.49	□□□□□ -0.25
GFD2	YCL036W	CDC37	P06101	506 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
GFD2	YCL036W	PDC1	P06169	563 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
GFD2	YCL036W	PAN5	P38787	379 aa		13.48	□□□□□ -0.25
GFD2	YCL036W	ORC6	P38826	435 aa		13.48	□□□□□ -0.25
GFD2	YCL036W	EMP47	P43555	445 aa		13.48	□□□□□ -0.25
GFD2	YCL036W	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
GFD2	YCL036W	FOB1	O13329	566 aa		13.47	□□□□□ -0.25
GFD2	YCL036W	PHO13	P19881	312 aa		13.47	□□□□□ -0.25
GFD2	YCL036W	GSY1	P23337	708 aa		13.47	□□□□□ -0.25
GFD2	YCL036W	MRC1	P25588	1096 aa		13.47	□□□□□ -0.25
GFD2	YCL036W	PSO2	P30620	661 aa		13.47	□□□□□ -0.25
GFD2	YCL036W	AIP1	P46680	615 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
GFD2	YCL036W	TLG2	Q08144	397 aa		13.47	□□□□□ -0.25
GFD2	YCL036W	OXR1	Q08952	273 aa		13.47	□□□□□ -0.25
GFD2	YCL036W	APL4	Q12028	832 aa		13.47	□□□□□ -0.25
GFD2	YCL036W	MSH3	P25336	1018 aa		13.47	□□□□□ -0.25
GFD2	YCL036W	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
GFD2	YCL036W	SUL1	P38359	859 aa		13.47	□□□□□ -0.25
GFD2	YCL036W	CBK1	P53894	756 aa		13.47	□□□□□ -0.25
GFD2	YCL036W	EBS1	Q03466	884 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25

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