RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641482.1

MFSD8-233, Transcript of major facilitator superfamily domain containing 8, human

BASIC

Gene MFSD8, Length 4,860 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MFSD8-233	ENST00000641482	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MFSD8-233	ENST00000641482	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MFSD8-233	ENST00000641482	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MFSD8-233	ENST00000641482	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MFSD8-233	ENST00000641482	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MFSD8-233	ENST00000641482	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MFSD8-233	ENST00000641482	HOXC9	P31274	260 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MFSD8-233	ENST00000641482	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MFSD8-233	ENST00000641482	RREB1	Q92766	1687 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MFSD8-233	ENST00000641482	CACNA1F	O60840	1977 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MFSD8-233	ENST00000641482	CRB1	P82279	1406 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MFSD8-233	ENST00000641482	NEFM	P07197	916 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MFSD8-233	ENST00000641482	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MFSD8-233	ENST00000641482	NME9	Q86XW9	330 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MFSD8-233	ENST00000641482	KIAA0232	Q92628	1395 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MFSD8-233	ENST00000641482	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MFSD8-233	ENST00000641482	ABTB2	Q8N961	1025 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MFSD8-233	ENST00000641482	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MFSD8-233	ENST00000641482	MTHFS	P49914	203 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MFSD8-233	ENST00000641482	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	4.63	□□□□□ -1.67
MFSD8-233	ENST00000641482	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MFSD8-233	ENST00000641482	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MFSD8-233	ENST00000641482	RGPD5	Q99666	1765 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MFSD8-233	ENST00000641482	ECM2	O94769	699 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MFSD8-233	ENST00000641482	GC	P02774	474 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MFSD8-233	ENST00000641482	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MFSD8-233	ENST00000641482	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MFSD8-233	ENST00000641482	NLRP6	P59044	892 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MFSD8-233	ENST00000641482	TSPYL2	Q9H2G4	693 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MFSD8-233	ENST00000641482	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MFSD8-233	ENST00000641482		E9PSI1	815 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MFSD8-233	ENST00000641482	RGL2	O15211	777 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MFSD8-233	ENST00000641482	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MFSD8-233	ENST00000641482	NHS	Q6T4R5	1651 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MFSD8-233	ENST00000641482	HOXB7	P09629	217 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MFSD8-233	ENST00000641482	NFE2L2	Q16236	605 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MFSD8-233	ENST00000641482	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MFSD8-233	ENST00000641482	ORAI2	Q96SN7	254 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MFSD8-233	ENST00000641482	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MFSD8-233	ENST00000641482	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MFSD8-233	ENST00000641482	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MFSD8-233	ENST00000641482	TNS2	Q63HR2	1409 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MFSD8-233	ENST00000641482	ERBB3	P21860	1342 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MFSD8-233	ENST00000641482	ATRN	O75882	1429 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MFSD8-233	ENST00000641482	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MFSD8-233	ENST00000641482	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MFSD8-233	ENST00000641482	IFT57	Q9NWB7	429 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MFSD8-233	ENST00000641482	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MFSD8-233	ENST00000641482	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MFSD8-233	ENST00000641482	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MFSD8-233	ENST00000641482	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MFSD8-233	ENST00000641482	CD44	P16070	742 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-233	ENST00000641482	MAP3K5	Q99683	1374 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-233	ENST00000641482	C5	P01031	1676 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-233	ENST00000641482	C19orf67	A6NJJ6	358 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-233	ENST00000641482	AMPH	P49418	695 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-233	ENST00000641482	CHRM1	P11229	460 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-233	ENST00000641482	MS4A1	P11836	297 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-233	ENST00000641482	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-233	ENST00000641482	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-233	ENST00000641482	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-233	ENST00000641482	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-233	ENST00000641482	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-233	ENST00000641482	ZNF853	P0CG23	659 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MFSD8-233	ENST00000641482	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MFSD8-233	ENST00000641482	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MFSD8-233	ENST00000641482	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MFSD8-233	ENST00000641482	POTEH	Q6S545	545 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MFSD8-233	ENST00000641482	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MFSD8-233	ENST00000641482	GNAI1	P63096	354 aa		4.59	□□□□□ -1.68
MFSD8-233	ENST00000641482	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		4.59	□□□□□ -1.68
MFSD8-233	ENST00000641482	SPG7	Q9UQ90	795 aa		4.59	□□□□□ -1.68
MFSD8-233	ENST00000641482	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		4.59	□□□□□ -1.68
MFSD8-233	ENST00000641482	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		4.59	□□□□□ -1.68
MFSD8-233	ENST00000641482	FOXO3	O43524	673 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MFSD8-233	ENST00000641482	GOLGA2	Q08379	1002 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MFSD8-233	ENST00000641482	SLFN5	Q08AF3	891 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MFSD8-233	ENST00000641482	ERBB4	Q15303	1308 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MFSD8-233	ENST00000641482	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MFSD8-233	ENST00000641482	VPS72	Q15906	364 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MFSD8-233	ENST00000641482	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MFSD8-233	ENST00000641482	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MFSD8-233	ENST00000641482	HAX1	O00165	279 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MFSD8-233	ENST00000641482	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MFSD8-233	ENST00000641482	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MFSD8-233	ENST00000641482	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MFSD8-233	ENST00000641482	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MFSD8-233	ENST00000641482	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MFSD8-233	ENST00000641482	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MFSD8-233	ENST00000641482	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MFSD8-233	ENST00000641482	PYGB	P11216	843 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MFSD8-233	ENST00000641482	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	4.57	□□□□□ -1.68	2e-6	■■■□□ 16.1
MFSD8-233	ENST00000641482	WWC1	Q8IX03	1113 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MFSD8-233	ENST00000641482	CFAP44	Q96MT7	982 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MFSD8-233	ENST00000641482	EYA1	Q99502	592 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MFSD8-233	ENST00000641482	LY75	O60449	1722 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MFSD8-233	ENST00000641482	ATP10D	Q9P241	1426 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MFSD8-233	ENST00000641482	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MFSD8-233	ENST00000641482	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MFSD8-233	ENST00000641482	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68

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