RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637570.1

DCX-211, Transcript of doublecortin, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene DCX, Length 6,162 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCX-211ENST00000637570 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa7.29□□□□□ -1.24
DCX-211ENST00000637570 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
DCX-211ENST00000637570 NBPF3Q9H094 633 aa7.29□□□□□ -1.24
DCX-211ENST00000637570 KLHL10Q6JEL2 608 aa7.29□□□□□ -1.24
DCX-211ENST00000637570 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
DCX-211ENST00000637570 ASZ1Q8WWH4 475 aa7.28□□□□□ -1.24
DCX-211ENST00000637570 HOMER2Q9NSB8 354 aa7.28□□□□□ -1.24
DCX-211ENST00000637570 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
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DCX-211ENST00000637570 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
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DCX-211ENST00000637570 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
DCX-211ENST00000637570 NUB1Q9Y5A7 615 aa7.28□□□□□ -1.24
DCX-211ENST00000637570 WWC2Q6AWC2 1192 aa7.28□□□□□ -1.24
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DCX-211ENST00000637570 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
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DCX-211ENST00000637570 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa7.28□□□□□ -1.24
DCX-211ENST00000637570 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa7.28□□□□□ -1.24
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DCX-211ENST00000637570 ABCC8Q09428 1581 aa7.28□□□□□ -1.24
DCX-211ENST00000637570 LMAN1P49257 510 aa7.27□□□□□ -1.24
DCX-211ENST00000637570 EXOC1Q9NV70 894 aa7.27□□□□□ -1.24
DCX-211ENST00000637570 DTNBO60941 627 aa7.27□□□□□ -1.25
DCX-211ENST00000637570 NASPP49321 788 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
DCX-211ENST00000637570 SETDB1Q15047 1291 aa7.27□□□□□ -1.25
DCX-211ENST00000637570 CCDC6Q16204 474 aa7.27□□□□□ -1.25
DCX-211ENST00000637570 CEP164Q9UPV0 1460 aa7.27□□□□□ -1.25
DCX-211ENST00000637570 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa7.27□□□□□ -1.25
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DCX-211ENST00000637570 STAMBPO95630 424 aa7.27□□□□□ -1.25
DCX-211ENST00000637570 SKOR1P84550 965 aa7.27□□□□□ -1.25
DCX-211ENST00000637570 FOXD1Q16676 465 aa7.27□□□□□ -1.25
DCX-211ENST00000637570 GSDMBQ8TAX9 411 aa7.27□□□□□ -1.25
DCX-211ENST00000637570 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP7.27□□□□□ -1.25
DCX-211ENST00000637570 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
DCX-211ENST00000637570 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa7.27□□□□□ -1.25
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DCX-211ENST00000637570 HPS4Q9NQG7 708 aa7.27□□□□□ -1.25
DCX-211ENST00000637570 DNAJC3Q13217 504 aa7.27□□□□□ -1.25
DCX-211ENST00000637570 DBN1Q16643 649 aa7.27□□□□□ -1.25
DCX-211ENST00000637570 PRR16Q569H4 304 aa7.27□□□□□ -1.25
DCX-211ENST00000637570 ZNF853P0CG23 659 aa7.26□□□□□ -1.25
DCX-211ENST00000637570 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP7.26□□□□□ -1.25
DCX-211ENST00000637570 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa7.26□□□□□ -1.25
DCX-211ENST00000637570 PFDN4Q9NQP4 134 aa7.26□□□□□ -1.25
DCX-211ENST00000637570 RSPH14Q9UHP6 348 aa7.26□□□□□ -1.25
DCX-211ENST00000637570 HDAC9Q9UKV0 1011 aa7.26□□□□□ -1.25
DCX-211ENST00000637570 IFFO1Q0D2I5 559 aa7.26□□□□□ -1.25
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DCX-211ENST00000637570 SUFUQ9UMX1 484 aa7.26□□□□□ -1.25
DCX-211ENST00000637570 MX2P20592 715 aa7.26□□□□□ -1.25
DCX-211ENST00000637570 TDO2P48775 406 aa7.26□□□□□ -1.25
DCX-211ENST00000637570 WASHC4Q2M389 1173 aa7.26□□□□□ -1.25
DCX-211ENST00000637570 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa7.26□□□□□ -1.25
DCX-211ENST00000637570 NEUROD6Q96NK8 337 aa7.26□□□□□ -1.25
DCX-211ENST00000637570 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa7.26□□□□□ -1.25
DCX-211ENST00000637570 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
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DCX-211ENST00000637570 KIF5CO60282 957 aa7.25□□□□□ -1.25
DCX-211ENST00000637570 SMIM24O75264 130 aa7.25□□□□□ -1.25
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DCX-211ENST00000637570 TMEM87AQ8NBN3 555 aa7.25□□□□□ -1.25
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DCX-211ENST00000637570 TSKSQ9UJT2 592 aa7.25□□□□□ -1.25
DCX-211ENST00000637570 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
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DCX-211ENST00000637570 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa7.25□□□□□ -1.25
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DCX-211ENST00000637570 PMS1P54277 932 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
DCX-211ENST00000637570 ZBBXA8MT70 800 aa7.25□□□□□ -1.25
DCX-211ENST00000637570 TXNDC9O14530 226 aa7.25□□□□□ -1.25
DCX-211ENST00000637570 NOL3O60936 208 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
DCX-211ENST00000637570 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
DCX-211ENST00000637570 UIMC1Q96RL1 719 aa7.25□□□□□ -1.25
DCX-211ENST00000637570 FIBPO43427 364 aa7.24□□□□□ -1.25
DCX-211ENST00000637570 SLC26A8Q96RN1 970 aa7.24□□□□□ -1.25
DCX-211ENST00000637570 CARD11Q9BXL7 1154 aa7.24□□□□□ -1.25
DCX-211ENST00000637570 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
DCX-211ENST00000637570 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa7.24□□□□□ -1.25
DCX-211ENST00000637570 CADPSQ9ULU8 1353 aa7.24□□□□□ -1.25
DCX-211ENST00000637570 CCDC65Q8IXS2 484 aa7.24□□□□□ -1.25
DCX-211ENST00000637570 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa7.24□□□□□ -1.25
DCX-211ENST00000637570 CCDC174Q6PII3 467 aa7.24□□□□□ -1.25
DCX-211ENST00000637570 EP400NLQ6ZTU2 488 aa7.24□□□□□ -1.25
DCX-211ENST00000637570 SELENOSQ9BQE4 189 aa7.24□□□□□ -1.25
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