RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000633035.1

JMJD1C-211, Transcript of jumonji domain containing 1C, humanhuman

TSL 3

Gene JMJD1C, Length 499 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD1C-211ENST00000633035 MEGF6O75095 1541 aa22.54■■□□□ 1.2
JMJD1C-211ENST00000633035 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
JMJD1C-211ENST00000633035 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
JMJD1C-211ENST00000633035 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
JMJD1C-211ENST00000633035 EYA1Q99502 592 aa22.54■■□□□ 1.2
JMJD1C-211ENST00000633035 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
JMJD1C-211ENST00000633035 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
JMJD1C-211ENST00000633035 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
JMJD1C-211ENST00000633035 SPG7Q9UQ90 795 aa22.51■■□□□ 1.19
JMJD1C-211ENST00000633035 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa22.51■■□□□ 1.19
JMJD1C-211ENST00000633035 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa22.51■■□□□ 1.19
JMJD1C-211ENST00000633035 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
JMJD1C-211ENST00000633035 TXNRD1Q16881 649 aa22.49■■□□□ 1.19
JMJD1C-211ENST00000633035 KAT6BQ8WYB5 2073 aa22.49■■□□□ 1.19
JMJD1C-211ENST00000633035 MTHFSP49914 203 aa22.46■■□□□ 1.19
JMJD1C-211ENST00000633035 NHSQ6T4R5 1651 aa22.46■■□□□ 1.19
JMJD1C-211ENST00000633035 PROM2Q8N271 834 aa22.45■■□□□ 1.18
JMJD1C-211ENST00000633035 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP22.45■■□□□ 1.181e-9■■□□□ 14.2
JMJD1C-211ENST00000633035 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa22.44■■□□□ 1.18
JMJD1C-211ENST00000633035 RREB1Q92766 1687 aa22.43■■□□□ 1.18
JMJD1C-211ENST00000633035 NCAPD2Q15021 1401 aa22.43■■□□□ 1.18
JMJD1C-211ENST00000633035 IGSF1Q8N6C5 1336 aa22.43■■□□□ 1.18
JMJD1C-211ENST00000633035 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
JMJD1C-211ENST00000633035 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa22.43■■□□□ 1.18
JMJD1C-211ENST00000633035 CYP27B1O15528 508 aa22.42■■□□□ 1.18
JMJD1C-211ENST00000633035 STK32BQ9NY57 414 aa22.42■■□□□ 1.18
JMJD1C-211ENST00000633035 NUP188Q5SRE5 1749 aa22.41■■□□□ 1.18
JMJD1C-211ENST00000633035 IFNL2Q8IZJ0 200 aa22.41■■□□□ 1.18
JMJD1C-211ENST00000633035 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
JMJD1C-211ENST00000633035 IL13P35225 146 aa22.39■■□□□ 1.17
JMJD1C-211ENST00000633035 SULT6B1Q6IMI4 303 aa22.39■■□□□ 1.17
JMJD1C-211ENST00000633035 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa22.39■■□□□ 1.17
JMJD1C-211ENST00000633035 SHANK3Q9BYB0 1731 aa22.38■■□□□ 1.17
JMJD1C-211ENST00000633035 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
JMJD1C-211ENST00000633035 AMOTQ4VCS5 1084 aa22.38■■□□□ 1.17
JMJD1C-211ENST00000633035 BTAF1O14981 1849 aa22.38■■□□□ 1.17
JMJD1C-211ENST00000633035 SLC27A3Q5K4L6 730 aa22.37■■□□□ 1.17
JMJD1C-211ENST00000633035 PHKG2P15735 406 aa22.36■■□□□ 1.17
JMJD1C-211ENST00000633035 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
JMJD1C-211ENST00000633035 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
JMJD1C-211ENST00000633035 DOT1LQ8TEK3 1739 aa22.36■■□□□ 1.17
JMJD1C-211ENST00000633035 SLC15A2Q16348 729 aa22.35■■□□□ 1.17
JMJD1C-211ENST00000633035 AEBP1Q8IUX7 1158 aa22.35■■□□□ 1.17
JMJD1C-211ENST00000633035 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa22.35■■□□□ 1.17
JMJD1C-211ENST00000633035 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
JMJD1C-211ENST00000633035 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
JMJD1C-211ENST00000633035 CFAP53Q96M91 514 aa22.34■■□□□ 1.17
JMJD1C-211ENST00000633035 PKD1L3Q7Z443 1732 aa22.34■■□□□ 1.17
JMJD1C-211ENST00000633035 C1orf141Q5JVX7 400 aa22.33■■□□□ 1.17
JMJD1C-211ENST00000633035 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
JMJD1C-211ENST00000633035 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
JMJD1C-211ENST00000633035 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
JMJD1C-211ENST00000633035 TMOD3Q9NYL9 352 aa22.32■■□□□ 1.16
JMJD1C-211ENST00000633035 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
JMJD1C-211ENST00000633035 HMOX1P09601 288 aa22.31■■□□□ 1.16
JMJD1C-211ENST00000633035 SPON1Q9HCB6 807 aa22.31■■□□□ 1.16
JMJD1C-211ENST00000633035 LRRC4BQ9NT99 713 aa22.31■■□□□ 1.16
JMJD1C-211ENST00000633035 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
JMJD1C-211ENST00000633035 KCNQ4P56696 695 aa22.29■■□□□ 1.16
JMJD1C-211ENST00000633035 PIGBQ92521 554 aa22.29■■□□□ 1.16
JMJD1C-211ENST00000633035 DCAF5Q96JK2 942 aa22.29■■□□□ 1.16
JMJD1C-211ENST00000633035 KDRP35968 1356 aa22.28■■□□□ 1.16
JMJD1C-211ENST00000633035 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa22.27■■□□□ 1.16
JMJD1C-211ENST00000633035 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
JMJD1C-211ENST00000633035 NUDCQ9Y266 331 aa22.27■■□□□ 1.16
JMJD1C-211ENST00000633035 PALLDQ8WX93 1383 aa22.26■■□□□ 1.15
JMJD1C-211ENST00000633035 ERVV-2B6SEH9 535 aa22.26■■□□□ 1.15
JMJD1C-211ENST00000633035 PPP2R1AP30153 589 aa22.26■■□□□ 1.15
JMJD1C-211ENST00000633035 LRP5O75197 1615 aa22.26■■□□□ 1.15
JMJD1C-211ENST00000633035 CABP4P57796 275 aa22.25■■□□□ 1.15
JMJD1C-211ENST00000633035 ZBTB7AO95365 584 aa22.24■■□□□ 1.15
JMJD1C-211ENST00000633035 ZNF827Q17R98 1081 aa22.24■■□□□ 1.15
JMJD1C-211ENST00000633035 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
JMJD1C-211ENST00000633035 AKT1S1Q96B36 256 aa22.23■■□□□ 1.15
JMJD1C-211ENST00000633035 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
JMJD1C-211ENST00000633035 AKAP4Q5JQC9 854 aa22.22■■□□□ 1.15
JMJD1C-211ENST00000633035 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
JMJD1C-211ENST00000633035 LY75O60449 1722 aa22.21■■□□□ 1.15
JMJD1C-211ENST00000633035 ASAP1Q9ULH1 1129 aa22.21■■□□□ 1.15
JMJD1C-211ENST00000633035 ITGB4P16144 1822 aa22.21■■□□□ 1.15
JMJD1C-211ENST00000633035 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa22.2■■□□□ 1.14
JMJD1C-211ENST00000633035 MTFR1LQ9H019 292 aa22.2■■□□□ 1.14
JMJD1C-211ENST00000633035 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa22.19■■□□□ 1.14
JMJD1C-211ENST00000633035 MSH5O43196 834 aa22.19■■□□□ 1.14
JMJD1C-211ENST00000633035 SIK1P57059 783 aa22.19■■□□□ 1.14
JMJD1C-211ENST00000633035 ATG3Q9NT62 314 aa22.19■■□□□ 1.14
JMJD1C-211ENST00000633035 PAPPAQ13219 1627 aa22.18■■□□□ 1.14
JMJD1C-211ENST00000633035 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
JMJD1C-211ENST00000633035 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP22.18■■□□□ 1.14
JMJD1C-211ENST00000633035 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
JMJD1C-211ENST00000633035 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
JMJD1C-211ENST00000633035 ATP6V1AP38606 617 aa22.17■■□□□ 1.14
JMJD1C-211ENST00000633035 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa22.17■■□□□ 1.14
JMJD1C-211ENST00000633035 SLC16A10Q8TF71 515 aa22.17■■□□□ 1.14
JMJD1C-211ENST00000633035 AK7Q96M32 723 aa22.16■■□□□ 1.14
JMJD1C-211ENST00000633035 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
JMJD1C-211ENST00000633035 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
JMJD1C-211ENST00000633035 GAS2L2Q8NHY3 880 aa22.15■■□□□ 1.14
JMJD1C-211ENST00000633035 CASZ1Q86V15 1759 aa22.15■■□□□ 1.14
JMJD1C-211ENST00000633035 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa22.14■■□□□ 1.14
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