RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619023.4

AKAP9-216, Transcript of A-kinase anchoring protein 9, human

TSL 5 BASIC

Gene AKAP9, Length 6,006 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP9-216	ENST00000619023	HOMER1	Q86YM7	354 aa		13.58	□□□□□ -0.24
AKAP9-216	ENST00000619023	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
AKAP9-216	ENST00000619023	ZNF396	Q96N95	335 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
AKAP9-216	ENST00000619023	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		13.58	□□□□□ -0.24
AKAP9-216	ENST00000619023	RAB11FIP3	O75154	756 aa		13.58	□□□□□ -0.24
AKAP9-216	ENST00000619023	ANKRD20A12P	Q8NF67	263 aa		13.58	□□□□□ -0.24
AKAP9-216	ENST00000619023	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		13.58	□□□□□ -0.24
AKAP9-216	ENST00000619023	PCMTD1	Q96MG8	357 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
AKAP9-216	ENST00000619023	PTPRC	P08575	1304 aa		13.58	□□□□□ -0.24
AKAP9-216	ENST00000619023	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		13.58	□□□□□ -0.24
AKAP9-216	ENST00000619023	MBIP	Q9NS73	344 aa		13.57	□□□□□ -0.24
AKAP9-216	ENST00000619023	RAD21	O60216	631 aa		13.57	□□□□□ -0.24
AKAP9-216	ENST00000619023	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		13.57	□□□□□ -0.24
AKAP9-216	ENST00000619023	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		13.57	□□□□□ -0.24
AKAP9-216	ENST00000619023	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
AKAP9-216	ENST00000619023	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		13.57	□□□□□ -0.24
AKAP9-216	ENST00000619023	CEP170	Q5SW79	1584 aa		13.57	□□□□□ -0.24
AKAP9-216	ENST00000619023	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
AKAP9-216	ENST00000619023	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		13.56	□□□□□ -0.24
AKAP9-216	ENST00000619023	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		13.56	□□□□□ -0.24
AKAP9-216	ENST00000619023	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
AKAP9-216	ENST00000619023	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
AKAP9-216	ENST00000619023	FAM177B	A6PVY3	158 aa		13.56	□□□□□ -0.24
AKAP9-216	ENST00000619023	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
AKAP9-216	ENST00000619023	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
AKAP9-216	ENST00000619023	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	13.56	□□□□□ -0.24	2e-6	■□□□□ 10.7
AKAP9-216	ENST00000619023	ABCC2	Q92887	1545 aa		13.56	□□□□□ -0.24
AKAP9-216	ENST00000619023	PIK3C2G	O75747	1445 aa		13.56	□□□□□ -0.24
AKAP9-216	ENST00000619023	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		13.56	□□□□□ -0.24
AKAP9-216	ENST00000619023	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
AKAP9-216	ENST00000619023	TESK2	Q96S53	571 aa		13.55	□□□□□ -0.24
AKAP9-216	ENST00000619023	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		13.55	□□□□□ -0.24
AKAP9-216	ENST00000619023	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
AKAP9-216	ENST00000619023	SDF4	Q9BRK5	362 aa		13.55	□□□□□ -0.24
AKAP9-216	ENST00000619023		F6X3S4	739 aa		13.55	□□□□□ -0.24
AKAP9-216	ENST00000619023	XBP1	P17861	261 aa		13.55	□□□□□ -0.24
AKAP9-216	ENST00000619023	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
AKAP9-216	ENST00000619023	TRIM5	Q9C035	493 aa		13.55	□□□□□ -0.24
AKAP9-216	ENST00000619023	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
AKAP9-216	ENST00000619023	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		13.54	□□□□□ -0.24
AKAP9-216	ENST00000619023	KIN	O60870	393 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
AKAP9-216	ENST00000619023	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		13.54	□□□□□ -0.24
AKAP9-216	ENST00000619023	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		13.54	□□□□□ -0.24
AKAP9-216	ENST00000619023	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		13.54	□□□□□ -0.24
AKAP9-216	ENST00000619023	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
AKAP9-216	ENST00000619023	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
AKAP9-216	ENST00000619023	FAM83G	A6ND36	823 aa		13.53	□□□□□ -0.24
AKAP9-216	ENST00000619023	CCDC192	P0DO97	292 aa		13.53	□□□□□ -0.24
AKAP9-216	ENST00000619023	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		13.53	□□□□□ -0.24
AKAP9-216	ENST00000619023	TNMD	Q9H2S6	317 aa		13.53	□□□□□ -0.24
AKAP9-216	ENST00000619023	ABCC1	P33527	1531 aa		13.53	□□□□□ -0.24
AKAP9-216	ENST00000619023	NUCB1	Q02818	461 aa		13.52	□□□□□ -0.24
AKAP9-216	ENST00000619023	CCDC70	Q6NSX1	233 aa		13.52	□□□□□ -0.24
AKAP9-216	ENST00000619023	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		13.52	□□□□□ -0.25
AKAP9-216	ENST00000619023	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
AKAP9-216	ENST00000619023	SMC2	O95347	1197 aa		13.52	□□□□□ -0.25
AKAP9-216	ENST00000619023	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
AKAP9-216	ENST00000619023	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		13.52	□□□□□ -0.25
AKAP9-216	ENST00000619023	KRT85	P78386	507 aa		13.52	□□□□□ -0.25
AKAP9-216	ENST00000619023	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		13.52	□□□□□ -0.25
AKAP9-216	ENST00000619023	SPC24	Q8NBT2	197 aa		13.52	□□□□□ -0.25
AKAP9-216	ENST00000619023	STK38	Q15208	465 aa		13.51	□□□□□ -0.25
AKAP9-216	ENST00000619023	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
AKAP9-216	ENST00000619023	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
AKAP9-216	ENST00000619023	PDILT	Q8N807	584 aa		13.51	□□□□□ -0.25
AKAP9-216	ENST00000619023	GPS2	Q13227	327 aa		13.51	□□□□□ -0.25
AKAP9-216	ENST00000619023	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		13.51	□□□□□ -0.25
AKAP9-216	ENST00000619023	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		13.51	□□□□□ -0.25
AKAP9-216	ENST00000619023	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		13.51	□□□□□ -0.25
AKAP9-216	ENST00000619023	ACE	P12821	1306 aa		13.51	□□□□□ -0.25
AKAP9-216	ENST00000619023	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	13.51	□□□□□ -0.25
AKAP9-216	ENST00000619023	FBLN1	P23142	703 aa		13.5	□□□□□ -0.25
AKAP9-216	ENST00000619023	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
AKAP9-216	ENST00000619023	ZNF771	Q7L3S4	317 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
AKAP9-216	ENST00000619023	KDM6B	O15054	1643 aa		13.5	□□□□□ -0.25
AKAP9-216	ENST00000619023	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		13.5	□□□□□ -0.25
AKAP9-216	ENST00000619023	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		13.5	□□□□□ -0.25
AKAP9-216	ENST00000619023	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		13.5	□□□□□ -0.25
AKAP9-216	ENST00000619023	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		13.5	□□□□□ -0.25
AKAP9-216	ENST00000619023	ATP7A	Q04656	1500 aa		13.5	□□□□□ -0.25
AKAP9-216	ENST00000619023	SPATA32	Q96LK8	384 aa		13.5	□□□□□ -0.25
AKAP9-216	ENST00000619023	MYD88	Q99836	296 aa		13.5	□□□□□ -0.25
AKAP9-216	ENST00000619023	IPO7	O95373	1038 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
AKAP9-216	ENST00000619023	KRT32	Q14532	448 aa		13.49	□□□□□ -0.25
AKAP9-216	ENST00000619023	TTC22	Q5TAA0	569 aa		13.49	□□□□□ -0.25
AKAP9-216	ENST00000619023	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
AKAP9-216	ENST00000619023	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
AKAP9-216	ENST00000619023	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
AKAP9-216	ENST00000619023	TNR	Q92752	1358 aa		13.49	□□□□□ -0.25
AKAP9-216	ENST00000619023	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
AKAP9-216	ENST00000619023	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		13.49	□□□□□ -0.25
AKAP9-216	ENST00000619023	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
AKAP9-216	ENST00000619023	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		13.49	□□□□□ -0.25
AKAP9-216	ENST00000619023	CCDC69	A6NI79	296 aa		13.48	□□□□□ -0.25
AKAP9-216	ENST00000619023	SSFA2	P28290	1259 aa		13.48	□□□□□ -0.25
AKAP9-216	ENST00000619023	FLII	Q13045	1269 aa		13.48	□□□□□ -0.25
AKAP9-216	ENST00000619023	C8orf34	Q49A92	452 aa		13.48	□□□□□ -0.25
AKAP9-216	ENST00000619023	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		13.48	□□□□□ -0.25
AKAP9-216	ENST00000619023	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
AKAP9-216	ENST00000619023	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		13.48	□□□□□ -0.25

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