RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609232.5

CTCFL-222, Transcript of CCCTC-binding factor like, human

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTCFL, Length 3,668 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTCFL-222	ENST00000609232	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	12.41	□□□□□ -0.42
CTCFL-222	ENST00000609232	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		12.41	□□□□□ -0.42
CTCFL-222	ENST00000609232	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		12.41	□□□□□ -0.42
CTCFL-222	ENST00000609232	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	12.41	□□□□□ -0.42
CTCFL-222	ENST00000609232	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	12.41	□□□□□ -0.42
CTCFL-222	ENST00000609232	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	12.4	□□□□□ -0.42
CTCFL-222	ENST00000609232	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		12.4	□□□□□ -0.42
CTCFL-222	ENST00000609232	FLT4	P35916	1363 aa		12.4	□□□□□ -0.42
CTCFL-222	ENST00000609232	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	12.4	□□□□□ -0.42
CTCFL-222	ENST00000609232	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	12.4	□□□□□ -0.42
CTCFL-222	ENST00000609232	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		12.4	□□□□□ -0.42
CTCFL-222	ENST00000609232	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		12.4	□□□□□ -0.42
CTCFL-222	ENST00000609232	STRN4	Q9NRL3	753 aa		12.4	□□□□□ -0.43
CTCFL-222	ENST00000609232	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	12.39	□□□□□ -0.43
CTCFL-222	ENST00000609232	EYA1	Q99502	592 aa		12.39	□□□□□ -0.43
CTCFL-222	ENST00000609232	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		12.39	□□□□□ -0.43
CTCFL-222	ENST00000609232	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	12.39	□□□□□ -0.43
CTCFL-222	ENST00000609232	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	12.39	□□□□□ -0.43
CTCFL-222	ENST00000609232	HOXC9	P31274	260 aa		12.39	□□□□□ -0.43
CTCFL-222	ENST00000609232	GNAI1	P63096	354 aa		12.39	□□□□□ -0.43
CTCFL-222	ENST00000609232	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		12.39	□□□□□ -0.43
CTCFL-222	ENST00000609232	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		12.39	□□□□□ -0.43
CTCFL-222	ENST00000609232	SBNO1	A3KN83	1393 aa		12.38	□□□□□ -0.43
CTCFL-222	ENST00000609232	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	12.38	□□□□□ -0.43
CTCFL-222	ENST00000609232	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		12.38	□□□□□ -0.43
CTCFL-222	ENST00000609232	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		12.37	□□□□□ -0.43
CTCFL-222	ENST00000609232	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		12.37	□□□□□ -0.43
CTCFL-222	ENST00000609232	GLIPR1L2	Q4G1C9	344 aa		12.37	□□□□□ -0.43
CTCFL-222	ENST00000609232	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		12.37	□□□□□ -0.43
CTCFL-222	ENST00000609232	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		12.37	□□□□□ -0.43
CTCFL-222	ENST00000609232	GC	P02774	474 aa		12.36	□□□□□ -0.43
CTCFL-222	ENST00000609232	MSH6	P52701	1360 aa		12.36	□□□□□ -0.43
CTCFL-222	ENST00000609232	USP31	Q70CQ4	1352 aa		12.36	□□□□□ -0.43
CTCFL-222	ENST00000609232	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		12.36	□□□□□ -0.43
CTCFL-222	ENST00000609232	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		12.36	□□□□□ -0.43
CTCFL-222	ENST00000609232	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	12.36	□□□□□ -0.43
CTCFL-222	ENST00000609232	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		12.36	□□□□□ -0.43
CTCFL-222	ENST00000609232	SSH2	Q76I76	1423 aa		12.36	□□□□□ -0.43
CTCFL-222	ENST00000609232	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	12.36	□□□□□ -0.43
CTCFL-222	ENST00000609232	AKAP12	Q02952	1782 aa		12.36	□□□□□ -0.43
CTCFL-222	ENST00000609232	FAM177B	A6PVY3	158 aa		12.35	□□□□□ -0.43
CTCFL-222	ENST00000609232	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		12.35	□□□□□ -0.43
CTCFL-222	ENST00000609232	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		12.35	□□□□□ -0.43
CTCFL-222	ENST00000609232	IL16	Q14005	1332 aa		12.35	□□□□□ -0.43
CTCFL-222	ENST00000609232	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
CTCFL-222	ENST00000609232	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
CTCFL-222	ENST00000609232	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
CTCFL-222	ENST00000609232	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
CTCFL-222	ENST00000609232	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
CTCFL-222	ENST00000609232	MBIP	Q9NS73	344 aa		12.34	□□□□□ -0.43
CTCFL-222	ENST00000609232	SLC4A2	P04920	1241 aa		12.34	□□□□□ -0.43
CTCFL-222	ENST00000609232	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	12.34	□□□□□ -0.43
CTCFL-222	ENST00000609232	PDE3A	Q14432	1141 aa		12.34	□□□□□ -0.43
CTCFL-222	ENST00000609232	SEC24B	O95487	1268 aa		12.34	□□□□□ -0.43
CTCFL-222	ENST00000609232	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		12.34	□□□□□ -0.43
CTCFL-222	ENST00000609232	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
CTCFL-222	ENST00000609232	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		12.34	□□□□□ -0.43
CTCFL-222	ENST00000609232	PIP4K2B	P78356	416 aa		12.33	□□□□□ -0.44
CTCFL-222	ENST00000609232	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	12.33	□□□□□ -0.44
CTCFL-222	ENST00000609232	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		12.33	□□□□□ -0.44
CTCFL-222	ENST00000609232	IFT57	Q9NWB7	429 aa		12.33	□□□□□ -0.44
CTCFL-222	ENST00000609232	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	12.33	□□□□□ -0.44
CTCFL-222	ENST00000609232	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	12.33	□□□□□ -0.44
CTCFL-222	ENST00000609232	IP6K1	Q92551	441 aa		12.33	□□□□□ -0.44
CTCFL-222	ENST00000609232	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		12.33	□□□□□ -0.44
CTCFL-222	ENST00000609232	CFAP44	Q96MT7	982 aa		12.32	□□□□□ -0.44
CTCFL-222	ENST00000609232	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	12.32	□□□□□ -0.44
CTCFL-222	ENST00000609232	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	12.32	□□□□□ -0.44
CTCFL-222	ENST00000609232	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	12.32	□□□□□ -0.44
CTCFL-222	ENST00000609232	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	12.32	□□□□□ -0.44
CTCFL-222	ENST00000609232	MS4A1	P11836	297 aa		12.32	□□□□□ -0.44
CTCFL-222	ENST00000609232	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	12.32	□□□□□ -0.44
CTCFL-222	ENST00000609232	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		12.32	□□□□□ -0.44
CTCFL-222	ENST00000609232	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		12.32	□□□□□ -0.44
CTCFL-222	ENST00000609232	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		12.32	□□□□□ -0.44
CTCFL-222	ENST00000609232	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		12.32	□□□□□ -0.44
CTCFL-222	ENST00000609232	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		12.31	□□□□□ -0.44
CTCFL-222	ENST00000609232	TRIM27	P14373	513 aa		12.31	□□□□□ -0.44
CTCFL-222	ENST00000609232	MYL6B	P14649	208 aa		12.31	□□□□□ -0.44
CTCFL-222	ENST00000609232	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		12.31	□□□□□ -0.44
CTCFL-222	ENST00000609232	NBPF4	Q96M43	638 aa		12.31	□□□□□ -0.44
CTCFL-222	ENST00000609232	SLC39A6	Q13433	755 aa		12.3	□□□□□ -0.44
CTCFL-222	ENST00000609232	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		12.3	□□□□□ -0.44
CTCFL-222	ENST00000609232	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		12.3	□□□□□ -0.44
CTCFL-222	ENST00000609232	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		12.3	□□□□□ -0.44
CTCFL-222	ENST00000609232	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	12.3	□□□□□ -0.44
CTCFL-222	ENST00000609232	GSE1	Q14687	1217 aa		12.3	□□□□□ -0.44
CTCFL-222	ENST00000609232	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		12.3	□□□□□ -0.44
CTCFL-222	ENST00000609232	ARHGEF10	O15013	1369 aa		12.29	□□□□□ -0.44
CTCFL-222	ENST00000609232	KIF16B	Q96L93	1317 aa		12.29	□□□□□ -0.44
CTCFL-222	ENST00000609232	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	12.29	□□□□□ -0.44
CTCFL-222	ENST00000609232	TRIM6-TRIM34	B2RNG4	842 aa		12.29	□□□□□ -0.44
CTCFL-222	ENST00000609232	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	12.29	□□□□□ -0.44
CTCFL-222	ENST00000609232	VAMP4	O75379	141 aa		12.28	□□□□□ -0.44
CTCFL-222	ENST00000609232	RILPL2	Q969X0	211 aa		12.28	□□□□□ -0.44
CTCFL-222	ENST00000609232	LARP6	Q9BRS8	491 aa	Known RBP	12.28	□□□□□ -0.44
CTCFL-222	ENST00000609232	SLAIN2	Q9P270	581 aa		12.28	□□□□□ -0.44
CTCFL-222	ENST00000609232	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	12.28	□□□□□ -0.44
CTCFL-222	ENST00000609232	TEF	Q10587	303 aa		12.28	□□□□□ -0.44
CTCFL-222	ENST00000609232	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	12.28	□□□□□ -0.44

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