RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602959.5

UBE2E3-213, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, human

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene UBE2E3, Length 909 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBE2E3-213	ENST00000602959	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	33	■■■□□ 2.87
UBE2E3-213	ENST00000602959	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		32.99	■■■□□ 2.87
UBE2E3-213	ENST00000602959	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	32.99	■■■□□ 2.87
UBE2E3-213	ENST00000602959	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	32.98	■■■□□ 2.87
UBE2E3-213	ENST00000602959	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		32.98	■■■□□ 2.87
UBE2E3-213	ENST00000602959	EYA1	Q99502	592 aa		32.98	■■■□□ 2.87
UBE2E3-213	ENST00000602959	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		32.97	■■■□□ 2.87
UBE2E3-213	ENST00000602959	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	32.96	■■■□□ 2.87
UBE2E3-213	ENST00000602959	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	32.96	■■■□□ 2.87
UBE2E3-213	ENST00000602959	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		32.94	■■■□□ 2.86
UBE2E3-213	ENST00000602959	PLSCR1	O15162	318 aa		32.94	■■■□□ 2.86
UBE2E3-213	ENST00000602959	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		32.94	■■■□□ 2.86
UBE2E3-213	ENST00000602959	BTAF1	O14981	1849 aa		32.93	■■■□□ 2.86
UBE2E3-213	ENST00000602959	KCNQ2	O43526	872 aa		32.92	■■■□□ 2.86
UBE2E3-213	ENST00000602959	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		32.92	■■■□□ 2.86
UBE2E3-213	ENST00000602959	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		32.91	■■■□□ 2.86
UBE2E3-213	ENST00000602959	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		32.9	■■■□□ 2.86
UBE2E3-213	ENST00000602959	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		32.9	■■■□□ 2.86
UBE2E3-213	ENST00000602959	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		32.9	■■■□□ 2.86
UBE2E3-213	ENST00000602959	MTHFS	P49914	203 aa		32.86	■■■□□ 2.85
UBE2E3-213	ENST00000602959	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	32.84	■■■□□ 2.85
UBE2E3-213	ENST00000602959	CYP27B1	O15528	508 aa		32.82	■■■□□ 2.84
UBE2E3-213	ENST00000602959	IL13	P35225	146 aa		32.82	■■■□□ 2.84
UBE2E3-213	ENST00000602959	SPG7	Q9UQ90	795 aa		32.81	■■■□□ 2.84
UBE2E3-213	ENST00000602959	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		32.8	■■■□□ 2.84
UBE2E3-213	ENST00000602959	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	32.8	■■■□□ 2.84
UBE2E3-213	ENST00000602959	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	32.79	■■■□□ 2.84
UBE2E3-213	ENST00000602959	PROM2	Q8N271	834 aa		32.79	■■■□□ 2.84
UBE2E3-213	ENST00000602959	KDR	P35968	1356 aa		32.79	■■■□□ 2.84
UBE2E3-213	ENST00000602959	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	32.78	■■■□□ 2.84
UBE2E3-213	ENST00000602959	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	32.77	■■■□□ 2.84
UBE2E3-213	ENST00000602959	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	32.76	■■■□□ 2.83
UBE2E3-213	ENST00000602959	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		32.75	■■■□□ 2.83
UBE2E3-213	ENST00000602959	TXNRD1	Q16881	649 aa		32.75	■■■□□ 2.83
UBE2E3-213	ENST00000602959	NBPF14	Q5TI25	921 aa		32.75	■■■□□ 2.83
UBE2E3-213	ENST00000602959	ITGB4	P16144	1822 aa		32.74	■■■□□ 2.83
UBE2E3-213	ENST00000602959	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	32.74	■■■□□ 2.83
UBE2E3-213	ENST00000602959	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	32.74	■■■□□ 2.83
UBE2E3-213	ENST00000602959	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		32.74	■■■□□ 2.83
UBE2E3-213	ENST00000602959	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	32.74	■■■□□ 2.83
UBE2E3-213	ENST00000602959	LY75	O60449	1722 aa		32.73	■■■□□ 2.83
UBE2E3-213	ENST00000602959	PAPPA	Q13219	1627 aa		32.71	■■■□□ 2.83
UBE2E3-213	ENST00000602959	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	32.71	■■■□□ 2.83
UBE2E3-213	ENST00000602959	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		32.71	■■■□□ 2.83
UBE2E3-213	ENST00000602959	PHKG2	P15735	406 aa		32.7	■■■□□ 2.83
UBE2E3-213	ENST00000602959	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		32.7	■■■□□ 2.83
UBE2E3-213	ENST00000602959	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	32.68	■■■□□ 2.82
UBE2E3-213	ENST00000602959	LRP5	O75197	1615 aa		32.67	■■■□□ 2.82
UBE2E3-213	ENST00000602959	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		32.67	■■■□□ 2.82
UBE2E3-213	ENST00000602959	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	32.67	■■■□□ 2.82
UBE2E3-213	ENST00000602959	PPP2R1A	P30153	589 aa		32.65	■■■□□ 2.82
UBE2E3-213	ENST00000602959	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		32.63	■■■□□ 2.81
UBE2E3-213	ENST00000602959	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	32.61	■■■□□ 2.81
UBE2E3-213	ENST00000602959	CFAP53	Q96M91	514 aa		32.61	■■■□□ 2.81
UBE2E3-213	ENST00000602959	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		32.6	■■■□□ 2.81
UBE2E3-213	ENST00000602959	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		32.6	■■■□□ 2.81
UBE2E3-213	ENST00000602959	CASZ1	Q86V15	1759 aa		32.6	■■■□□ 2.81
UBE2E3-213	ENST00000602959	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	32.59	■■■□□ 2.81
UBE2E3-213	ENST00000602959	HMOX1	P09601	288 aa		32.59	■■■□□ 2.81
UBE2E3-213	ENST00000602959	STK32B	Q9NY57	414 aa		32.58	■■■□□ 2.81
UBE2E3-213	ENST00000602959	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	32.57	■■■□□ 2.8
UBE2E3-213	ENST00000602959	DCAF5	Q96JK2	942 aa		32.57	■■■□□ 2.8
UBE2E3-213	ENST00000602959	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	32.57	■■■□□ 2.8
UBE2E3-213	ENST00000602959	SLC15A2	Q16348	729 aa		32.56	■■■□□ 2.8
UBE2E3-213	ENST00000602959	PIGB	Q92521	554 aa		32.56	■■■□□ 2.8
UBE2E3-213	ENST00000602959	PALLD	Q8WX93	1383 aa		32.56	■■■□□ 2.8
UBE2E3-213	ENST00000602959	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	32.54	■■■□□ 2.8
UBE2E3-213	ENST00000602959	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		32.54	■■■□□ 2.8
UBE2E3-213	ENST00000602959	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		32.54	■■■□□ 2.8
UBE2E3-213	ENST00000602959	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		32.54	■■■□□ 2.8
UBE2E3-213	ENST00000602959	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		32.54	■■■□□ 2.8
UBE2E3-213	ENST00000602959	C5	P01031	1676 aa		32.53	■■■□□ 2.8
UBE2E3-213	ENST00000602959	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		32.52	■■■□□ 2.8
UBE2E3-213	ENST00000602959	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	32.52	■■■□□ 2.8
UBE2E3-213	ENST00000602959	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	32.52	■■■□□ 2.8
UBE2E3-213	ENST00000602959	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		32.51	■■■□□ 2.8
UBE2E3-213	ENST00000602959	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	32.5	■■■□□ 2.79
UBE2E3-213	ENST00000602959	KCNQ4	P56696	695 aa		32.49	■■■□□ 2.79
UBE2E3-213	ENST00000602959	ZNF827	Q17R98	1081 aa		32.49	■■■□□ 2.79
UBE2E3-213	ENST00000602959	NUDC	Q9Y266	331 aa		32.49	■■■□□ 2.79
UBE2E3-213	ENST00000602959	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		32.49	■■■□□ 2.79
UBE2E3-213	ENST00000602959	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		32.48	■■■□□ 2.79
UBE2E3-213	ENST00000602959	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		32.48	■■■□□ 2.79
UBE2E3-213	ENST00000602959	AKT1S1	Q96B36	256 aa		32.48	■■■□□ 2.79
UBE2E3-213	ENST00000602959	RALBP1	Q15311	655 aa		32.46	■■■□□ 2.79
UBE2E3-213	ENST00000602959	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	32.45	■■■□□ 2.79
UBE2E3-213	ENST00000602959	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	32.44	■■■□□ 2.78
UBE2E3-213	ENST00000602959	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		32.43	■■■□□ 2.78
UBE2E3-213	ENST00000602959	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		32.43	■■■□□ 2.78
UBE2E3-213	ENST00000602959	MRC1	P22897	1456 aa		32.42	■■■□□ 2.78
UBE2E3-213	ENST00000602959	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	32.42	■■■□□ 2.78
UBE2E3-213	ENST00000602959	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		32.42	■■■□□ 2.78
UBE2E3-213	ENST00000602959	CABP4	P57796	275 aa		32.41	■■■□□ 2.78
UBE2E3-213	ENST00000602959	ATG3	Q9NT62	314 aa		32.41	■■■□□ 2.78
UBE2E3-213	ENST00000602959	C4B	P0C0L5	1744 aa		32.4	■■■□□ 2.78
UBE2E3-213	ENST00000602959	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		32.39	■■■□□ 2.78
UBE2E3-213	ENST00000602959	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	32.39	■■■□□ 2.78
UBE2E3-213	ENST00000602959	SIK1	P57059	783 aa		32.39	■■■□□ 2.78
UBE2E3-213	ENST00000602959	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	32.39	■■■□□ 2.78
UBE2E3-213	ENST00000602959	SPON1	Q9HCB6	807 aa		32.39	■■■□□ 2.78

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