RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000594708.1

SMC5-AS1-201, Transcript of SMC5 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SMC5-AS1, Length 1,818 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
SMC5-AS1-201ENST00000594708 FCHSD2O94868 740 aa26.04■■□□□ 1.76
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PRKAR2BP31323 418 aa26.04■■□□□ 1.76
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
SMC5-AS1-201ENST00000594708 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa26.04■■□□□ 1.76
SMC5-AS1-201ENST00000594708 FAM9BQ8IZU0 186 aa26.02■■□□□ 1.76
SMC5-AS1-201ENST00000594708 LRRC37A3O60309 1634 aa26.02■■□□□ 1.76
SMC5-AS1-201ENST00000594708 RGS12O14924 1447 aa26.02■■□□□ 1.76
SMC5-AS1-201ENST00000594708 DDB1Q16531 1140 aa26■■□□□ 1.75
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PHACTR3Q96KR7 559 aa26■■□□□ 1.75
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PLEKHF1Q96S99 279 aa26■■□□□ 1.75
SMC5-AS1-201ENST00000594708 BRWD3Q6RI45 1802 aa26■■□□□ 1.75
SMC5-AS1-201ENST00000594708 EXOC5O00471 708 aa26■■□□□ 1.75
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CCDC146Q8IYE0 955 aa26■■□□□ 1.75
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
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SMC5-AS1-201ENST00000594708 SHANK3Q9BYB0 1731 aa25.98■■□□□ 1.75
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TNS2Q63HR2 1409 aa25.97■■□□□ 1.75
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
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SMC5-AS1-201ENST00000594708 SPG7Q9UQ90 795 aa25.95■■□□□ 1.75
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SMC5-AS1-201ENST00000594708 PDE3BQ13370 1112 aa25.94■■□□□ 1.74
SMC5-AS1-201ENST00000594708 AMOTQ4VCS5 1084 aa25.94■■□□□ 1.74
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CYP27B1O15528 508 aa25.93■■□□□ 1.74
SMC5-AS1-201ENST00000594708 RUNDC1Q96C34 613 aa25.93■■□□□ 1.74
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa25.93■■□□□ 1.74
SMC5-AS1-201ENST00000594708 FAM182BQ5T319 152 aa25.92■■□□□ 1.74
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SMC5-AS1-201ENST00000594708 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
SMC5-AS1-201ENST00000594708 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa25.92■■□□□ 1.74
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SMC5-AS1-201ENST00000594708 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa25.91■■□□□ 1.74
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa25.91■■□□□ 1.74
SMC5-AS1-201ENST00000594708 KRT27Q7Z3Y8 459 aa25.91■■□□□ 1.74
SMC5-AS1-201ENST00000594708 EP400Q96L91 3159 aa25.9■■□□□ 1.74
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa25.89■■□□□ 1.74
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PHKG2P15735 406 aa25.88■■□□□ 1.73
SMC5-AS1-201ENST00000594708 GAS2L2Q8NHY3 880 aa25.88■■□□□ 1.73
SMC5-AS1-201ENST00000594708 IFNL2Q8IZJ0 200 aa25.87■■□□□ 1.73
SMC5-AS1-201ENST00000594708 C1orf141Q5JVX7 400 aa25.86■■□□□ 1.73
SMC5-AS1-201ENST00000594708 DLG5Q8TDM6 1919 aa25.86■■□□□ 1.73
SMC5-AS1-201ENST00000594708 APAF1O14727 1248 aa25.86■■□□□ 1.73
SMC5-AS1-201ENST00000594708 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
SMC5-AS1-201ENST00000594708 AKAP4Q5JQC9 854 aa25.85■■□□□ 1.73
SMC5-AS1-201ENST00000594708 NFE2L2Q16236 605 aa25.84■■□□□ 1.73
SMC5-AS1-201ENST00000594708 KAT6BQ8WYB5 2073 aa25.84■■□□□ 1.73
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TMPOP42166 694 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
SMC5-AS1-201ENST00000594708 NEUROD2Q15784 382 aa25.84■■□□□ 1.73
SMC5-AS1-201ENST00000594708 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa25.82■■□□□ 1.72
SMC5-AS1-201ENST00000594708 MAP3K5Q99683 1374 aa25.82■■□□□ 1.72
SMC5-AS1-201ENST00000594708 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
SMC5-AS1-201ENST00000594708 GNAT3A8MTJ3 354 aa25.81■■□□□ 1.72
SMC5-AS1-201ENST00000594708 RIPK4P57078 832 aa25.81■■□□□ 1.72
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SMC5-AS1-201ENST00000594708 ILDR2Q71H61 639 aa25.79■■□□□ 1.72
SMC5-AS1-201ENST00000594708 LGR6Q9HBX8 967 aa25.79■■□□□ 1.72
SMC5-AS1-201ENST00000594708 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
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SMC5-AS1-201ENST00000594708 DCTN1Q14203 1278 aa25.78■■□□□ 1.72
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ACSBG1Q96GR2 724 aa25.78■■□□□ 1.72
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa25.78■■□□□ 1.72
SMC5-AS1-201ENST00000594708 DCAF5Q96JK2 942 aa25.77■■□□□ 1.72
SMC5-AS1-201ENST00000594708 DOT1LQ8TEK3 1739 aa25.77■■□□□ 1.72
SMC5-AS1-201ENST00000594708 FAM196AQ6ZSG2 479 aa25.77■■□□□ 1.72
SMC5-AS1-201ENST00000594708 MCM10Q7L590 875 aa25.77■■□□□ 1.72
SMC5-AS1-201ENST00000594708 IL17REQ8NFR9 667 aa25.77■■□□□ 1.72
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SCN11AQ9UI33 1791 aa25.76■■□□□ 1.71
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SBF2Q86WG5 1849 aa25.76■■□□□ 1.71
SMC5-AS1-201ENST00000594708 RNMTO43148 476 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
SMC5-AS1-201ENST00000594708 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
SMC5-AS1-201ENST00000594708 BCL9O00512 1426 aa25.75■■□□□ 1.71
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TRIM35Q9UPQ4 493 aa25.74■■□□□ 1.71
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa25.74■■□□□ 1.71
SMC5-AS1-201ENST00000594708 KCNQ2O43526 872 aa25.74■■□□□ 1.71
SMC5-AS1-201ENST00000594708 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PTF1AQ7RTS3 328 aa25.73■■□□□ 1.71
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ITGB4P16144 1822 aa25.73■■□□□ 1.71
SMC5-AS1-201ENST00000594708 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa25.7■■□□□ 1.7
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TRIM37O94972 964 aa25.7■■□□□ 1.7
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ERVV-2B6SEH9 535 aa25.69■■□□□ 1.7
SMC5-AS1-201ENST00000594708 LMOD3Q0VAK6 560 aa25.69■■□□□ 1.7
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CABP4P57796 275 aa25.68■■□□□ 1.7
SMC5-AS1-201ENST00000594708 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa25.68■■□□□ 1.7
SMC5-AS1-201ENST00000594708 NHSQ6T4R5 1651 aa25.68■■□□□ 1.7
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SLC52A2Q9HAB3 445 aa25.67■■□□□ 1.7
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PIGBQ92521 554 aa25.66■■□□□ 1.7
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TMOD3Q9NYL9 352 aa25.66■■□□□ 1.7
SMC5-AS1-201ENST00000594708 MRC1P22897 1456 aa25.65■■□□□ 1.7
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TEFQ10587 303 aa25.65■■□□□ 1.7
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CCDC27Q2M243 656 aa25.65■■□□□ 1.7
SMC5-AS1-201ENST00000594708 WWC1Q8IX03 1113 aa25.65■■□□□ 1.7
SMC5-AS1-201ENST00000594708 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP25.65■■□□□ 1.7
SMC5-AS1-201ENST00000594708 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.7
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