RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590049.5

CAPNS1-209, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene CAPNS1, Length 592 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-209ENST00000590049 KAT6BQ8WYB5 2073 aa16.84■□□□□ 0.29
CAPNS1-209ENST00000590049 AXIN2Q9Y2T1 843 aa16.84■□□□□ 0.29
CAPNS1-209ENST00000590049 CNTNAP1P78357 1384 aa16.84■□□□□ 0.29
CAPNS1-209ENST00000590049 CCDC7Q96M83 1385 aa16.84■□□□□ 0.29
CAPNS1-209ENST00000590049 ITSN1Q15811 1721 aa16.83■□□□□ 0.28
CAPNS1-209ENST00000590049 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa16.83■□□□□ 0.28
CAPNS1-209ENST00000590049 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
CAPNS1-209ENST00000590049 PKD1L3Q7Z443 1732 aa16.82■□□□□ 0.28
CAPNS1-209ENST00000590049 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
CAPNS1-209ENST00000590049 RGL3Q3MIN7 710 aa16.82■□□□□ 0.28
CAPNS1-209ENST00000590049 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
CAPNS1-209ENST00000590049 ACEP12821 1306 aa16.81■□□□□ 0.28
CAPNS1-209ENST00000590049 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP16.81■□□□□ 0.28
CAPNS1-209ENST00000590049 COL18A1P39060 1754 aa16.8■□□□□ 0.28
CAPNS1-209ENST00000590049 RNF181Q9P0P0 153 aa16.8■□□□□ 0.28
CAPNS1-209ENST00000590049 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa16.79■□□□□ 0.28
CAPNS1-209ENST00000590049 FCHSD2O94868 740 aa16.78■□□□□ 0.28
CAPNS1-209ENST00000590049 CFAP70Q5T0N1 1121 aa16.78■□□□□ 0.28
CAPNS1-209ENST00000590049 VEGFBP49765 207 aa16.77■□□□□ 0.28
CAPNS1-209ENST00000590049 TGFB2P61812 414 aa16.77■□□□□ 0.28
CAPNS1-209ENST00000590049 LY75O60449 1722 aa16.76■□□□□ 0.27
CAPNS1-209ENST00000590049 A0A0G2JLW4 131 aa16.74■□□□□ 0.27
CAPNS1-209ENST00000590049 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
CAPNS1-209ENST00000590049 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
CAPNS1-209ENST00000590049 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa16.73■□□□□ 0.27
CAPNS1-209ENST00000590049 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
CAPNS1-209ENST00000590049 SLIT3O75094 1523 aa16.72■□□□□ 0.27
CAPNS1-209ENST00000590049 IL2RBP14784 551 aa16.72■□□□□ 0.27
CAPNS1-209ENST00000590049 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
CAPNS1-209ENST00000590049 TRAK1Q9UPV9 953 aa16.72■□□□□ 0.27
CAPNS1-209ENST00000590049 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
CAPNS1-209ENST00000590049 PLEKHG3A1L390 1219 aa16.71■□□□□ 0.27
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CAPNS1-209ENST00000590049 USP54Q70EL1 1684 aa16.71■□□□□ 0.27
CAPNS1-209ENST00000590049 QRICH2Q9H0J4 1663 aa16.7■□□□□ 0.26
CAPNS1-209ENST00000590049 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
CAPNS1-209ENST00000590049 GCC1Q96CN9 775 aa16.7■□□□□ 0.26
CAPNS1-209ENST00000590049 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
CAPNS1-209ENST00000590049 GLTPD2A6NH11 291 aa16.69■□□□□ 0.26
CAPNS1-209ENST00000590049 CCDC61Q9Y6R9 512 aa16.69■□□□□ 0.26
CAPNS1-209ENST00000590049 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa16.69■□□□□ 0.26
CAPNS1-209ENST00000590049 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa16.68■□□□□ 0.26
CAPNS1-209ENST00000590049 DLL1O00548 723 aa16.68■□□□□ 0.26
CAPNS1-209ENST00000590049 ARHGEF25Q86VW2 580 aa16.68■□□□□ 0.26
CAPNS1-209ENST00000590049 MCOLN1Q9GZU1 580 aa16.68■□□□□ 0.26
CAPNS1-209ENST00000590049 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
CAPNS1-209ENST00000590049 ERBB3P21860 1342 aa16.68■□□□□ 0.26
CAPNS1-209ENST00000590049 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
CAPNS1-209ENST00000590049 NSD2O96028 1365 aa16.66■□□□□ 0.26
CAPNS1-209ENST00000590049 KIF13BQ9NQT8 1826 aa16.66■□□□□ 0.26
CAPNS1-209ENST00000590049 DPEP1P16444 411 aa16.66■□□□□ 0.26
CAPNS1-209ENST00000590049 CHADLQ6NUI6 762 aa16.66■□□□□ 0.26
CAPNS1-209ENST00000590049 SMIM5Q71RC9 77 aa16.66■□□□□ 0.26
CAPNS1-209ENST00000590049 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
CAPNS1-209ENST00000590049 RGPD5Q99666 1765 aa16.66■□□□□ 0.26
CAPNS1-209ENST00000590049 USP47Q96K76 1375 aa16.65■□□□□ 0.26
CAPNS1-209ENST00000590049 C5P01031 1676 aa16.65■□□□□ 0.26
CAPNS1-209ENST00000590049 PHF14O94880 888 aa16.64■□□□□ 0.25
CAPNS1-209ENST00000590049 DCAF5Q96JK2 942 aa16.64■□□□□ 0.25
CAPNS1-209ENST00000590049 NLRP2Q9NX02 1062 aa16.64■□□□□ 0.25
CAPNS1-209ENST00000590049 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa16.63■□□□□ 0.25
CAPNS1-209ENST00000590049 MMP10P09238 476 aa16.63■□□□□ 0.25
CAPNS1-209ENST00000590049 AK7Q96M32 723 aa16.63■□□□□ 0.25
CAPNS1-209ENST00000590049 CDK19Q9BWU1 502 aa16.63■□□□□ 0.25
CAPNS1-209ENST00000590049 NSD3Q9BZ95 1437 aa16.62■□□□□ 0.25
CAPNS1-209ENST00000590049 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
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CAPNS1-209ENST00000590049 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
CAPNS1-209ENST00000590049 TMEM88BA6NKF7 163 aa16.61■□□□□ 0.25
CAPNS1-209ENST00000590049 AMIGO3Q86WK7 504 aa16.61■□□□□ 0.25
CAPNS1-209ENST00000590049 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
CAPNS1-209ENST00000590049 POTECB2RU33 542 aa16.6■□□□□ 0.25
CAPNS1-209ENST00000590049 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
CAPNS1-209ENST00000590049 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
CAPNS1-209ENST00000590049 KCNH5Q8NCM2 988 aa16.6■□□□□ 0.25
CAPNS1-209ENST00000590049 PIM2Q9P1W9 311 aa16.6■□□□□ 0.25
CAPNS1-209ENST00000590049 ADGRB1O14514 1584 aa16.6■□□□□ 0.25
CAPNS1-209ENST00000590049 SBF1O95248 1867 aa16.59■□□□□ 0.25
CAPNS1-209ENST00000590049 MPHOSPH9Q99550 1183 aa16.59■□□□□ 0.25
CAPNS1-209ENST00000590049 PASKQ96RG2 1323 aa16.59■□□□□ 0.25
CAPNS1-209ENST00000590049 RASSF10A6NK89 507 aa16.58■□□□□ 0.24
CAPNS1-209ENST00000590049 KCNA3P22001 575 aa16.58■□□□□ 0.24
CAPNS1-209ENST00000590049 SSFA2P28290 1259 aa16.58■□□□□ 0.24
CAPNS1-209ENST00000590049 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
CAPNS1-209ENST00000590049 DOT1LQ8TEK3 1739 aa16.58■□□□□ 0.24
CAPNS1-209ENST00000590049 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
CAPNS1-209ENST00000590049 SOX10P56693 466 aa16.57■□□□□ 0.24
CAPNS1-209ENST00000590049 DEFB115Q30KQ5 88 aa16.57■□□□□ 0.24
CAPNS1-209ENST00000590049 CCDC87Q9NVE4 849 aa16.57■□□□□ 0.24
CAPNS1-209ENST00000590049 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa16.56■□□□□ 0.24
CAPNS1-209ENST00000590049 SOX12O15370 315 aa16.56■□□□□ 0.24
CAPNS1-209ENST00000590049 DGKZQ13574 1117 aa16.56■□□□□ 0.24
CAPNS1-209ENST00000590049 LMNB1P20700 586 aa16.55■□□□□ 0.24
CAPNS1-209ENST00000590049 C4BP0C0L5 1744 aa16.55■□□□□ 0.24
CAPNS1-209ENST00000590049 CLSPNQ9HAW4 1339 aa16.54■□□□□ 0.24
CAPNS1-209ENST00000590049 DPY19L2Q6NUT2 758 aa16.54■□□□□ 0.24
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
CAPNS1-209ENST00000590049 TAF1LQ8IZX4 1826 aa16.54■□□□□ 0.24
CAPNS1-209ENST00000590049 UBR3Q6ZT12 1888 aa16.53■□□□□ 0.24
CAPNS1-209ENST00000590049 POTEIP0CG38 1075 aa16.53■□□□□ 0.24
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