RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589235.5

CIRBP-222, Transcript of cold inducible RNA binding protein, human

APPRIS ALT1 TSL 2 BASIC

Gene CIRBP, Length 1,073 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CIRBP-222	ENST00000589235	MYOM1	P52179	1685 aa		29.33	■■■□□ 2.29
CIRBP-222	ENST00000589235	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	29.32	■■■□□ 2.28
CIRBP-222	ENST00000589235	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		29.32	■■■□□ 2.28
CIRBP-222	ENST00000589235	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		29.3	■■■□□ 2.28
CIRBP-222	ENST00000589235	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	29.29	■■■□□ 2.28
CIRBP-222	ENST00000589235	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		29.29	■■■□□ 2.28
CIRBP-222	ENST00000589235	MEGF6	O75095	1541 aa		29.28	■■■□□ 2.28
CIRBP-222	ENST00000589235	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		29.26	■■■□□ 2.27
CIRBP-222	ENST00000589235	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		29.24	■■■□□ 2.27
CIRBP-222	ENST00000589235	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		29.24	■■■□□ 2.27
CIRBP-222	ENST00000589235	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		29.24	■■■□□ 2.27
CIRBP-222	ENST00000589235	ZBTB7A	O95365	584 aa		29.24	■■■□□ 2.27
CIRBP-222	ENST00000589235	PANK3	Q9H999	370 aa		29.24	■■■□□ 2.27
CIRBP-222	ENST00000589235	BTAF1	O14981	1849 aa		29.22	■■■□□ 2.27
CIRBP-222	ENST00000589235	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		29.22	■■■□□ 2.27
CIRBP-222	ENST00000589235	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	29.21	■■■□□ 2.27
CIRBP-222	ENST00000589235	MTFR1L	Q9H019	292 aa		29.21	■■■□□ 2.27
CIRBP-222	ENST00000589235	POLK	Q9UBT6	870 aa		29.21	■■■□□ 2.27
CIRBP-222	ENST00000589235	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	29.2	■■■□□ 2.26
CIRBP-222	ENST00000589235	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		29.2	■■■□□ 2.26
CIRBP-222	ENST00000589235	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		29.2	■■■□□ 2.26
CIRBP-222	ENST00000589235	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	29.19	■■■□□ 2.26
CIRBP-222	ENST00000589235	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	29.19	■■■□□ 2.26
CIRBP-222	ENST00000589235	SPG7	Q9UQ90	795 aa		29.18	■■■□□ 2.26
CIRBP-222	ENST00000589235	NSD2	O96028	1365 aa		29.17	■■■□□ 2.26
CIRBP-222	ENST00000589235	CASZ1	Q86V15	1759 aa		29.17	■■■□□ 2.26
CIRBP-222	ENST00000589235	EYA1	Q99502	592 aa		29.15	■■■□□ 2.26
CIRBP-222	ENST00000589235	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		29.15	■■■□□ 2.26
CIRBP-222	ENST00000589235	ZNF827	Q17R98	1081 aa		29.14	■■■□□ 2.26
CIRBP-222	ENST00000589235	AKT1S1	Q96B36	256 aa		29.14	■■■□□ 2.26
CIRBP-222	ENST00000589235	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	29.14	■■■□□ 2.26
CIRBP-222	ENST00000589235	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		29.13	■■■□□ 2.25
CIRBP-222	ENST00000589235	PTGER2	P43116	358 aa		29.12	■■■□□ 2.25
CIRBP-222	ENST00000589235	MORC1	Q86VD1	984 aa		29.12	■■■□□ 2.25
CIRBP-222	ENST00000589235	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		29.12	■■■□□ 2.25
CIRBP-222	ENST00000589235	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	29.12	■■■□□ 2.25	4e-13	■□□□□ 8.8
CIRBP-222	ENST00000589235	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		29.12	■■■□□ 2.25
CIRBP-222	ENST00000589235	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		29.11	■■■□□ 2.25
CIRBP-222	ENST00000589235	CYP27B1	O15528	508 aa		29.11	■■■□□ 2.25
CIRBP-222	ENST00000589235	PAPPA	Q13219	1627 aa		29.11	■■■□□ 2.25
CIRBP-222	ENST00000589235	NCAPD2	Q15021	1401 aa		29.11	■■■□□ 2.25
CIRBP-222	ENST00000589235	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		29.1	■■■□□ 2.25
CIRBP-222	ENST00000589235	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		29.09	■■■□□ 2.25
CIRBP-222	ENST00000589235	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	29.09	■■■□□ 2.25
CIRBP-222	ENST00000589235	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	29.08	■■■□□ 2.25
CIRBP-222	ENST00000589235	KCNQ4	P56696	695 aa		29.07	■■■□□ 2.24
CIRBP-222	ENST00000589235	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	29.07	■■■□□ 2.24
CIRBP-222	ENST00000589235	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	29.07	■■■□□ 2.24
CIRBP-222	ENST00000589235	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		29.05	■■■□□ 2.24
CIRBP-222	ENST00000589235	ARX	Q96QS3	562 aa		29.05	■■■□□ 2.24
CIRBP-222	ENST00000589235	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		29.04	■■■□□ 2.24
CIRBP-222	ENST00000589235	POLD1	P28340	1107 aa		29.03	■■■□□ 2.24
CIRBP-222	ENST00000589235	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		29.03	■■■□□ 2.24
CIRBP-222	ENST00000589235	PALLD	Q8WX93	1383 aa		29.02	■■■□□ 2.24
CIRBP-222	ENST00000589235	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		29.02	■■■□□ 2.24
CIRBP-222	ENST00000589235	LY75	O60449	1722 aa		29.01	■■■□□ 2.23
CIRBP-222	ENST00000589235	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	29.01	■■■□□ 2.23
CIRBP-222	ENST00000589235	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		29	■■■□□ 2.23
CIRBP-222	ENST00000589235	PHKG2	P15735	406 aa		29	■■■□□ 2.23
CIRBP-222	ENST00000589235	SYT17	Q9BSW7	474 aa		29	■■■□□ 2.23
CIRBP-222	ENST00000589235	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		29	■■■□□ 2.23
CIRBP-222	ENST00000589235	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		28.99	■■■□□ 2.23
CIRBP-222	ENST00000589235	MSH5	O43196	834 aa		28.99	■■■□□ 2.23
CIRBP-222	ENST00000589235	PIGB	Q92521	554 aa		28.99	■■■□□ 2.23
CIRBP-222	ENST00000589235	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		28.99	■■■□□ 2.23
CIRBP-222	ENST00000589235	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	28.98	■■■□□ 2.23
CIRBP-222	ENST00000589235	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		28.98	■■■□□ 2.23
CIRBP-222	ENST00000589235	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	28.97	■■■□□ 2.23
CIRBP-222	ENST00000589235	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		28.96	■■■□□ 2.23
CIRBP-222	ENST00000589235	YY1	P25490	414 aa		28.94	■■■□□ 2.22
CIRBP-222	ENST00000589235	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	28.94	■■■□□ 2.22
CIRBP-222	ENST00000589235	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		28.94	■■■□□ 2.22
CIRBP-222	ENST00000589235	MAP3K5	Q99683	1374 aa		28.91	■■■□□ 2.22
CIRBP-222	ENST00000589235	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	28.91	■■■□□ 2.22
CIRBP-222	ENST00000589235	AK7	Q96M32	723 aa		28.91	■■■□□ 2.22
CIRBP-222	ENST00000589235	DCAF5	Q96JK2	942 aa		28.9	■■■□□ 2.22
CIRBP-222	ENST00000589235	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		28.89	■■■□□ 2.22
CIRBP-222	ENST00000589235	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		28.88	■■■□□ 2.21
CIRBP-222	ENST00000589235	SIK1	P57059	783 aa		28.88	■■■□□ 2.21
CIRBP-222	ENST00000589235	KLHL34	Q8N239	644 aa		28.88	■■■□□ 2.21
CIRBP-222	ENST00000589235	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		28.87	■■■□□ 2.21
CIRBP-222	ENST00000589235	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		28.87	■■■□□ 2.21
CIRBP-222	ENST00000589235	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	28.87	■■■□□ 2.21
CIRBP-222	ENST00000589235	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		28.86	■■■□□ 2.21
CIRBP-222	ENST00000589235	IL13	P35225	146 aa		28.86	■■■□□ 2.21
CIRBP-222	ENST00000589235	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	28.85	■■■□□ 2.21
CIRBP-222	ENST00000589235	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		28.85	■■■□□ 2.21
CIRBP-222	ENST00000589235	ITGB4	P16144	1822 aa		28.85	■■■□□ 2.21
CIRBP-222	ENST00000589235	C5	P01031	1676 aa		28.84	■■■□□ 2.21
CIRBP-222	ENST00000589235	ATP6V1A	P38606	617 aa		28.84	■■■□□ 2.21
CIRBP-222	ENST00000589235	MTHFS	P49914	203 aa		28.84	■■■□□ 2.21
CIRBP-222	ENST00000589235	CABP4	P57796	275 aa		28.83	■■■□□ 2.21
CIRBP-222	ENST00000589235	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	28.83	■■■□□ 2.21
CIRBP-222	ENST00000589235	ATG3	Q9NT62	314 aa		28.83	■■■□□ 2.21
CIRBP-222	ENST00000589235	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		28.82	■■■□□ 2.2
CIRBP-222	ENST00000589235	GPR162	Q16538	588 aa		28.8	■■■□□ 2.2
CIRBP-222	ENST00000589235	KDR	P35968	1356 aa		28.79	■■■□□ 2.2
CIRBP-222	ENST00000589235	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		28.79	■■■□□ 2.2
CIRBP-222	ENST00000589235	PHF14	O94880	888 aa		28.79	■■■□□ 2.2
CIRBP-222	ENST00000589235	SSFA2	P28290	1259 aa		28.79	■■■□□ 2.2

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