RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569573.1

E2F4-213, Transcript of E2F transcription factor 4, humanhuman

TSL 3

Gene E2F4, Length 849 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4-213ENST00000569573 RGPD2P0DJD1 1756 aa35.75■■■■□ 3.31
E2F4-213ENST00000569573 FYB1O15117 783 aa35.75■■■■□ 3.31
E2F4-213ENST00000569573 SLC16A10Q8TF71 515 aa35.75■■■■□ 3.31
E2F4-213ENST00000569573 DOT1LQ8TEK3 1739 aa35.74■■■■□ 3.31
E2F4-213ENST00000569573 MEGF6O75095 1541 aa35.74■■■■□ 3.31
E2F4-213ENST00000569573 POLD1P28340 1107 aa35.74■■■■□ 3.31
E2F4-213ENST00000569573 CDCA8Q53HL2 280 aa35.74■■■■□ 3.31
E2F4-213ENST00000569573 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa35.74■■■■□ 3.31
E2F4-213ENST00000569573 KLHL34Q8N239 644 aa35.73■■■■□ 3.31
E2F4-213ENST00000569573 KCNQ4P56696 695 aa35.72■■■■□ 3.31
E2F4-213ENST00000569573 NBPF6Q5VWK0 638 aa35.72■■■■□ 3.31
E2F4-213ENST00000569573 NBPF4Q96M43 638 aa35.72■■■■□ 3.31
E2F4-213ENST00000569573 USHBP1Q8N6Y0 703 aa35.71■■■■□ 3.31
E2F4-213ENST00000569573 CGNL1Q0VF96 1302 aa35.71■■■■□ 3.31
E2F4-213ENST00000569573 MAP3K5Q99683 1374 aa35.69■■■■□ 3.3
E2F4-213ENST00000569573 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa35.69■■■■□ 3.3
E2F4-213ENST00000569573 TATP17735 454 aaPredicted RBP35.68■■■■□ 3.3
E2F4-213ENST00000569573 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP35.68■■■■□ 3.3
E2F4-213ENST00000569573 SHANK3Q9BYB0 1731 aa35.67■■■■□ 3.3
E2F4-213ENST00000569573 QSER1Q2KHR3 1735 aa35.66■■■■□ 3.3
E2F4-213ENST00000569573 NSD2O96028 1365 aa35.66■■■■□ 3.3
E2F4-213ENST00000569573 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP35.66■■■■□ 3.3
E2F4-213ENST00000569573 GPR162Q16538 588 aa35.64■■■■□ 3.3
E2F4-213ENST00000569573 LY75O60449 1722 aa35.63■■■■□ 3.29
E2F4-213ENST00000569573 MSH5O43196 834 aa35.63■■■■□ 3.29
E2F4-213ENST00000569573 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa35.63■■■■□ 3.29
E2F4-213ENST00000569573 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP35.63■■■■□ 3.29
E2F4-213ENST00000569573 INSRP06213 1382 aa35.63■■■■□ 3.29
E2F4-213ENST00000569573 FLT4P35916 1363 aa35.63■■■■□ 3.29
E2F4-213ENST00000569573 KIF20BQ96Q89 1820 aa35.62■■■■□ 3.29
E2F4-213ENST00000569573 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa35.61■■■■□ 3.29
E2F4-213ENST00000569573 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa35.61■■■■□ 3.29
E2F4-213ENST00000569573 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP35.59■■■■□ 3.29
E2F4-213ENST00000569573 KIF24Q5T7B8 1368 aa35.59■■■■□ 3.29
E2F4-213ENST00000569573 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa35.57■■■■□ 3.29
E2F4-213ENST00000569573 CHD4Q14839 1912 aa35.57■■■■□ 3.29
E2F4-213ENST00000569573 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP35.55■■■■□ 3.28
E2F4-213ENST00000569573 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP35.53■■■■□ 3.28
E2F4-213ENST00000569573 NSD3Q9BZ95 1437 aa35.53■■■■□ 3.28
E2F4-213ENST00000569573 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa35.51■■■■□ 3.28
E2F4-213ENST00000569573 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa35.51■■■■□ 3.28
E2F4-213ENST00000569573 COL24A1Q17RW2 1714 aa35.5■■■■□ 3.27
E2F4-213ENST00000569573 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP35.5■■■■□ 3.27
E2F4-213ENST00000569573 CARD14Q9BXL6 1004 aa35.5■■■■□ 3.27
E2F4-213ENST00000569573 PALLDQ8WX93 1383 aa35.49■■■■□ 3.27
E2F4-213ENST00000569573 UTRNP46939 3433 aa35.47■■■■□ 3.27
E2F4-213ENST00000569573 NLGN2Q8NFZ4 835 aa35.46■■■■□ 3.27
E2F4-213ENST00000569573 CYP27B1O15528 508 aa35.45■■■■□ 3.27
E2F4-213ENST00000569573 MSL1Q68DK7 614 aa35.45■■■■□ 3.27
E2F4-213ENST00000569573 C5P01031 1676 aa35.44■■■■□ 3.26
E2F4-213ENST00000569573 FLAD1Q8NFF5 587 aa35.44■■■■□ 3.26
E2F4-213ENST00000569573 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP35.44■■■■□ 3.26
E2F4-213ENST00000569573 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa35.43■■■■□ 3.26
E2F4-213ENST00000569573 SPG7Q9UQ90 795 aa35.43■■■■□ 3.26
E2F4-213ENST00000569573 POLR3GLQ9BT43 218 aa35.41■■■■□ 3.26
E2F4-213ENST00000569573 AK7Q96M32 723 aa35.39■■■■□ 3.26
E2F4-213ENST00000569573 WASHC2AQ641Q2 1341 aa35.37■■■■□ 3.25
E2F4-213ENST00000569573 PKD1L3Q7Z443 1732 aa35.37■■■■□ 3.25
E2F4-213ENST00000569573 GRIN3BO60391 1043 aa35.36■■■■□ 3.25
E2F4-213ENST00000569573 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa35.35■■■■□ 3.25
E2F4-213ENST00000569573 ITGB4P16144 1822 aa35.34■■■■□ 3.25
E2F4-213ENST00000569573 PIGBQ92521 554 aa35.34■■■■□ 3.25
E2F4-213ENST00000569573 TAF1LQ8IZX4 1826 aa35.34■■■■□ 3.25
E2F4-213ENST00000569573 EYA1Q99502 592 aa35.33■■■■□ 3.25
E2F4-213ENST00000569573 NCAPD2Q15021 1401 aa35.32■■■■□ 3.25
E2F4-213ENST00000569573 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP35.32■■■■□ 3.24
E2F4-213ENST00000569573 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa35.32■■■■□ 3.24
E2F4-213ENST00000569573 C1QTNF8P60827 252 aa35.31■■■■□ 3.24
E2F4-213ENST00000569573 TMOD3Q9NYL9 352 aa35.31■■■■□ 3.24
E2F4-213ENST00000569573 C4BP0C0L5 1744 aa35.31■■■■□ 3.24
E2F4-213ENST00000569573 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP35.3■■■■□ 3.24
E2F4-213ENST00000569573 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa35.3■■■■□ 3.24
E2F4-213ENST00000569573 PHF14O94880 888 aa35.3■■■■□ 3.24
E2F4-213ENST00000569573 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP35.3■■■■□ 3.243e-6■□□□□ 8.1
E2F4-213ENST00000569573 PCGF6Q9BYE7 350 aa35.3■■■■□ 3.24
E2F4-213ENST00000569573 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP35.3■■■■□ 3.24
E2F4-213ENST00000569573 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP35.29■■■■□ 3.24
E2F4-213ENST00000569573 POLKQ9UBT6 870 aa35.29■■■■□ 3.24
E2F4-213ENST00000569573 CD2APQ9Y5K6 639 aa35.29■■■■□ 3.24
E2F4-213ENST00000569573 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP35.27■■■■□ 3.24
E2F4-213ENST00000569573 IFNL2Q8IZJ0 200 aa35.27■■■■□ 3.24
E2F4-213ENST00000569573 CLSPNQ9HAW4 1339 aa35.27■■■■□ 3.24
E2F4-213ENST00000569573 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa35.26■■■■□ 3.24
E2F4-213ENST00000569573 SIK1P57059 783 aa35.26■■■■□ 3.24
E2F4-213ENST00000569573 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP35.24■■■■□ 3.23
E2F4-213ENST00000569573 PHKG2P15735 406 aa35.23■■■■□ 3.23
E2F4-213ENST00000569573 SSFA2P28290 1259 aa35.21■■■■□ 3.23
E2F4-213ENST00000569573 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP35.21■■■■□ 3.23
E2F4-213ENST00000569573 ATP6V1AP38606 617 aa35.2■■■■□ 3.23
E2F4-213ENST00000569573 AMIGO3Q86WK7 504 aa35.2■■■■□ 3.23
E2F4-213ENST00000569573 LINC00116Q8NCU8 138 aa35.2■■■■□ 3.23
E2F4-213ENST00000569573 ASAP1Q9ULH1 1129 aa35.2■■■■□ 3.23
E2F4-213ENST00000569573 SMIM5Q71RC9 77 aa35.19■■■■□ 3.22
E2F4-213ENST00000569573 UBR3Q6ZT12 1888 aa35.18■■■■□ 3.22
E2F4-213ENST00000569573 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP35.18■■■■□ 3.22
E2F4-213ENST00000569573 GNPATO15228 680 aa35.17■■■■□ 3.22
E2F4-213ENST00000569573 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP35.17■■■■□ 3.22
E2F4-213ENST00000569573 ITPK1Q13572 414 aa35.13■■■■□ 3.21
E2F4-213ENST00000569573 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa35.13■■■■□ 3.21
E2F4-213ENST00000569573 PANK3Q9H999 370 aa35.12■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 94.4 ms