RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568043.5

INO80E-212, Transcript of INO80 complex subunit E, humanhuman

TSL 2

Gene INO80E, Length 482 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80E-212ENST00000568043 CARD11Q9BXL7 1154 aa25.89■■□□□ 1.74
INO80E-212ENST00000568043 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa25.89■■□□□ 1.74
INO80E-212ENST00000568043 POLD1P28340 1107 aa25.88■■□□□ 1.73
INO80E-212ENST00000568043 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
INO80E-212ENST00000568043 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa25.88■■□□□ 1.73
INO80E-212ENST00000568043 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
INO80E-212ENST00000568043 TERF2IPQ9NYB0 399 aa25.86■■□□□ 1.73
INO80E-212ENST00000568043 MAP3K19Q56UN5 1328 aa25.86■■□□□ 1.73
INO80E-212ENST00000568043 MEGF6O75095 1541 aa25.85■■□□□ 1.73
INO80E-212ENST00000568043 CEP350Q5VT06 3117 aa25.85■■□□□ 1.73
INO80E-212ENST00000568043 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP25.84■■□□□ 1.73
INO80E-212ENST00000568043 HOXC9P31274 260 aa25.84■■□□□ 1.73
INO80E-212ENST00000568043 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
INO80E-212ENST00000568043 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
INO80E-212ENST00000568043 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
INO80E-212ENST00000568043 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
INO80E-212ENST00000568043 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
INO80E-212ENST00000568043 TESK2Q96S53 571 aa25.78■■□□□ 1.72
INO80E-212ENST00000568043 TAF1LQ8IZX4 1826 aa25.77■■□□□ 1.72
INO80E-212ENST00000568043 AMPHP49418 695 aa25.77■■□□□ 1.72
INO80E-212ENST00000568043 NBPF6Q5VWK0 638 aa25.77■■□□□ 1.72
INO80E-212ENST00000568043 COG3Q96JB2 828 aa25.77■■□□□ 1.72
INO80E-212ENST00000568043 NBPF4Q96M43 638 aa25.77■■□□□ 1.72
INO80E-212ENST00000568043 C5P01031 1676 aa25.77■■□□□ 1.72
INO80E-212ENST00000568043 MSL1Q68DK7 614 aa25.75■■□□□ 1.71
INO80E-212ENST00000568043 USHBP1Q8N6Y0 703 aa25.74■■□□□ 1.71
INO80E-212ENST00000568043 USP47Q96K76 1375 aa25.73■■□□□ 1.71
INO80E-212ENST00000568043 MSH5O43196 834 aa25.73■■□□□ 1.71
INO80E-212ENST00000568043 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
INO80E-212ENST00000568043 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
INO80E-212ENST00000568043 GRIN3BO60391 1043 aa25.71■■□□□ 1.71
INO80E-212ENST00000568043 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa25.7■■□□□ 1.7
INO80E-212ENST00000568043 ITGB4P16144 1822 aa25.7■■□□□ 1.7
INO80E-212ENST00000568043 RTL1A6NKG5 1358 aa25.69■■□□□ 1.7
INO80E-212ENST00000568043 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa25.68■■□□□ 1.7
INO80E-212ENST00000568043 FYB1O15117 783 aa25.67■■□□□ 1.7
INO80E-212ENST00000568043 AMIGO3Q86WK7 504 aa25.67■■□□□ 1.7
INO80E-212ENST00000568043 ATP10DQ9P241 1426 aa25.67■■□□□ 1.7
INO80E-212ENST00000568043 TONSLQ96HA7 1378 aa25.67■■□□□ 1.7
INO80E-212ENST00000568043 CGNL1Q0VF96 1302 aa25.66■■□□□ 1.7
INO80E-212ENST00000568043 GGNBP2Q9H3C7 697 aa25.66■■□□□ 1.7
INO80E-212ENST00000568043 IFFO2Q5TF58 517 aa25.65■■□□□ 1.7
INO80E-212ENST00000568043 CD2APQ9Y5K6 639 aa25.65■■□□□ 1.7
INO80E-212ENST00000568043 UBR3Q6ZT12 1888 aa25.65■■□□□ 1.7
INO80E-212ENST00000568043 C4BP0C0L5 1744 aa25.64■■□□□ 1.7
INO80E-212ENST00000568043 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa25.64■■□□□ 1.7
INO80E-212ENST00000568043 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa25.63■■□□□ 1.69
INO80E-212ENST00000568043 SMIM5Q71RC9 77 aa25.63■■□□□ 1.69
INO80E-212ENST00000568043 PALLDQ8WX93 1383 aa25.63■■□□□ 1.69
INO80E-212ENST00000568043 CYP27B1O15528 508 aa25.62■■□□□ 1.69
INO80E-212ENST00000568043 ADCY9O60503 1353 aa25.61■■□□□ 1.69
INO80E-212ENST00000568043 TATP17735 454 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
INO80E-212ENST00000568043 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa25.61■■□□□ 1.69
INO80E-212ENST00000568043 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
INO80E-212ENST00000568043 KIF20BQ96Q89 1820 aa25.6■■□□□ 1.69
INO80E-212ENST00000568043 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa25.6■■□□□ 1.69
INO80E-212ENST00000568043 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa25.6■■□□□ 1.69
INO80E-212ENST00000568043 INSRP06213 1382 aa25.59■■□□□ 1.69
INO80E-212ENST00000568043 PKD1L3Q7Z443 1732 aa25.59■■□□□ 1.69
INO80E-212ENST00000568043 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
INO80E-212ENST00000568043 FLAD1Q8NFF5 587 aa25.58■■□□□ 1.69
INO80E-212ENST00000568043 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
INO80E-212ENST00000568043 WWC3Q9ULE0 1092 aa25.56■■□□□ 1.68
INO80E-212ENST00000568043 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
INO80E-212ENST00000568043 PIGBQ92521 554 aa25.54■■□□□ 1.68
INO80E-212ENST00000568043 FLT4P35916 1363 aa25.54■■□□□ 1.68
INO80E-212ENST00000568043 IGSF1Q8N6C5 1336 aa25.53■■□□□ 1.68
INO80E-212ENST00000568043 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
INO80E-212ENST00000568043 PHF14O94880 888 aa25.52■■□□□ 1.68
INO80E-212ENST00000568043 AK7Q96M32 723 aa25.52■■□□□ 1.68
INO80E-212ENST00000568043 SLC24A1O60721 1099 aa25.51■■□□□ 1.67
INO80E-212ENST00000568043 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
INO80E-212ENST00000568043 NCAPD2Q15021 1401 aa25.51■■□□□ 1.67
INO80E-212ENST00000568043 KIF24Q5T7B8 1368 aa25.5■■□□□ 1.67
INO80E-212ENST00000568043 LINC00116Q8NCU8 138 aa25.5■■□□□ 1.67
INO80E-212ENST00000568043 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa25.5■■□□□ 1.67
INO80E-212ENST00000568043 HSPA6P17066 643 aa25.49■■□□□ 1.67
INO80E-212ENST00000568043 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
INO80E-212ENST00000568043 CARD14Q9BXL6 1004 aa25.48■■□□□ 1.67
INO80E-212ENST00000568043 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa25.47■■□□□ 1.67
INO80E-212ENST00000568043 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
INO80E-212ENST00000568043 TMF1P82094 1093 aa25.47■■□□□ 1.67
INO80E-212ENST00000568043 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa25.46■■□□□ 1.67
INO80E-212ENST00000568043 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa25.46■■□□□ 1.67
INO80E-212ENST00000568043 SSFA2P28290 1259 aa25.46■■□□□ 1.67
INO80E-212ENST00000568043 SIK1P57059 783 aa25.46■■□□□ 1.67
INO80E-212ENST00000568043 ITPK1Q13572 414 aa25.46■■□□□ 1.67
INO80E-212ENST00000568043 KIF13BQ9NQT8 1826 aa25.45■■□□□ 1.66
INO80E-212ENST00000568043 KIF3CO14782 793 aa25.44■■□□□ 1.66
INO80E-212ENST00000568043 ASAP1Q9ULH1 1129 aa25.44■■□□□ 1.66
INO80E-212ENST00000568043 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
INO80E-212ENST00000568043 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
INO80E-212ENST00000568043 NSD3Q9BZ95 1437 aa25.43■■□□□ 1.66
INO80E-212ENST00000568043 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.42■■□□□ 1.66
INO80E-212ENST00000568043 GNPATO15228 680 aa25.4■■□□□ 1.66
INO80E-212ENST00000568043 EYA1Q99502 592 aa25.4■■□□□ 1.66
INO80E-212ENST00000568043 SPG7Q9UQ90 795 aa25.4■■□□□ 1.66
INO80E-212ENST00000568043 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
INO80E-212ENST00000568043 ATP6V1AP38606 617 aa25.38■■□□□ 1.65
INO80E-212ENST00000568043 ATG3Q9NT62 314 aa25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.7 ms